RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531092.5

GMDS-AS1-208, humanhuman

TSL 3

Gene GMDS-AS1, Length 744 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 188.2
GMDS-AS1-208ENST00000531092 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP13.82□□□□□ -0.28e-7■■■■■ 124.2
GMDS-AS1-208ENST00000531092 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP12.31□□□□□ -0.444e-11■■■■■ 102.5
GMDS-AS1-208ENST00000531092 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP16.4■□□□□ 0.227e-8■■■■■ 72.9
GMDS-AS1-208ENST00000531092 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.04□□□□□ -0.163e-8■■■■■ 71.2
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 62.9
GMDS-AS1-208ENST00000531092 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.28□□□□□ -0.128e-8■■■■■ 54
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP13.3□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 44.5
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP12.94□□□□□ -0.348e-8■■■■■ 41.9
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP12.09□□□□□ -0.474e-11■■■■■ 41.7
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP9.71□□□□□ -0.863e-7■■■■■ 39.7
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP13.22□□□□□ -0.295e-9■■■■■ 39.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP13.02□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 35.7
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP13.07□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 34.3
GMDS-AS1-208ENST00000531092 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.31□□□□□ -0.126e-6■■■■■ 31.4
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP12.32□□□□□ -0.443e-7■■■■■ 31.4
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP16.46■□□□□ 0.233e-7■■■■■ 31.3
GMDS-AS1-208ENST00000531092 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP11.57□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 31.2
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 30
GMDS-AS1-208ENST00000531092 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP15.54■□□□□ 0.087e-7■■■■■ 29.3
GMDS-AS1-208ENST00000531092 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP10.62□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 29.1
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.06□□□□□ -0.163e-8■■■■■ 27.2
GMDS-AS1-208ENST00000531092 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP14.34□□□□□ -0.115e-6■■■■□ 25
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP12.9□□□□□ -0.341e-5■■■■□ 24.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP13.2□□□□□ -0.31e-6■■■■□ 24.2
GMDS-AS1-208ENST00000531092 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP11.21□□□□□ -0.614e-6■■■■□ 22.1
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP12.29□□□□□ -0.447e-8■■■■□ 21.9
GMDS-AS1-208ENST00000531092 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP19.28■□□□□ 0.687e-7■■■■□ 21.7
GMDS-AS1-208ENST00000531092 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.091e-6■■■■□ 20.7
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.552e-8■■■■□ 20.4
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.848e-6■■■■□ 20.3
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.173e-6■■■■□ 20.1
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.313e-6■■■■□ 19.3
GMDS-AS1-208ENST00000531092 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP13.27□□□□□ -0.291e-6■■■□□ 18.6
GMDS-AS1-208ENST00000531092 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.919e-6■■■□□ 17.7
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP12.69□□□□□ -0.387e-8■■■□□ 17.4
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP16.14■□□□□ 0.175e-7■■■□□ 15.2
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP19.8■□□□□ 0.765e-6■■■□□ 15.1
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP11.43□□□□□ -0.583e-9■■□□□ 13.3
GMDS-AS1-208ENST00000531092 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.193e-6■■□□□ 13
GMDS-AS1-208ENST00000531092 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.551e-9■■□□□ 12.8
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP18.94■□□□□ 0.621e-6■■□□□ 12.3
GMDS-AS1-208ENST00000531092 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP13.8□□□□□ -0.28e-9■■□□□ 11.8
GMDS-AS1-208ENST00000531092 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP12.64□□□□□ -0.393e-6■□□□□ 10.7
GMDS-AS1-208ENST00000531092 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP12.14□□□□□ -0.477e-10■□□□□ 10.5
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.022e-6■□□□□ 9.4
GMDS-AS1-208ENST00000531092 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21■□□□□ 0.951e-6■□□□□ 8.7
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