RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 A6NN06 94 aa5.7□□□□□ -1.5
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RABGEF1-208ENST00000510829 TNXBP22105 4242 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-208ENST00000510829 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-208ENST00000510829 S4R3F8 94 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-208ENST00000510829 TPRXLQ17RH7 258 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-208ENST00000510829 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-208ENST00000510829 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-208ENST00000510829 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-208ENST00000510829 H0YAA0 97 aa5.59□□□□□ -1.51
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RABGEF1-208ENST00000510829 PRAC1Q96KF2 57 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A0D9SG42 100 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-208ENST00000510829 CSAG1Q6PB30 78 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-208ENST00000510829 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-208ENST00000510829 LRP2P98164 4655 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-208ENST00000510829 P0C880 135 aa5.47□□□□□ -1.53
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RABGEF1-208ENST00000510829 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-208ENST00000510829 HERC2O95714 4834 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-208ENST00000510829 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC01554Q52M75 96 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.34□□□□□ -1.55
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RABGEF1-208ENST00000510829 M0QZ58 72 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-208ENST00000510829 R4GN34 69 aa5.31□□□□□ -1.56
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RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP12-2P59991 146 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP12-1P59990 96 aa5.21□□□□□ -1.57
RABGEF1-208ENST00000510829 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
RABGEF1-208ENST00000510829 MUC17Q685J3 4493 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-208ENST00000510829 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-208ENST00000510829 M0R2T5 61 aa5.1□□□□□ -1.59
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RABGEF1-208ENST00000510829 H3BS24 57 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1-208ENST00000510829 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-208ENST00000510829 LCE2CQ5TA81 110 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP10-10P60014 251 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGEF1-208ENST00000510829 MT1HP80294 61 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1-208ENST00000510829 PLAC4Q8WY50 150 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1-208ENST00000510829 RNF213Q63HN8 5207 aa4.86□□□□□ -1.63
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RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.51□□□□□ -1.69
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RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGEF1-208ENST00000510829 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGEF1-208ENST00000510829 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.69□□□□□ -1.82
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