RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	PIF1	P07271	859 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	SIR1	P21691	654 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	GSY2	P27472	705 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	GDA1	P32621	518 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	APM3	P38153	483 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	LAS21	P40367	830 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	COG2	P53271	262 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	YML119W	Q03208	357 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	IOC4	Q04213	475 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	CRF1	Q04930	467 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	MSS18	P08593	268 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	AMD2	P22580	549 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	MTG2	P38860	518 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	EXO1	P39875	702 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	LTP1	P40347	161 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	YJR008W	P47085	338 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	ORM2	Q06144	216 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	AIM6	Q07716	390 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	POL3	P15436	1097 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	YHL041W	P38730	149 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	CAB2	P40506	365 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	ATP23	P53722	227 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	UBP16	Q02863	499 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	ARA2	Q04212	335 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	RAD33	Q04231	177 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	CYK3	Q07533	885 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	LCB4	Q12246	624 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YLR224W	YLR224W	PHO81	P17442	1178 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	PDE1	P22434	369 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	RIT1	P23796	513 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	MSH1	P25846	959 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	CIR1	P42940	261 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	BST1	P43571	1029 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	STP1	Q00947	519 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	AAT1	Q01802	451 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	BSP1	Q06604	576 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	HIM1	Q06674	414 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	YDL242W	Q07746	117 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	BI2	P03873	423 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	SWC3	P31376	625 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	VPS8	P39702	1274 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	SAE2	P46946	345 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	SCS3	P53012	380 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	IMA1	P53051	589 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	YNL058C	P53947	316 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	UBX4	P54730	416 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	PLM2	Q04383	521 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	HRD3	Q05787	833 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	SIP1	P32578	815 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	BEM3	P32873	1128 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	SPC72	P39723	622 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	TPM2	P40414	161 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	MPS1	P54199	764 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	ATG21	Q02887	496 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	TDA9	Q04545	1251 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	YML053C	Q04978	212 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	YPL191C	Q08930	360 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	ICL2	Q12031	575 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	PET122	P10355	254 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	BIK1	P11709	440 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	ERC1	P38767	581 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	SNO3	P43544	222 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	YPL071C	Q02864	156 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YLR224W	YLR224W	YLR111W	Q12528	110 aa		3.3	□□□□□ -1.88

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.6 ms