RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	YER189W	P40104	122 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	PAN6	P40459	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	SAP185	P40856	1058 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	MRX6	P48564	524 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	MTO1	P53070	669 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	HOP2	P53187	214 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	ORC3	P54790	616 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	UFO1	Q04511	668 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	COG4	Q06096	861 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	AFT2	Q08957	416 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	SFI1	Q12369	946 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	BIK1	P11709	440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	KAR3	P17119	729 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	ADY2	P25613	283 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	RPC25	P35718	212 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	NPR3	P38742	1146 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	RAD26	P40352	1085 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	CFD1	P40558	293 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	ALR2	P43553	858 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	SNG1	P46950	547 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	GLG2	P47011	380 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	YJR124C	P47159	448 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	YGR237C	P50089	785 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	KXD1	P53158	218 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	YTP1	P53584	459 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	VAC7	P53950	1165 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	VHS1	Q03785	461 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	FRE7	Q12333	620 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	SEC39	Q12745	709 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	MRPL8	P22353	238 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	PPH21	P23594	369 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	MIH1	P23748	554 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	APL1	P27351	700 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	KAR9	P32526	644 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	PXL1	P36166	706 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	CHS7	P38843	316 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	PRM9	P39551	298 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	PHO86	P46956	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	BET4	Q00618	327 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	RSM10	Q03201	203 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	YPR114W	Q06107	315 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	SPO75	Q07798	868 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
YNL057W	YNL057W	YAP7	Q08182	245 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	AIM39	Q08223	395 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	MNE1	P24720	663 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	SNT1	P25357	1226 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	LYP1	P32487	611 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	SMC1	P32908	1225 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	PCA1	P38360	1216 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	BCD1	P38772	366 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	DMA1	P38823	416 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	PUS2	P53167	370 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	PEX31	P53203	462 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	RKM2	Q03942	479 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	PPN1	Q04119	674 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	MCP2	Q06567	569 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	GLE1	Q12315	538 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	VPS5	Q92331	675 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	MTF2	P10849	440 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	PUT4	P15380	627 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	PMA2	P19657	947 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	SLY41	P22215	453 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	PIM1	P36775	1133 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	LYS9	P38999	446 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	CEM1	P39525	442 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	ZIM17	P42844	174 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	CIR1	P42940	261 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	NUP85	P46673	744 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	YJR115W	P47152	169 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	HXT16	P47185	567 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	PMT3	P47190	753 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	HXT15	P54854	567 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	INP2	Q03824	705 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 42.3 ms