RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557172.5

KLC1-223, Transcript of kinesin light chain 1, human

TSL 4

Gene KLC1, Length 540 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KLC1-223	ENST00000557172	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KLC1-223	ENST00000557172	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KLC1-223	ENST00000557172	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KLC1-223	ENST00000557172	C4orf26	Q17RF5	130 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KLC1-223	ENST00000557172	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KLC1-223	ENST00000557172	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KLC1-223	ENST00000557172	NDUFC1	O43677	76 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KLC1-223	ENST00000557172	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KLC1-223	ENST00000557172	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KLC1-223	ENST00000557172	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KLC1-223	ENST00000557172	FAM236C	P0DP71	79 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KLC1-223	ENST00000557172	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KLC1-223	ENST00000557172	PCP4	P48539	62 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KLC1-223	ENST00000557172	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KLC1-223	ENST00000557172		H7BZZ5	65 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KLC1-223	ENST00000557172	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KLC1-223	ENST00000557172	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KLC1-223	ENST00000557172	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KLC1-223	ENST00000557172	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KLC1-223	ENST00000557172		A8MUN3	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KLC1-223	ENST00000557172	DMAC1	Q96GE9	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KLC1-223	ENST00000557172	ACYP2	P14621	99 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KLC1-223	ENST00000557172	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KLC1-223	ENST00000557172	TMEM258	P61165	79 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KLC1-223	ENST00000557172	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KLC1-223	ENST00000557172		S4R3F8	94 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KLC1-223	ENST00000557172	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KLC1-223	ENST00000557172	MT1H	P80294	61 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KLC1-223	ENST00000557172	LCA10	Q71F78	164 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KLC1-223	ENST00000557172	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KLC1-223	ENST00000557172		M0R2T5	61 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KLC1-223	ENST00000557172	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KLC1-223	ENST00000557172	CSAG1	Q6PB30	78 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KLC1-223	ENST00000557172	COA5	Q86WW8	74 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KLC1-223	ENST00000557172	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KLC1-223	ENST00000557172	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KLC1-223	ENST00000557172	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KLC1-223	ENST00000557172	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KLC1-223	ENST00000557172	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KLC1-223	ENST00000557172	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KLC1-223	ENST00000557172	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
KLC1-223	ENST00000557172	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KLC1-223	ENST00000557172	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KLC1-223	ENST00000557172		H0YAA0	97 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KLC1-223	ENST00000557172	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KLC1-223	ENST00000557172	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KLC1-223	ENST00000557172	MT2A	P02795	61 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KLC1-223	ENST00000557172	KRTAP10-10	P60014	251 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KLC1-223	ENST00000557172	SEC61G	P60059	68 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KLC1-223	ENST00000557172	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KLC1-223	ENST00000557172	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KLC1-223	ENST00000557172	MT1F	P04733	61 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KLC1-223	ENST00000557172	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KLC1-223	ENST00000557172		V9GYY9	64 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KLC1-223	ENST00000557172		A0A1B0GU69	56 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KLC1-223	ENST00000557172		P0C880	135 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KLC1-223	ENST00000557172	PRR15L	Q9BU68	103 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KLC1-223	ENST00000557172	CRIPT	Q9P021	101 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KLC1-223	ENST00000557172		Q1T7F1	81 aa		4.48	□□□□□ -1.69
KLC1-223	ENST00000557172		A0A1B0GU33	70 aa		4.43	□□□□□ -1.7
KLC1-223	ENST00000557172		M0QZ58	72 aa		4.42	□□□□□ -1.7
KLC1-223	ENST00000557172		R4GN34	69 aa		4.42	□□□□□ -1.7
KLC1-223	ENST00000557172	PSPHP1	O15172	72 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KLC1-223	ENST00000557172	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KLC1-223	ENST00000557172		Q5VV11	94 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KLC1-223	ENST00000557172	UQCR11	O14957	56 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KLC1-223	ENST00000557172	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KLC1-223	ENST00000557172	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		4.33	□□□□□ -1.72
KLC1-223	ENST00000557172	LINC01554	Q52M75	96 aa		4.32	□□□□□ -1.72
KLC1-223	ENST00000557172	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		4.31	□□□□□ -1.72
KLC1-223	ENST00000557172	USH2A	O75445	5202 aa		4.29	□□□□□ -1.72
KLC1-223	ENST00000557172	SSPO	A2VEC9	5147 aa		4.29	□□□□□ -1.72
KLC1-223	ENST00000557172		A0A0A0MQY5	61 aa		4.29	□□□□□ -1.72
KLC1-223	ENST00000557172	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.28	□□□□□ -1.72
KLC1-223	ENST00000557172		A0A0D9SG42	100 aa		4.27	□□□□□ -1.73
KLC1-223	ENST00000557172		A6NED7	52 aa		4.27	□□□□□ -1.73
KLC1-223	ENST00000557172		A6NN06	94 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KLC1-223	ENST00000557172	MT1B	P07438	61 aa		4.25	□□□□□ -1.73
KLC1-223	ENST00000557172	PLAC4	Q8WY50	150 aa		4.25	□□□□□ -1.73
KLC1-223	ENST00000557172		A8MU10	97 aa		4.24	□□□□□ -1.73
KLC1-223	ENST00000557172	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
KLC1-223	ENST00000557172	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		4.2	□□□□□ -1.74
KLC1-223	ENST00000557172	KRTAP12-1	P59990	96 aa		4.19	□□□□□ -1.74
KLC1-223	ENST00000557172	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		4.18	□□□□□ -1.74
KLC1-223	ENST00000557172	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.17	□□□□□ -1.74
KLC1-223	ENST00000557172	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.16	□□□□□ -1.74
KLC1-223	ENST00000557172	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
KLC1-223	ENST00000557172		K7ERS5	55 aa		4.14	□□□□□ -1.75
KLC1-223	ENST00000557172	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.14	□□□□□ -1.75
KLC1-223	ENST00000557172	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
KLC1-223	ENST00000557172	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLC1-223	ENST00000557172	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KLC1-223	ENST00000557172	KRTAP10-5	P60370	271 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KLC1-223	ENST00000557172	MT1X	P80297	61 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KLC1-223	ENST00000557172	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KLC1-223	ENST00000557172	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4	□□□□□ -1.77
KLC1-223	ENST00000557172	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KLC1-223	ENST00000557172	ROMO1	P60602	79 aa		3.92	□□□□□ -1.78
KLC1-223	ENST00000557172	PRO0628	Q9UI54	55 aa		3.92	□□□□□ -1.78
KLC1-223	ENST00000557172	TNP1	P09430	55 aa		3.91	□□□□□ -1.78

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