Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q9

Pmis2, Pmis2, sperm-specific protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmis2Q497Q9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pmis2Q497Q9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pmis2Q497Q9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pmis2Q497Q9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pmis2Q497Q9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pmis2Q497Q9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pmis2Q497Q9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pmis2Q497Q9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pmis2Q497Q9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pmis2Q497Q9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pmis2Q497Q9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pmis2Q497Q9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pmis2Q497Q9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pmis2Q497Q9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pmis2Q497Q9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pmis2Q497Q9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pmis2Q497Q9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pmis2Q497Q9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pmis2Q497Q9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pmis2Q497Q9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pmis2Q497Q9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pmis2Q497Q9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pmis2Q497Q9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pmis2Q497Q9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pmis2Q497Q9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pmis2Q497Q9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pmis2Q497Q9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pmis2Q497Q9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pmis2Q497Q9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pmis2Q497Q9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pmis2Q497Q9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pmis2Q497Q9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pmis2Q497Q9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pmis2Q497Q9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pmis2Q497Q9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pmis2Q497Q9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pmis2Q497Q9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pmis2Q497Q9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pmis2Q497Q9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pmis2Q497Q9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pmis2Q497Q9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pmis2Q497Q9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pmis2Q497Q9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pmis2Q497Q9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pmis2Q497Q9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pmis2Q497Q9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pmis2Q497Q9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pmis2Q497Q9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pmis2Q497Q9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pmis2Q497Q9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pmis2Q497Q9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pmis2Q497Q9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pmis2Q497Q9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pmis2Q497Q9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pmis2Q497Q9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pmis2Q497Q9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pmis2Q497Q9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pmis2Q497Q9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pmis2Q497Q9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmis2Q497Q9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pmis2Q497Q9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pmis2Q497Q9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pmis2Q497Q9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pmis2Q497Q9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pmis2Q497Q9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pmis2Q497Q9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Pmis2Q497Q9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Pmis2Q497Q9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pmis2Q497Q9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pmis2Q497Q9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pmis2Q497Q9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pmis2Q497Q9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pmis2Q497Q9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pmis2Q497Q9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pmis2Q497Q9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pmis2Q497Q9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pmis2Q497Q9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pmis2Q497Q9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pmis2Q497Q9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pmis2Q497Q9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pmis2Q497Q9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pmis2Q497Q9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmis2Q497Q9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmis2Q497Q9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmis2Q497Q9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pmis2Q497Q9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pmis2Q497Q9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pmis2Q497Q9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pmis2Q497Q9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pmis2Q497Q9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pmis2Q497Q9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pmis2Q497Q9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pmis2Q497Q9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pmis2Q497Q9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pmis2Q497Q9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pmis2Q497Q9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pmis2Q497Q9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pmis2Q497Q9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pmis2Q497Q9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pmis2Q497Q9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms