RNA–Protein interactions for RNA: YJL038C

LOH1, Transcript of Protein involved in outer spore wall assembly, yeast

Gene LOH1, Length 660 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LOH1	YJL038C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	COT1	P32798	439 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	YKR018C	P36114	725 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	TVP38	P36164	337 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	YRO2	P38079	344 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	ERP2	P39704	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	YEN1	P40028	759 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	MIC19	P43594	170 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	NET1	P47035	1189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	COS5	P47187	383 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	KAP114	P53067	1004 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	NCS6	P53088	359 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	SLI1	P53304	468 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	RTT102	P53330	157 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	URH1	Q04179	340 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	DON1	Q05610	365 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	IME1	P21190	360 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
LOH1	YJL038C	RPC82	P32349	654 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	EUG1	P32474	517 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	CNS1	P33313	385 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	YKL050C	P35736	922 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	YEL025C	P39991	1188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	YIL089W	P40500	205 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	YGR021W	P53212	290 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	ESBP6	P53918	673 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	VTI1	Q04338	217 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	YMR321C	Q04898	105 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	YDR278C	Q05612	105 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	ECI1	Q05871	280 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	SFH1	Q06168	426 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	NUR1	Q12066	484 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	DAL2	P25335	343 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	NPP1	P25353	742 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	SED4	P25365	1065 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	MSH1	P25846	959 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	SEC6	P32844	805 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	EAF5	P39995	279 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	IRR1	P40541	1150 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	ORC5	P50874	479 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	SCS3	P53012	380 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	JJJ1	P53863	590 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	VTC3	Q02725	835 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	COQ9	Q05779	260 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	SMC5	Q08204	1093 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	IES4	Q08561	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	RAD1	P06777	1100 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	KAR4	P25583	335 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	YUR1	P26725	428 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	MOT1	P32333	1867 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	CBF2	P32504	956 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	TFC4	P33339	1025 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	BLI1	P35727	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	YBR184W	P38299	523 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	RRT2	P38332	387 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	RCK2	P38623	610 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	VPS41	P38959	992 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	LAA1	P39526	2014 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	BRO1	P48582	844 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	YNL146W	P53906	100 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	YLR462W	O13556	202 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	CDC8	P00572	216 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	CDC42	P19073	191 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	STE5	P32917	917 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	CSG2	P35206	410 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	MRX3	P38172	270 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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