RNA–Protein interactions for RNA: YMR159C

ATG16, Transcript of Conserved protein involved in autophagy, yeast

Gene ATG16, Length 453 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG16	YMR159C	MSH1	P25846	959 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG16	YMR159C	APM3	P38153	483 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG16	YMR159C	YHL041W	P38730	149 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG16	YMR159C	VPS8	P39702	1274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG16	YMR159C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG16	YMR159C	SAE2	P46946	345 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG16	YMR159C	COG2	P53271	262 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG16	YMR159C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG16	YMR159C	CRF1	Q04930	467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG16	YMR159C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG16	YMR159C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG16	YMR159C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG16	YMR159C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG16	YMR159C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	APN1	P22936	367 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	LTP1	P40347	161 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	CAB2	P40506	365 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	CIR1	P42940	261 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	IMA1	P53051	589 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	YML119W	Q03208	357 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	RIM13	Q03792	727 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	IOC4	Q04213	475 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	BSP1	Q06604	576 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	YDL242W	Q07746	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	POL3	P15436	1097 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	MTG2	P38860	518 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	BST1	P43571	1029 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	UBP16	Q02863	499 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	ARA2	Q04212	335 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	ORM2	Q06144	216 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	CYK3	Q07533	885 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	PDE1	P22434	369 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	SPC72	P39723	622 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	ATP23	P53722	227 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	UBX4	P54730	416 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	ATG21	Q02887	496 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	PLM2	Q04383	521 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	ICL2	Q12031	575 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	PHO81	P17442	1178 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	RIT1	P23796	513 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	SWC3	P31376	625 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	NMD5	P46970	1048 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	HIM1	Q06674	414 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	BI2	P03873	423 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	NUP1	P20676	1076 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	ACA1	P39970	489 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	TPM2	P40414	161 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	MDM10	P18409	493 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	MAK32	P23060	363 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	BEM3	P32873	1128 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	YJR008W	P47085	338 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG16	YMR159C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	ERC1	P38767	581 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	YAT1	P80235	687 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	AAT1	Q01802	451 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	GTB1	Q04924	702 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	YML053C	Q04978	212 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	RAD34	Q06665	692 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	SUL2	Q12325	893 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	FRE7	Q12333	620 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	PET122	P10355	254 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	MSM1	P22438	575 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	SIP1	P32578	815 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	PUG1	P40100	303 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	SNO3	P43544	222 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	PTP1	P25044	335 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	URK1	P27515	501 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	FTH1	P38310	465 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	BUD16	P39988	312 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	XBP1	P40489	647 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG16	YMR159C	TPO3	Q06451	622 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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