RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1B0GVY2 172 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-202ENST00000586851 DNAH11Q96DT5 4516 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-202ENST00000586851 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-202ENST00000586851 PKD1P98161 4303 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-202ENST00000586851 M0QZ58 72 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-202ENST00000586851 CRIPTQ9P021 101 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP10-8P60410 259 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-202ENST00000586851 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-202ENST00000586851 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
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CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-202ENST00000586851 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.92□□□□□ -1.78
CAPNS1-202ENST00000586851 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.78
CAPNS1-202ENST00000586851 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.9□□□□□ -1.79
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CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.86□□□□□ -1.79
CAPNS1-202ENST00000586851 Q5VSD8 79 aa3.84□□□□□ -1.79
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CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.52□□□□□ -1.85
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CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-202ENST00000586851 MYCBP2O75592 4640 aa3.48□□□□□ -1.85
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CAPNS1-202ENST00000586851 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.33□□□□□ -1.88
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CAPNS1-202ENST00000586851 MUC17Q685J3 4493 aa3.27□□□□□ -1.89
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CAPNS1-202ENST00000586851 LPAP08519 4548 aa3.22□□□□□ -1.89
CAPNS1-202ENST00000586851 HERC1Q15751 4861 aa3.21□□□□□ -1.89
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.21□□□□□ -1.9
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-202ENST00000586851 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.2□□□□□ -1.9
CAPNS1-202ENST00000586851 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.19□□□□□ -1.9
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.18□□□□□ -1.9
CAPNS1-202ENST00000586851 M0R2T5 61 aa3.16□□□□□ -1.9
CAPNS1-202ENST00000586851 LCE3AQ5TA76 89 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP10-10P60014 251 aa3.1□□□□□ -1.91
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CAPNS1-202ENST00000586851 MT2AP02795 61 aa3.08□□□□□ -1.92
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP12-3P60328 96 aa3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP10-12P60413 245 aa3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-202ENST00000586851 MT1FP04733 61 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-202ENST00000586851 MUC2Q02817 5179 aa3.03□□□□□ -1.93
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP10-5P60370 271 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-202ENST00000586851 MT1XP80297 61 aa3.01□□□□□ -1.93
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