RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

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Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRK-218ENST00000525459 NDUFC1O43677 76 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRK-218ENST00000525459 MT2AP02795 61 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRK-218ENST00000525459 ACYP2P14621 99 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP10-10P60014 251 aa8.81□□□□□ -1
PTPRK-218ENST00000525459 MT1FP04733 61 aa8.8□□□□□ -1
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.78□□□□□ -1
PTPRK-218ENST00000525459 H7BZZ5 65 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-218ENST00000525459 H0YAA0 97 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-218ENST00000525459 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-218ENST00000525459 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-218ENST00000525459 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC179H3BU77 68 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-218ENST00000525459 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-218ENST00000525459 COA5Q86WW8 74 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-218ENST00000525459 CRIPTQ9P021 101 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-218ENST00000525459 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM258P61165 79 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-218ENST00000525459 LCE2BO14633 110 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-218ENST00000525459 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-218ENST00000525459 P0C880 135 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRK-218ENST00000525459 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRK-218ENST00000525459 R4GN34 69 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-218ENST00000525459 SEC61GP60059 68 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-218ENST00000525459 Q5VV11 94 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRK-218ENST00000525459 PCP4P48539 62 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRK-218ENST00000525459 FSIP2Q5CZC0 6907 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRK-218ENST00000525459 M0QZ58 72 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-218ENST00000525459 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-218ENST00000525459 USH2AO75445 5202 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-218ENST00000525459 MT1BP07438 61 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRK-218ENST00000525459 A0A1B0GU69 56 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRK-218ENST00000525459 PRR15LQ9BU68 103 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRK-218ENST00000525459 SSPOA2VEC9 5147 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRK-218ENST00000525459 LINC01554Q52M75 96 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRK-218ENST00000525459 PLAC4Q8WY50 150 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRK-218ENST00000525459 A0A1B0GU33 70 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRK-218ENST00000525459 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRK-218ENST00000525459 A6NN06 94 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRK-218ENST00000525459 V9GYY9 64 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP10-5P60370 271 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-218ENST00000525459 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRK-218ENST00000525459 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRK-218ENST00000525459 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRK-218ENST00000525459 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRK-218ENST00000525459 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRK-218ENST00000525459 Q1T7F1 81 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRK-218ENST00000525459 A0A0D9SG42 100 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRK-218ENST00000525459 UQCR11O14957 56 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRK-218ENST00000525459 MT1XP80297 61 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
PTPRK-218ENST00000525459 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRK-218ENST00000525459 PSPHP1O15172 72 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP12-1P59990 96 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRK-218ENST00000525459 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRK-218ENST00000525459 A8MU10 97 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRK-218ENST00000525459 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP12-2P59991 146 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRK-218ENST00000525459 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRK-218ENST00000525459 A6NED7 52 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRK-218ENST00000525459 K7ERS5 55 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP10-12P60413 245 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRK-218ENST00000525459 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-218ENST00000525459 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP5-9P26371 169 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-218ENST00000525459 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-218ENST00000525459 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-218ENST00000525459 TNP1P09430 55 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-218ENST00000525459 KMT2DO14686 5537 aa7.22□□□□□ -1.25
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PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRK-218ENST00000525459 BRK1Q8WUW1 75 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRK-218ENST00000525459 ROMO1P60602 79 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRK-218ENST00000525459 LCE3AQ5TA76 89 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRK-218ENST00000525459 SPRR2EP22531 72 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRK-218ENST00000525459 SPRR2BP35325 72 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRK-218ENST00000525459 SPRR2AP35326 72 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRK-218ENST00000525459 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-218ENST00000525459 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-218ENST00000525459 MT1EP04732 61 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-218ENST00000525459 NEBP20929 6669 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRK-218ENST00000525459 MDN1Q9NU22 5596 aa6.84□□□□□ -1.31
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