RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109698.8

Sh3bp1-204, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 TcraP01849 138 aa14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Uqcc3Q8K2T4 89 aa14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Igkv4-91A0A075B5L2 119 aa14.33□□□□□ -0.11
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trdv5A0A075B661 115 aa14.33□□□□□ -0.11
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ndufc2Q9CQ54 120 aa14.33□□□□□ -0.11
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Igfn1Q3KNY0 2849 aa14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nbeal2Q6ZQA0 2742 aa14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P0C913 63 aa14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tenm1Q9WTS4 2731 aa14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rpl39P62892 51 aa14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trdv2-1A0A0G2JGB9 116 aa14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Atp5lQ9CPQ8 103 aa14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rnf114Q9ET26 229 aa14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Notch3Q61982 2318 aa14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm9887F6RFI0 207 aa14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P01794 123 aa14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trappc1Q5NCF2 145 aa14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Timm17aQ9Z0V8 171 aa14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm17472A0A075B683 117 aa14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv8-12A0A0G2JDE1 119 aa14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tcrg-C1A0A075B5Z0 172 aa14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tcrg-C3L7N479 172 aa14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 CtrlQ9ER05 264 aa14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Eif4ebp1Q60876 117 aa14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 5930422O12RikQ8C4Y4 123 aa14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 F11rO88792 300 aa14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P84751 237 aa14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gpx1P11352 201 aa14.27□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Q8R092 253 aa14.27□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ndufa3Q9CQ91 84 aa14.27□□□□□ -0.12
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gata3P23772 443 aa14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Phlda3Q9WV95 125 aa14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hspg2Q05793 3707 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 FcorP0DJI6 106 aa14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P18527 97 aa14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tmem170bP86050 132 aa14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm10604Q3V0X7 143 aa14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Znf740Q6NZQ6 180 aa14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv1-5A0A0A6YWG2 117 aa14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ca1P13634 261 aa14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Scgb1b11A0A087WQJ0 93 aa14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rpl36aP83882 106 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gpha2Q925Q5 128 aa14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Higd1aQ9JLR9 95 aa14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Klk11Q9QYN3 276 aa14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hivep1Q03172 2688 aa14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 CrxO54751 299 aa14.24□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm16442D3YZG3 307 aa14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm21693J3QK27 380 aa14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slc25a20Q9Z2Z6 301 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv2-6-8A0A0A6YWY9 116 aa14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 OdaphJ3QNT8 126 aa14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tspo2Q9CRZ8 162 aa14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nsd1O88491 2588 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Defa35E9QLQ1 93 aa14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ube2d3P61079 147 aa14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ube2d2P62838 147 aa14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tmem101Q91VP7 257 aa14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv1-11A0A0A6YWI9 117 aa14.21□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 E130114P18RikF6S0S7 154 aa14.21□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Klk9Q32M27 251 aa14.21□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pmis2Q497Q9 96 aa14.21□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Stab1Q8R4Y4 2571 aa14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm11027G8JL69 66 aa14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P03985 172 aa14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gng7Q61016 68 aa14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ndufa1O35683 70 aa14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Wfdc17Q5SSJ1 76 aa14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nat8b-psE0CYC6 232 aa14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Scgb1b3J3QJY4 93 aa14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Defb10Q8R2I8 73 aa14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Spata3Q9D9T6 193 aa14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Q5BN45 167 aa14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hivep3A2A884 2348 aa14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm28044L7N1X0 119 aa14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fam19a4Q7TPG5 135 aa14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Igkv4-78A0A0A6YYE5 119 aa14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm28051J3QMA2 81 aa14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm21370Q3T9V6 190 aa14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Q9D727 114 aa14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hbb-bsA8DUK4 147 aa14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm10322F7D7I4 111 aa14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hbb-b1P02088 147 aa14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm1553Q66VB7 94 aa14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mustn1Q99JI1 82 aa14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pradc1Q9D9N8 188 aa14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pla2g1bQ9Z0Y2 146 aa14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Notch2O35516 2470 aa14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv6-7A0A0A6YWU3 119 aa14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm45521A0A1B0GRK0 198 aa14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv1-72P01751 139 aa14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P01837 106 aa14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Igkv2-137A0A0B4J1H6 120 aa14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Brd3osA0A1B0GRB6 84 aa14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Foxc1Q61572 553 aa14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 3110070M22RikQ9DAQ7 118 aa14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gnb1lQ9EQ15 326 aa14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Spink4O35679 86 aa14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ppp1r32Q148A4 427 aa14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Atxn7l1Q9CZ05 146 aa14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 134.3 ms