RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531092.5

GMDS-AS1-208, humanhuman

TSL 3

Gene GMDS-AS1, Length 744 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.93□□□□□ -1.62
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MT1EP04732 61 aa4.9□□□□□ -1.63
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.9□□□□□ -1.63
GMDS-AS1-208ENST00000531092 UQCR11O14957 56 aa4.8□□□□□ -1.64
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MT1GP13640 62 aa4.78□□□□□ -1.64
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PSPHP1O15172 72 aa4.74□□□□□ -1.65
GMDS-AS1-208ENST00000531092 V9GYY9 64 aa4.74□□□□□ -1.65
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.73□□□□□ -1.65
GMDS-AS1-208ENST00000531092 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.73□□□□□ -1.65
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PCP4P48539 62 aa4.71□□□□□ -1.66
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PP632Q6XCG6 107 aa4.71□□□□□ -1.66
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MT1MQ8N339 61 aa4.71□□□□□ -1.66
GMDS-AS1-208ENST00000531092 Q1T7F1 81 aa4.7□□□□□ -1.66
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TNP1P09430 55 aa4.69□□□□□ -1.66
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.66□□□□□ -1.66
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.66□□□□□ -1.66
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.65□□□□□ -1.67
GMDS-AS1-208ENST00000531092 LCE3AQ5TA76 89 aa4.63□□□□□ -1.67
GMDS-AS1-208ENST00000531092 K7ERS5 55 aa4.61□□□□□ -1.67
GMDS-AS1-208ENST00000531092 A6NED7 52 aa4.59□□□□□ -1.67
GMDS-AS1-208ENST00000531092 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MT1LQ93083 61 aa4.56□□□□□ -1.68
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MUC5ACP98088 5654 aa4.5□□□□□ -1.69
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.48□□□□□ -1.69
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP12-3P60328 96 aa4.44□□□□□ -1.7
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.42□□□□□ -1.7
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP12-4P60329 112 aa4.4□□□□□ -1.71
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.39□□□□□ -1.71
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP5-8O75690 187 aa4.34□□□□□ -1.71
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.34□□□□□ -1.71
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ROMO1P60602 79 aa4.32□□□□□ -1.72
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.27□□□□□ -1.73
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.19□□□□□ -1.74
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.18□□□□□ -1.74
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.16□□□□□ -1.74
GMDS-AS1-208ENST00000531092 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.14□□□□□ -1.75
GMDS-AS1-208ENST00000531092 BRK1Q8WUW1 75 aa4.11□□□□□ -1.75
GMDS-AS1-208ENST00000531092 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.11□□□□□ -1.75
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.1□□□□□ -1.75
GMDS-AS1-208ENST00000531092 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.08□□□□□ -1.76
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.9□□□□□ -1.79
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.88□□□□□ -1.79
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.86□□□□□ -1.79
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MT1AP04731 61 aa3.86□□□□□ -1.79
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.86□□□□□ -1.79
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.85□□□□□ -1.79
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PMAIP1Q13794 54 aa3.84□□□□□ -1.79
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PRAC1Q96KF2 57 aa3.72□□□□□ -1.81
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PRO0628Q9UI54 55 aa3.65□□□□□ -1.83
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MT3P25713 68 aa3.55□□□□□ -1.84
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.49□□□□□ -1.85
GMDS-AS1-208ENST00000531092 LCE1EQ5T753 118 aa3.44□□□□□ -1.86
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SVIPQ8NHG7 77 aa3.4□□□□□ -1.87
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.35□□□□□ -1.87
GMDS-AS1-208ENST00000531092 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.29□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.27□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-208ENST00000531092 LCE1CQ5T751 118 aa3.19□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.12□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-208ENST00000531092 LUZP6Q538Z0 58 aa3.09□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PHGR1C9JFL3 82 aa3.08□□□□□ -1.92
GMDS-AS1-208ENST00000531092 LCE1FQ5T754 118 aa3.02□□□□□ -1.93
GMDS-AS1-208ENST00000531092 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.97□□□□□ -1.93
GMDS-AS1-208ENST00000531092 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.83□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NDUFAF8A1L188 74 aa2.62□□□□□ -1.99
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.6□□□□□ -1.99
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.59□□□□□ -1.99
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.48□□□□□ -2.01
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.34□□□□□ -2.03
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PRM1P04553 51 aa2.25□□□□□ -2.05
GMDS-AS1-208ENST00000531092 A0A0A0MQY5 61 aa2.11□□□□□ -2.07
GMDS-AS1-208ENST00000531092 INE1O15225 51 aa2.08□□□□□ -2.08
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.79□□□□□ -2.12
GMDS-AS1-208ENST00000531092 H3BS24 57 aa1.53□□□□□ -2.16
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.8 ms