RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.5■■■□□ 2.31
CS-208ENST00000547298 ABCC9O60706 1549 aa27.48■■□□□ 1.99
CS-208ENST00000547298 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.69■■□□□ 1.86
CS-208ENST00000547298 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.58■■□□□ 1.85
CS-208ENST00000547298 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.77■■□□□ 1.72
CS-208ENST00000547298 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.52■■□□□ 1.682e-8■■■□□ 14.8
CS-208ENST00000547298 NACADO15069 1562 aa25.44■■□□□ 1.66
CS-208ENST00000547298 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.2■■□□□ 1.63
CS-208ENST00000547298 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.17■■□□□ 1.62
CS-208ENST00000547298 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.14■■□□□ 1.62
CS-208ENST00000547298 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.9■■□□□ 1.58
CS-208ENST00000547298 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.87■■□□□ 1.57
CS-208ENST00000547298 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.83■■□□□ 1.56
CS-208ENST00000547298 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.78■■□□□ 1.56
CS-208ENST00000547298 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.65■■□□□ 1.54
CS-208ENST00000547298 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CS-208ENST00000547298 SCRIBQ14160 1630 aa24.31■■□□□ 1.48
CS-208ENST00000547298 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.3■■□□□ 1.48
CS-208ENST00000547298 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CS-208ENST00000547298 CUX2O14529 1486 aa23.96■■□□□ 1.43
CS-208ENST00000547298 ERCC6Q03468 1493 aa23.7■■□□□ 1.38
CS-208ENST00000547298 NCAPD3P42695 1498 aa23.57■■□□□ 1.36
CS-208ENST00000547298 NESP48681 1621 aa23.44■■□□□ 1.34
CS-208ENST00000547298 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.39■■□□□ 1.34
CS-208ENST00000547298 TRIM41Q8WV44 630 aa23.39■■□□□ 1.33
CS-208ENST00000547298 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CS-208ENST00000547298 HMGXB3Q12766 1538 aa23.27■■□□□ 1.32
CS-208ENST00000547298 SMARCA2P51531 1590 aa23.2■■□□□ 1.3
CS-208ENST00000547298 SMARCA4P51532 1647 aa23.12■■□□□ 1.29
CS-208ENST00000547298 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.08■■□□□ 1.29
CS-208ENST00000547298 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CS-208ENST00000547298 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.03■■□□□ 1.28
CS-208ENST00000547298 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.97■■□□□ 1.27
CS-208ENST00000547298 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.94■■□□□ 1.26
CS-208ENST00000547298 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CS-208ENST00000547298 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.84■■□□□ 1.25
CS-208ENST00000547298 WDR62O43379 1518 aa22.82■■□□□ 1.24
CS-208ENST00000547298 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.8■■□□□ 1.24
CS-208ENST00000547298 OSCARQ8IYS5 282 aa22.76■■□□□ 1.23
CS-208ENST00000547298 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.75■■□□□ 1.23
CS-208ENST00000547298 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.58■■□□□ 1.2
CS-208ENST00000547298 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.54■■□□□ 1.2
CS-208ENST00000547298 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.54■■□□□ 1.2
CS-208ENST00000547298 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.54■■□□□ 1.2
CS-208ENST00000547298 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.52■■□□□ 1.2
CS-208ENST00000547298 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CS-208ENST00000547298 ARHGEF11O15085 1522 aa22.41■■□□□ 1.18
CS-208ENST00000547298 CFTRP13569 1480 aa22.4■■□□□ 1.18
CS-208ENST00000547298 WIZO95785 1651 aa22.39■■□□□ 1.17
CS-208ENST00000547298 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-208ENST00000547298 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CS-208ENST00000547298 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CS-208ENST00000547298 ARAP1Q96P48 1450 aa22.17■■□□□ 1.14
CS-208ENST00000547298 IFT140Q96RY7 1462 aa22.17■■□□□ 1.14
CS-208ENST00000547298 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CS-208ENST00000547298 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CS-208ENST00000547298 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CS-208ENST00000547298 TOPBP1Q92547 1522 aa22.02■■□□□ 1.12
CS-208ENST00000547298 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CS-208ENST00000547298 CHD1O14646 1710 aa21.98■■□□□ 1.11
CS-208ENST00000547298 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.112e-12■■■■□ 25.6
CS-208ENST00000547298 PRDM2Q13029 1718 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-208ENST00000547298 FBLN2P98095 1184 aa21.89■■□□□ 1.09
CS-208ENST00000547298 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CS-208ENST00000547298 ABCC8Q09428 1581 aa21.86■■□□□ 1.09
CS-208ENST00000547298 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.84■■□□□ 1.09
CS-208ENST00000547298 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.84■■□□□ 1.09
CS-208ENST00000547298 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.8■■□□□ 1.08
CS-208ENST00000547298 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CS-208ENST00000547298 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CS-208ENST00000547298 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.71■■□□□ 1.07
CS-208ENST00000547298 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.69■■□□□ 1.06
CS-208ENST00000547298 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CS-208ENST00000547298 SOGA1O94964 1423 aa21.63■■□□□ 1.05
CS-208ENST00000547298 SYNJ1O43426 1573 aa21.62■■□□□ 1.05
CS-208ENST00000547298 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.58■■□□□ 1.05
CS-208ENST00000547298 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
CS-208ENST00000547298 WDR97A6NE52 1622 aa21.54■■□□□ 1.04
CS-208ENST00000547298 SYNJ2O15056 1496 aa21.53■■□□□ 1.04
CS-208ENST00000547298 GRIN2BQ13224 1484 aa21.51■■□□□ 1.03
CS-208ENST00000547298 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.5■■□□□ 1.03
CS-208ENST00000547298 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.44■■□□□ 1.02
CS-208ENST00000547298 CUX1P39880 1505 aa21.39■■□□□ 1.02
CS-208ENST00000547298 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
CS-208ENST00000547298 PBRM1Q86U86 1689 aa21.31■■□□□ 1
CS-208ENST00000547298 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.29■■□□□ 1
CS-208ENST00000547298 CEP170Q5SW79 1584 aa21.27■■□□□ 1
CS-208ENST00000547298 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.26■□□□□ 0.99
CS-208ENST00000547298 NUP160Q12769 1436 aa21.24■□□□□ 0.99
CS-208ENST00000547298 GRIN2AQ12879 1464 aa21.24■□□□□ 0.99
CS-208ENST00000547298 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.23■□□□□ 0.99
CS-208ENST00000547298 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.22■□□□□ 0.99
CS-208ENST00000547298 SHROOM2Q13796 1616 aa21.19■□□□□ 0.98
CS-208ENST00000547298 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.13■□□□□ 0.97
CS-208ENST00000547298 ADAMTS12P58397 1594 aa21.12■□□□□ 0.97
CS-208ENST00000547298 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.12■□□□□ 0.97
CS-208ENST00000547298 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
CS-208ENST00000547298 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.04■□□□□ 0.96
CS-208ENST00000547298 DIP2BQ9P265 1576 aa21.03■□□□□ 0.96
CS-208ENST00000547298 MAPKBP1O60336 1514 aa21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.5 ms