RNA–Protein interactions for RNA: YGR167W

CLC1, Transcript of Clathrin light chain, yeast

Gene CLC1, Length 702 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLC1	YGR167W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	ERG11	P10614	530 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	AMD2	P22580	549 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	SPC72	P39723	622 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	UBP16	Q02863	499 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	ATG16	Q03818	150 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	THI7	Q05998	598 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	HOT13	P36078	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	VPS8	P39702	1274 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	CAB2	P40506	365 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	OPT1	P40897	799 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	TDA10	P42938	290 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	UBX4	P54730	416 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	RAD33	Q04231	177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	COQ11	Q05892	277 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	RIT1	P23796	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	ORC2	P32833	620 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	MAM1	P40065	302 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	PHO81	P17442	1178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	ERP2	P39704	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	LAS21	P40367	830 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	YGR021W	P53212	290 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	YML122C	Q03207	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	YML053C	Q04978	212 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	NKP1	Q12493	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	NUP1	P20676	1076 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	ACA1	P39970	489 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	COG2	P53271	262 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	ARA2	Q04212	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	HRD3	Q05787	833 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	LCB4	Q12246	624 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLC1	YGR167W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	YPT53	P36019	220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	PUG1	P40100	303 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	SAE2	P46946	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	ATG21	Q02887	496 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	CYK3	Q07533	885 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	GSY2	P27472	705 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	YBR138C	P38277	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	SUL2	Q12325	893 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	APN1	P22936	367 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	CLB4	P24871	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	APD1	P38281	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	IES5	P40060	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	BST1	P43571	1029 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	IMA1	P53051	589 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	ATP23	P53722	227 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	RIM13	Q03792	727 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	PLM2	Q04383	521 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	CIA1	Q05583	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	MDM10	P18409	493 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	PDE1	P22434	369 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	MSM1	P22438	575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	MBR1	P23493	339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	SIP1	P32578	815 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	RAD26	P40352	1085 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	TAM41	P53230	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	FRE7	Q12333	620 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	PET122	P10355	254 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	DBF20	P32328	564 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	SEG1	Q04279	960 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	COG4	Q06096	861 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	BSP1	Q06604	576 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	BI2	P03873	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	BIK1	P11709	440 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	ERC1	P38767	581 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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