RNA–Protein interactions for RNA: YDR297W

SUR2, Transcript of Sphinganine C4-hydroxylase, yeast

Gene SUR2, Length 1,050 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SUR2	YDR297W	PPT1	P53043	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	VPS9	P54787	451 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	KIN4	Q01919	800 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	MCP2	Q06567	569 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	GAS5	Q08193	484 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	IDI1	P15496	288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	HOP1	P20050	605 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	MAK31	P23059	88 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	NPP1	P25353	742 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	OCA4	P25366	362 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	SSO1	P32867	290 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	BEM3	P32873	1128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	MRP4	P32902	394 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	MRPL36	P36531	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	PEX32	P38292	413 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	CSM2	P40465	213 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	NEO1	P40527	1151 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	ZIM17	P42844	174 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	BNA2	P47125	453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	NPY1	P53164	384 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	LSB1	P53281	241 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	NSG2	P53898	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	TEP1	P53916	434 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	HDA1	P53973	706 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	GTR1	Q00582	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	TAF11	Q04226	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	SLP1	Q12232	587 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	PTC5	Q12511	572 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	SEC39	Q12745	709 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	MYO1	P08964	1928 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	MLS1	P30952	554 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	NPL6	P32832	435 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	SLC1	P33333	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	MRPL10	P36520	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	YER130C	P39959	443 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	SMK1	P41808	388 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	ASK10	P48361	1146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	YPT11	P48559	417 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	UBP15	P50101	1230 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	GUP1	P53154	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	YGR067C	P53243	804 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	INP2	Q03824	705 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	PHO92	Q06390	306 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	VHS3	Q08438	674 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	MET7	Q08645	548 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	APM4	Q99186	491 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUR2	YDR297W	OM45	P16547	393 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	SPO16	P17122	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	DBF4	P32325	704 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
SUR2	YDR297W	AFG2	P32794	780 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	UBP11	P36026	717 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	MCD4	P36051	919 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	ALG3	P38179	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	MSR1	P38714	643 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	PNT1	P38969	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	UME6	P39001	836 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	PKP1	P40530	394 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUR2	YDR297W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63

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