RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498280.1

RBM39-242, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 444 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-242ENST00000498280 PIK3C2BO00750 1634 aa-0.95□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa-0.95□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-0.95□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 IFI6P09912 130 aa-0.95□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
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RBM39-242ENST00000498280 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-0.96□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 DIP2AQ14689 1571 aa-0.96□□□□□ -2.56
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RBM39-242ENST00000498280 CCDC88BA6NC98 1476 aa-0.96□□□□□ -2.56
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RBM39-242ENST00000498280 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP-0.97□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 TTC37Q6PGP7 1564 aa-0.97□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 ALS2Q96Q42 1657 aa-0.97□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-0.97□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 TNP1P09430 55 aa-0.98□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-0.99□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 GLI2P10070 1586 aa-0.99□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa-0.99□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-0.99□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 Q9H521 79 aa-0.99□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 ERICH3Q5RHP9 1530 aa-0.99□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 SCRIBQ14160 1630 aa-1□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 KIF1AQ12756 1690 aa-1□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 CFAP43Q8NDM7 1665 aa-1□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-1□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 A8MTW9 85 aa-1□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 UMAD1C9J7I0 102 aa-1□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 CD52P31358 61 aa-1□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-1□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 V9GYS6 101 aa-1□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 ABCA6Q8N139 1617 aa-1□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 LMO7Q8WWI1 1683 aa-1□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa-1.01□□□□□ -2.57
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RBM39-242ENST00000498280 NDUFA4O00483 81 aa-1.01□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 WT1-ASQ06250 92 aa-1.01□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-1.01□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 TFF3Q07654 80 aa-1.02□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 RICTORQ6R327 1708 aa-1.02□□□□□ -2.57
RBM39-242ENST00000498280 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-1.03□□□□□ -2.57
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RBM39-242ENST00000498280 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
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RBM39-242ENST00000498280 ABCA8O94911 1581 aa-1.04□□□□□ -2.58
RBM39-242ENST00000498280 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa-1.04□□□□□ -2.58
RBM39-242ENST00000498280 CD163L1Q9NR16 1453 aa-1.04□□□□□ -2.58
RBM39-242ENST00000498280 STATHP02808 62 aa-1.04□□□□□ -2.58
RBM39-242ENST00000498280 NREPQ16612 68 aa-1.04□□□□□ -2.58
RBM39-242ENST00000498280 TDRG1Q3Y452 100 aa-1.04□□□□□ -2.58
RBM39-242ENST00000498280 A0A1B0GUL6 1792 aa-1.04□□□□□ -2.58
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RBM39-242ENST00000498280 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-1.06□□□□□ -2.58
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RBM39-242ENST00000498280 UACAQ9BZF9 1416 aa-1.06□□□□□ -2.58
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RBM39-242ENST00000498280 ABCC1P33527 1531 aa-1.15□□□□□ -2.59
RBM39-242ENST00000498280 LMTK2Q8IWU2 1503 aa-1.15□□□□□ -2.59
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RBM39-242ENST00000498280 ADIRFQ15847 76 aa-1.15□□□□□ -2.59
RBM39-242ENST00000498280 ENHOQ6UWT2 76 aa-1.15□□□□□ -2.59
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