RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531092.5

GMDS-AS1-208, humanhuman

TSL 3

Gene GMDS-AS1, Length 744 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.02■■■■□ 3.04
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GMDS-AS1-208ENST00000531092 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.83■■■□□ 2.53
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.47■■■□□ 2.47
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.73■■■□□ 2.35
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NACADO15069 1562 aa29.35■■■□□ 2.29
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.35■■■□□ 2.29
GMDS-AS1-208ENST00000531092 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.08■■■□□ 2.25
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.02■■■□□ 2.24
GMDS-AS1-208ENST00000531092 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.96■■■□□ 2.23
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.7■■■□□ 2.19
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.58■■■□□ 2.17
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.53■■■□□ 2.16
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.51■■■□□ 2.15
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.42■■■□□ 2.14
GMDS-AS1-208ENST00000531092 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SCRIBQ14160 1630 aa28.05■■■□□ 2.08
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.04■■■□□ 2.08
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CUX2O14529 1486 aa27.57■■■□□ 2
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ERCC6Q03468 1493 aa27.32■■□□□ 1.96
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NCAPD3P42695 1498 aa27.14■■□□□ 1.94
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NESP48681 1621 aa26.98■■□□□ 1.91
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.94■■□□□ 1.9
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TRIM41Q8WV44 630 aa26.88■■□□□ 1.89
GMDS-AS1-208ENST00000531092 HMGXB3Q12766 1538 aa26.83■■□□□ 1.89
GMDS-AS1-208ENST00000531092 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SMARCA2P51531 1590 aa26.78■■□□□ 1.88
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SMARCA4P51532 1647 aa26.69■■□□□ 1.86
GMDS-AS1-208ENST00000531092 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.61■■□□□ 1.85
GMDS-AS1-208ENST00000531092 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.56■■□□□ 1.84
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.48■■□□□ 1.83
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.46■■□□□ 1.83
GMDS-AS1-208ENST00000531092 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.31■■□□□ 1.8
GMDS-AS1-208ENST00000531092 WDR62O43379 1518 aa26.29■■□□□ 1.8
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.27■■□□□ 1.8
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.22■■□□□ 1.79
GMDS-AS1-208ENST00000531092 OSCARQ8IYS5 282 aa26.2■■□□□ 1.78
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.04■■□□□ 1.76
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.96■■□□□ 1.75
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.93■■□□□ 1.74
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.93■■□□□ 1.74
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.93■■□□□ 1.74
GMDS-AS1-208ENST00000531092 WIZO95785 1651 aa25.85■■□□□ 1.73
GMDS-AS1-208ENST00000531092 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CFTRP13569 1480 aa25.81■■□□□ 1.72
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ARHGEF11O15085 1522 aa25.78■■□□□ 1.72
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.65■■□□□ 1.7
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
GMDS-AS1-208ENST00000531092 IFT140Q96RY7 1462 aa25.55■■□□□ 1.68
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ARAP1Q96P48 1450 aa25.48■■□□□ 1.67
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PRDM2Q13029 1718 aa25.41■■□□□ 1.66
GMDS-AS1-208ENST00000531092 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
GMDS-AS1-208ENST00000531092 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TOPBP1Q92547 1522 aa25.38■■□□□ 1.65
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CHD1O14646 1710 aa25.37■■□□□ 1.65
GMDS-AS1-208ENST00000531092 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ABCC8Q09428 1581 aa25.24■■□□□ 1.63
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FBLN2P98095 1184 aa25.24■■□□□ 1.63
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.2■■□□□ 1.62
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.2■■□□□ 1.62
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.09■■□□□ 1.61
GMDS-AS1-208ENST00000531092 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.02■■□□□ 1.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.99■■□□□ 1.59
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SYNJ1O43426 1573 aa24.95■■□□□ 1.58
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SOGA1O94964 1423 aa24.95■■□□□ 1.58
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
GMDS-AS1-208ENST00000531092 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.87■■□□□ 1.57
GMDS-AS1-208ENST00000531092 WDR97A6NE52 1622 aa24.86■■□□□ 1.57
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SYNJ2O15056 1496 aa24.82■■□□□ 1.56
GMDS-AS1-208ENST00000531092 GRIN2BQ13224 1484 aa24.8■■□□□ 1.56
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.8■■□□□ 1.56
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CUX1P39880 1505 aa24.67■■□□□ 1.54
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.67■■□□□ 1.54
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PBRM1Q86U86 1689 aa24.62■■□□□ 1.53
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.54■■□□□ 1.52
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CEP170Q5SW79 1584 aa24.52■■□□□ 1.52
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.5■■□□□ 1.51
GMDS-AS1-208ENST00000531092 GRIN2AQ12879 1464 aa24.49■■□□□ 1.51
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.47■■□□□ 1.51
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NUP160Q12769 1436 aa24.46■■□□□ 1.51
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SHROOM2Q13796 1616 aa24.43■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.39■■□□□ 1.49
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ADAMTS12P58397 1594 aa24.37■■□□□ 1.49
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.33■■□□□ 1.49
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.32■■□□□ 1.48
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.27■■□□□ 1.48
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DIP2BQ9P265 1576 aa24.22■■□□□ 1.47
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MAPKBP1O60336 1514 aa24.21■■□□□ 1.47
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