Protein–RNA interactions for Protein: Q1HCM0

Fgfbp3, Fibroblast growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfbp3Q1HCM0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Fgfbp3Q1HCM0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fgfbp3Q1HCM0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fgfbp3Q1HCM0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fgfbp3Q1HCM0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fgfbp3Q1HCM0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgfbp3Q1HCM0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgfbp3Q1HCM0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfbp3Q1HCM0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgfbp3Q1HCM0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgfbp3Q1HCM0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgfbp3Q1HCM0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgfbp3Q1HCM0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgfbp3Q1HCM0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgfbp3Q1HCM0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgfbp3Q1HCM0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgfbp3Q1HCM0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgfbp3Q1HCM0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgfbp3Q1HCM0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fgfbp3Q1HCM0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgfbp3Q1HCM0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgfbp3Q1HCM0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgfbp3Q1HCM0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fgfbp3Q1HCM0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgfbp3Q1HCM0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgfbp3Q1HCM0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgfbp3Q1HCM0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgfbp3Q1HCM0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfbp3Q1HCM0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fgfbp3Q1HCM0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgfbp3Q1HCM0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfbp3Q1HCM0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfbp3Q1HCM0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfbp3Q1HCM0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fgfbp3Q1HCM0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgfbp3Q1HCM0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fgfbp3Q1HCM0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fgfbp3Q1HCM0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Fgfbp3Q1HCM0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fgfbp3Q1HCM0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fgfbp3Q1HCM0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Fgfbp3Q1HCM0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fgfbp3Q1HCM0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fgfbp3Q1HCM0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Fgfbp3Q1HCM0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fgfbp3Q1HCM0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fgfbp3Q1HCM0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgfbp3Q1HCM0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgfbp3Q1HCM0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fgfbp3Q1HCM0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fgfbp3Q1HCM0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgfbp3Q1HCM0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgfbp3Q1HCM0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgfbp3Q1HCM0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgfbp3Q1HCM0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Fgfbp3Q1HCM0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgfbp3Q1HCM0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgfbp3Q1HCM0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgfbp3Q1HCM0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgfbp3Q1HCM0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgfbp3Q1HCM0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgfbp3Q1HCM0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgfbp3Q1HCM0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgfbp3Q1HCM0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgfbp3Q1HCM0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgfbp3Q1HCM0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgfbp3Q1HCM0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgfbp3Q1HCM0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfbp3Q1HCM0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgfbp3Q1HCM0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgfbp3Q1HCM0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgfbp3Q1HCM0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgfbp3Q1HCM0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fgfbp3Q1HCM0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fgfbp3Q1HCM0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fgfbp3Q1HCM0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fgfbp3Q1HCM0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fgfbp3Q1HCM0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fgfbp3Q1HCM0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fgfbp3Q1HCM0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fgfbp3Q1HCM0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fgfbp3Q1HCM0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fgfbp3Q1HCM0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fgfbp3Q1HCM0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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