RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HERC2O95714 4834 aa8.64□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.64□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 XP32Q5T750 250 aa8.64□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa8.6□□□□□ -1.03
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.53□□□□□ -1.04
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A1B0GU33 70 aa8.44□□□□□ -1.06
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TPRXLQ17RH7 258 aa8.43□□□□□ -1.06
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MUC17Q685J3 4493 aa8.06□□□□□ -1.12
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.95□□□□□ -1.14
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 M0QZ58 72 aa7.92□□□□□ -1.14
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.85□□□□□ -1.15
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CRIPTQ9P021 101 aa7.73□□□□□ -1.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 R4GN34 69 aa7.73□□□□□ -1.17
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.63□□□□□ -1.19
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LCE2BO14633 110 aa6.5□□□□□ -1.37
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.23□□□□□ -1.41
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.16□□□□□ -1.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SSPOA2VEC9 5147 aa6.11□□□□□ -1.43
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KMT2DO14686 5537 aa6.11□□□□□ -1.43
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.09□□□□□ -1.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.09□□□□□ -1.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A0A0MQY5 61 aa6.06□□□□□ -1.44
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LCE3CQ5T5A8 94 aa6□□□□□ -1.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.98□□□□□ -1.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
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