RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.44□□□□□ -1.38
NISCH-207ENST00000479054 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.43□□□□□ -1.38
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.43□□□□□ -1.38
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.41□□□□□ -1.38
NISCH-207ENST00000479054 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.39□□□□□ -1.39
NISCH-207ENST00000479054 LYSTQ99698 3801 aa6.37□□□□□ -1.39
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.36□□□□□ -1.39
NISCH-207ENST00000479054 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.36□□□□□ -1.39
NISCH-207ENST00000479054 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.32□□□□□ -1.4
NISCH-207ENST00000479054 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.3□□□□□ -1.4
NISCH-207ENST00000479054 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
NISCH-207ENST00000479054 DNAH2Q9P225 4427 aa6.23□□□□□ -1.41
NISCH-207ENST00000479054 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.22□□□□□ -1.41
NISCH-207ENST00000479054 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.21□□□□□ -1.41
NISCH-207ENST00000479054 FAT1Q14517 4588 aa6.19□□□□□ -1.42
NISCH-207ENST00000479054 KMT2AQ03164 3969 aa6.17□□□□□ -1.42
NISCH-207ENST00000479054 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.17□□□□□ -1.42
NISCH-207ENST00000479054 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.13□□□□□ -1.43
NISCH-207ENST00000479054 INE1O15225 51 aa6.13□□□□□ -1.43
NISCH-207ENST00000479054 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
NISCH-207ENST00000479054 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.06□□□□□ -1.44
NISCH-207ENST00000479054 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.04□□□□□ -1.44
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP10-12P60413 245 aa6.02□□□□□ -1.45
NISCH-207ENST00000479054 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.02□□□□□ -1.45
NISCH-207ENST00000479054 RYR1P21817 5038 aa6□□□□□ -1.45
NISCH-207ENST00000479054 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.99□□□□□ -1.45
NISCH-207ENST00000479054 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.92□□□□□ -1.46
NISCH-207ENST00000479054 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.91□□□□□ -1.46
NISCH-207ENST00000479054 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.9□□□□□ -1.47
NISCH-207ENST00000479054 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.88□□□□□ -1.47
NISCH-207ENST00000479054 RYR3Q15413 4870 aa5.85□□□□□ -1.47
NISCH-207ENST00000479054 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.84□□□□□ -1.47
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.8□□□□□ -1.48
NISCH-207ENST00000479054 MYCBP2O75592 4640 aa5.8□□□□□ -1.48
NISCH-207ENST00000479054 HYDINQ4G0P3 5121 aa5.78□□□□□ -1.48
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP12-3P60328 96 aa5.78□□□□□ -1.48
NISCH-207ENST00000479054 RYR2Q92736 4967 aa5.77□□□□□ -1.49
NISCH-207ENST00000479054 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.74□□□□□ -1.49
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NISCH-207ENST00000479054 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.68□□□□□ -1.5
NISCH-207ENST00000479054 PKHD1P08F94 4074 aa5.65□□□□□ -1.5
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NISCH-207ENST00000479054 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.63□□□□□ -1.51
NISCH-207ENST00000479054 MT2AP02795 61 aa5.59□□□□□ -1.51
NISCH-207ENST00000479054 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.57□□□□□ -1.52
NISCH-207ENST00000479054 PKD1P98161 4303 aa5.56□□□□□ -1.52
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NISCH-207ENST00000479054 HERC2O95714 4834 aa5.54□□□□□ -1.52
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NISCH-207ENST00000479054 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
NISCH-207ENST00000479054 LRP2P98164 4655 aa5.46□□□□□ -1.53
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NISCH-207ENST00000479054 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.32□□□□□ -1.56
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NISCH-207ENST00000479054 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.27□□□□□ -1.57
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.24□□□□□ -1.57
NISCH-207ENST00000479054 HERC1Q15751 4861 aa5.24□□□□□ -1.57
NISCH-207ENST00000479054 LCE2CQ5TA81 110 aa5.24□□□□□ -1.57
NISCH-207ENST00000479054 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP10-5P60370 271 aa5.21□□□□□ -1.57
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NISCH-207ENST00000479054 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.19□□□□□ -1.58
NISCH-207ENST00000479054 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.16□□□□□ -1.58
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.14□□□□□ -1.59
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.12□□□□□ -1.59
NISCH-207ENST00000479054 MT1BP07438 61 aa5.1□□□□□ -1.59
NISCH-207ENST00000479054 SPRR2EP22531 72 aa5.09□□□□□ -1.59
NISCH-207ENST00000479054 SPRR2BP35325 72 aa5.09□□□□□ -1.59
NISCH-207ENST00000479054 SPRR2AP35326 72 aa5.09□□□□□ -1.59
NISCH-207ENST00000479054 MT1XP80297 61 aa5.09□□□□□ -1.6
NISCH-207ENST00000479054 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.03□□□□□ -1.6
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.03□□□□□ -1.6
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NISCH-207ENST00000479054 MT1GP13640 62 aa4.84□□□□□ -1.64
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.83□□□□□ -1.64
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.83□□□□□ -1.64
NISCH-207ENST00000479054 RNF213Q63HN8 5207 aa4.82□□□□□ -1.64
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP12-4P60329 112 aa4.81□□□□□ -1.64
NISCH-207ENST00000479054 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.81□□□□□ -1.64
NISCH-207ENST00000479054 MUC2Q02817 5179 aa4.78□□□□□ -1.64
NISCH-207ENST00000479054 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.75□□□□□ -1.65
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.68□□□□□ -1.66
NISCH-207ENST00000479054 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
NISCH-207ENST00000479054 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.66□□□□□ -1.66
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.64□□□□□ -1.67
NISCH-207ENST00000479054 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.63□□□□□ -1.67
NISCH-207ENST00000479054 LCE3BQ5TA77 95 aa4.58□□□□□ -1.68
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