RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-205ENST00000587860 RYR3Q15413 4870 aa8.2□□□□□ -1.1
CTIF-205ENST00000587860 K7ERS5 55 aa8.2□□□□□ -1.1
CTIF-205ENST00000587860 H0YAA0 97 aa8.19□□□□□ -1.1
CTIF-205ENST00000587860 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.18□□□□□ -1.1
CTIF-205ENST00000587860 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.17□□□□□ -1.1
CTIF-205ENST00000587860 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.15□□□□□ -1.1
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.13□□□□□ -1.11
CTIF-205ENST00000587860 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.07□□□□□ -1.12
CTIF-205ENST00000587860 HSPG2P98160 4391 aa8.06□□□□□ -1.12
CTIF-205ENST00000587860 Q5VSD8 79 aa8.05□□□□□ -1.12
CTIF-205ENST00000587860 A0A1B0GU33 70 aa8.02□□□□□ -1.13
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.02□□□□□ -1.13
CTIF-205ENST00000587860 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CTIF-205ENST00000587860 TNXBP22105 4242 aa7.98□□□□□ -1.13
CTIF-205ENST00000587860 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
CTIF-205ENST00000587860 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.95□□□□□ -1.14
CTIF-205ENST00000587860 RYR1P21817 5038 aa7.94□□□□□ -1.14
CTIF-205ENST00000587860 TPRXLQ17RH7 258 aa7.93□□□□□ -1.14
CTIF-205ENST00000587860 LPAP08519 4548 aa7.91□□□□□ -1.14
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.91□□□□□ -1.14
CTIF-205ENST00000587860 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.9□□□□□ -1.14
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP10-8P60410 259 aa7.89□□□□□ -1.15
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.88□□□□□ -1.15
CTIF-205ENST00000587860 LRP2P98164 4655 aa7.84□□□□□ -1.15
CTIF-205ENST00000587860 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.83□□□□□ -1.16
CTIF-205ENST00000587860 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.83□□□□□ -1.16
CTIF-205ENST00000587860 XP32Q5T750 250 aa7.79□□□□□ -1.16
CTIF-205ENST00000587860 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.78□□□□□ -1.16
CTIF-205ENST00000587860 A0A0D9SG42 100 aa7.77□□□□□ -1.17
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.76□□□□□ -1.17
CTIF-205ENST00000587860 MT1HL1P0DM35 61 aa7.75□□□□□ -1.17
CTIF-205ENST00000587860 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.65□□□□□ -1.19
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.56□□□□□ -1.2
CTIF-205ENST00000587860 S4R3F8 94 aa7.56□□□□□ -1.2
CTIF-205ENST00000587860 MUC2Q02817 5179 aa7.55□□□□□ -1.2
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.48□□□□□ -1.21
CTIF-205ENST00000587860 HERC2O95714 4834 aa7.45□□□□□ -1.22
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP12-2P59991 146 aa7.37□□□□□ -1.23
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.33□□□□□ -1.24
CTIF-205ENST00000587860 HERC1Q15751 4861 aa7.29□□□□□ -1.24
CTIF-205ENST00000587860 PLAC4Q8WY50 150 aa7.24□□□□□ -1.25
CTIF-205ENST00000587860 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.22□□□□□ -1.25
CTIF-205ENST00000587860 MUC17Q685J3 4493 aa7.2□□□□□ -1.26
CTIF-205ENST00000587860 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP12-1P59990 96 aa7.18□□□□□ -1.26
CTIF-205ENST00000587860 M0QZ58 72 aa7.15□□□□□ -1.27
CTIF-205ENST00000587860 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.14□□□□□ -1.27
CTIF-205ENST00000587860 R4GN34 69 aa7.13□□□□□ -1.27
CTIF-205ENST00000587860 RNF213Q63HN8 5207 aa7.11□□□□□ -1.27
CTIF-205ENST00000587860 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.08□□□□□ -1.28
CTIF-205ENST00000587860 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.07□□□□□ -1.28
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.97□□□□□ -1.29
CTIF-205ENST00000587860 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CTIF-205ENST00000587860 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CTIF-205ENST00000587860 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.95□□□□□ -1.3
CTIF-205ENST00000587860 LCE2CQ5TA81 110 aa6.93□□□□□ -1.3
CTIF-205ENST00000587860 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.92□□□□□ -1.3
CTIF-205ENST00000587860 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CTIF-205ENST00000587860 M0R2T5 61 aa6.71□□□□□ -1.34
CTIF-205ENST00000587860 LCE2BO14633 110 aa6.55□□□□□ -1.36
CTIF-205ENST00000587860 PP632Q6XCG6 107 aa6.53□□□□□ -1.36
CTIF-205ENST00000587860 MT1HP80294 61 aa6.51□□□□□ -1.37
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP10-10P60014 251 aa6.47□□□□□ -1.37
CTIF-205ENST00000587860 INE1O15225 51 aa6.46□□□□□ -1.38
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.45□□□□□ -1.38
CTIF-205ENST00000587860 MT1FP04733 61 aa6.43□□□□□ -1.38
CTIF-205ENST00000587860 MT2AP02795 61 aa6.38□□□□□ -1.39
CTIF-205ENST00000587860 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.36□□□□□ -1.39
CTIF-205ENST00000587860 TNP1P09430 55 aa6.34□□□□□ -1.39
CTIF-205ENST00000587860 USH2AO75445 5202 aa6.33□□□□□ -1.4
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.32□□□□□ -1.4
CTIF-205ENST00000587860 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.32□□□□□ -1.4
CTIF-205ENST00000587860 LCE3AQ5TA76 89 aa6.16□□□□□ -1.42
CTIF-205ENST00000587860 MT1BP07438 61 aa6.12□□□□□ -1.43
CTIF-205ENST00000587860 KMT2DO14686 5537 aa6.12□□□□□ -1.43
CTIF-205ENST00000587860 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.07□□□□□ -1.44
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP10-5P60370 271 aa6.05□□□□□ -1.44
CTIF-205ENST00000587860 MT1XP80297 61 aa6.05□□□□□ -1.44
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.04□□□□□ -1.44
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.02□□□□□ -1.45
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP10-12P60413 245 aa5.88□□□□□ -1.47
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP12-3P60328 96 aa5.8□□□□□ -1.48
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.79□□□□□ -1.48
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.78□□□□□ -1.48
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.78□□□□□ -1.48
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.68□□□□□ -1.5
CTIF-205ENST00000587860 SSPOA2VEC9 5147 aa5.62□□□□□ -1.51
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.54□□□□□ -1.52
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.52□□□□□ -1.53
CTIF-205ENST00000587860 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.44□□□□□ -1.54
CTIF-205ENST00000587860 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.41□□□□□ -1.54
CTIF-205ENST00000587860 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.41□□□□□ -1.54
CTIF-205ENST00000587860 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.39□□□□□ -1.55
CTIF-205ENST00000587860 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.37□□□□□ -1.55
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