RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.39□□□□□ -1.87
CS-208ENST00000547298 SNURFQ9Y675 71 aa3.39□□□□□ -1.87
CS-208ENST00000547298 KRTAP12-3P60328 96 aa3.37□□□□□ -1.87
CS-208ENST00000547298 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.37□□□□□ -1.87
CS-208ENST00000547298 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.37□□□□□ -1.87
CS-208ENST00000547298 ACYP2P14621 99 aa3.35□□□□□ -1.87
CS-208ENST00000547298 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.35□□□□□ -1.87
CS-208ENST00000547298 KRTAP12-1P59990 96 aa3.34□□□□□ -1.87
CS-208ENST00000547298 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.34□□□□□ -1.87
CS-208ENST00000547298 MT1AP04731 61 aa3.32□□□□□ -1.88
CS-208ENST00000547298 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.32□□□□□ -1.88
CS-208ENST00000547298 SERP2Q8N6R1 65 aa3.29□□□□□ -1.88
CS-208ENST00000547298 TNP1P09430 55 aa3.27□□□□□ -1.89
CS-208ENST00000547298 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.27□□□□□ -1.89
CS-208ENST00000547298 SMIM20Q8N5G0 67 aa3.26□□□□□ -1.89
CS-208ENST00000547298 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.24□□□□□ -1.89
CS-208ENST00000547298 COX7CP15954 63 aa3.24□□□□□ -1.89
CS-208ENST00000547298 CCDC179H3BU77 68 aa3.23□□□□□ -1.89
CS-208ENST00000547298 H7BZZ5 65 aa3.21□□□□□ -1.9
CS-208ENST00000547298 ANAPC13Q9BS18 74 aa3.19□□□□□ -1.9
CS-208ENST00000547298 COA5Q86WW8 74 aa3.18□□□□□ -1.9
CS-208ENST00000547298 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.18□□□□□ -1.9
CS-208ENST00000547298 PCP4P48539 62 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-208ENST00000547298 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.1□□□□□ -1.91
CS-208ENST00000547298 A0A1B0GU33 70 aa3.07□□□□□ -1.92
CS-208ENST00000547298 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.06□□□□□ -1.92
CS-208ENST00000547298 MT3P25713 68 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-208ENST00000547298 A8MU10 97 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-208ENST00000547298 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.02□□□□□ -1.93
CS-208ENST00000547298 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.01□□□□□ -1.93
CS-208ENST00000547298 SEC61GP60059 68 aa3□□□□□ -1.93
CS-208ENST00000547298 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.99□□□□□ -1.93
CS-208ENST00000547298 TMEM258P61165 79 aa2.97□□□□□ -1.93
CS-208ENST00000547298 LCE1EQ5T753 118 aa2.96□□□□□ -1.94
CS-208ENST00000547298 SMIM26A0A096LP01 95 aa2.95□□□□□ -1.94
CS-208ENST00000547298 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
CS-208ENST00000547298 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa2.94□□□□□ -1.94
CS-208ENST00000547298 A0A1B0GU69 56 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-208ENST00000547298 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.91□□□□□ -1.94
CS-208ENST00000547298 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.91□□□□□ -1.94
CS-208ENST00000547298 PRR15LQ9BU68 103 aa2.88□□□□□ -1.95
CS-208ENST00000547298 RPS28P62857 69 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
CS-208ENST00000547298 PSPHP1O15172 72 aa2.84□□□□□ -1.95
CS-208ENST00000547298 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.84□□□□□ -1.95
CS-208ENST00000547298 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.82□□□□□ -1.96
CS-208ENST00000547298 Q1T7F1 81 aa2.77□□□□□ -1.97
CS-208ENST00000547298 LCE1CQ5T751 118 aa2.76□□□□□ -1.97
CS-208ENST00000547298 UQCR11O14957 56 aa2.75□□□□□ -1.97
CS-208ENST00000547298 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.75□□□□□ -1.97
CS-208ENST00000547298 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.73□□□□□ -1.97
CS-208ENST00000547298 KRTAP23-1A1A580 65 aa2.71□□□□□ -1.98
CS-208ENST00000547298 V9GYY9 64 aa2.69□□□□□ -1.98
CS-208ENST00000547298 A6NED7 52 aa2.68□□□□□ -1.98
CS-208ENST00000547298 PHGR1C9JFL3 82 aa2.68□□□□□ -1.98
CS-208ENST00000547298 SVIPQ8NHG7 77 aa2.68□□□□□ -1.98
CS-208ENST00000547298 LCE1FQ5T754 118 aa2.61□□□□□ -1.99
CS-208ENST00000547298 PRO0628Q9UI54 55 aa2.58□□□□□ -2
CS-208ENST00000547298 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.57□□□□□ -2
CS-208ENST00000547298 K7ERS5 55 aa2.53□□□□□ -2
CS-208ENST00000547298 ROMO1P60602 79 aa2.51□□□□□ -2.01
CS-208ENST00000547298 BRK1Q8WUW1 75 aa2.51□□□□□ -2.01
CS-208ENST00000547298 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CS-208ENST00000547298 PMAIP1Q13794 54 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-208ENST00000547298 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.35□□□□□ -2.03
CS-208ENST00000547298 PRAC1Q96KF2 57 aa2.33□□□□□ -2.04
CS-208ENST00000547298 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.25□□□□□ -2.05
CS-208ENST00000547298 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.18□□□□□ -2.06
CS-208ENST00000547298 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.14□□□□□ -2.07
CS-208ENST00000547298 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.05□□□□□ -2.08
CS-208ENST00000547298 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.03□□□□□ -2.08
CS-208ENST00000547298 LUZP6Q538Z0 58 aa1.89□□□□□ -2.11
CS-208ENST00000547298 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.83□□□□□ -2.12
CS-208ENST00000547298 NDUFAF8A1L188 74 aa1.82□□□□□ -2.12
CS-208ENST00000547298 H3BS24 57 aa1.82□□□□□ -2.12
CS-208ENST00000547298 A0A0A0MQY5 61 aa1.75□□□□□ -2.13
CS-208ENST00000547298 INE1O15225 51 aa1.63□□□□□ -2.15
CS-208ENST00000547298 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.55□□□□□ -2.16
CS-208ENST00000547298 PRM1P04553 51 aa1.36□□□□□ -2.19
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