RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.42□□□□□ -1.38
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SRRT-210ENST00000477529 K7ERU9 68 aa6.4□□□□□ -1.38
SRRT-210ENST00000477529 A8MUN3 132 aa6.39□□□□□ -1.39
SRRT-210ENST00000477529 MT-ATP8P03928 68 aa6.38□□□□□ -1.39
SRRT-210ENST00000477529 IMUPQ9GZP8 106 aa6.38□□□□□ -1.39
SRRT-210ENST00000477529 H3BPC8 53 aa6.37□□□□□ -1.39
SRRT-210ENST00000477529 SCGB1A1P11684 91 aa6.37□□□□□ -1.39
SRRT-210ENST00000477529 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.36□□□□□ -1.39
SRRT-210ENST00000477529 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.36□□□□□ -1.39
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.36□□□□□ -1.39
SRRT-210ENST00000477529 NDUFC1O43677 76 aa6.33□□□□□ -1.4
SRRT-210ENST00000477529 MT1BP07438 61 aa6.3□□□□□ -1.4
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.3□□□□□ -1.4
SRRT-210ENST00000477529 H0YAA0 97 aa6.29□□□□□ -1.4
SRRT-210ENST00000477529 DMAC1Q96GE9 116 aa6.29□□□□□ -1.4
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.27□□□□□ -1.41
SRRT-210ENST00000477529 Q5VV11 94 aa6.26□□□□□ -1.41
SRRT-210ENST00000477529 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.25□□□□□ -1.41
SRRT-210ENST00000477529 CRIPTQ9P021 101 aa6.25□□□□□ -1.41
SRRT-210ENST00000477529 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.24□□□□□ -1.41
SRRT-210ENST00000477529 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SRRT-210ENST00000477529 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.21□□□□□ -1.42
SRRT-210ENST00000477529 A6NN06 94 aa6.14□□□□□ -1.43
SRRT-210ENST00000477529 SNURFQ9Y675 71 aa6.14□□□□□ -1.43
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP10-5P60370 271 aa6.12□□□□□ -1.43
SRRT-210ENST00000477529 P0C880 135 aa6.11□□□□□ -1.43
SRRT-210ENST00000477529 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
SRRT-210ENST00000477529 ACYP2P14621 99 aa6.1□□□□□ -1.43
SRRT-210ENST00000477529 SERP2Q8N6R1 65 aa6.09□□□□□ -1.43
SRRT-210ENST00000477529 C20orf197Q8N268 126 aa6.07□□□□□ -1.44
SRRT-210ENST00000477529 R4GN34 69 aa6.04□□□□□ -1.44
SRRT-210ENST00000477529 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.03□□□□□ -1.44
SRRT-210ENST00000477529 M0QZ58 72 aa6.01□□□□□ -1.45
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.99□□□□□ -1.45
SRRT-210ENST00000477529 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.99□□□□□ -1.45
SRRT-210ENST00000477529 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.98□□□□□ -1.45
SRRT-210ENST00000477529 MT1XP80297 61 aa5.94□□□□□ -1.46
SRRT-210ENST00000477529 COX7CP15954 63 aa5.93□□□□□ -1.46
SRRT-210ENST00000477529 PLAC4Q8WY50 150 aa5.92□□□□□ -1.46
SRRT-210ENST00000477529 LINC01554Q52M75 96 aa5.9□□□□□ -1.46
SRRT-210ENST00000477529 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.89□□□□□ -1.47
SRRT-210ENST00000477529 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.88□□□□□ -1.47
SRRT-210ENST00000477529 COA5Q86WW8 74 aa5.86□□□□□ -1.47
SRRT-210ENST00000477529 H7BZZ5 65 aa5.85□□□□□ -1.47
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP5-9P26371 169 aa5.81□□□□□ -1.48
SRRT-210ENST00000477529 KMT2DO14686 5537 aa5.8□□□□□ -1.48
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.78□□□□□ -1.48
SRRT-210ENST00000477529 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.78□□□□□ -1.48
SRRT-210ENST00000477529 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.77□□□□□ -1.49
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.77□□□□□ -1.49
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP12-2P59991 146 aa5.75□□□□□ -1.49
SRRT-210ENST00000477529 NEBP20929 6669 aa5.68□□□□□ -1.5
SRRT-210ENST00000477529 CCDC179H3BU77 68 aa5.67□□□□□ -1.5
SRRT-210ENST00000477529 SEC61GP60059 68 aa5.66□□□□□ -1.5
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.65□□□□□ -1.5
SRRT-210ENST00000477529 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.65□□□□□ -1.5
SRRT-210ENST00000477529 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.65□□□□□ -1.5
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.64□□□□□ -1.51
SRRT-210ENST00000477529 SVIPQ8NHG7 77 aa5.64□□□□□ -1.51
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP10-12P60413 245 aa5.63□□□□□ -1.51
SRRT-210ENST00000477529 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.59□□□□□ -1.51
SRRT-210ENST00000477529 A0A1B0GU33 70 aa5.58□□□□□ -1.52
SRRT-210ENST00000477529 MDN1Q9NU22 5596 aa5.57□□□□□ -1.52
SRRT-210ENST00000477529 A0A0D9SG42 100 aa5.56□□□□□ -1.52
SRRT-210ENST00000477529 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
SRRT-210ENST00000477529 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.56□□□□□ -1.52
SRRT-210ENST00000477529 A0A1B0GU69 56 aa5.53□□□□□ -1.52
SRRT-210ENST00000477529 SPRR2EP22531 72 aa5.53□□□□□ -1.52
SRRT-210ENST00000477529 SPRR2BP35325 72 aa5.53□□□□□ -1.52
SRRT-210ENST00000477529 SPRR2AP35326 72 aa5.53□□□□□ -1.52
SRRT-210ENST00000477529 LCE3BQ5TA77 95 aa5.51□□□□□ -1.53
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.5□□□□□ -1.53
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP12-1P59990 96 aa5.49□□□□□ -1.53
SRRT-210ENST00000477529 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.49□□□□□ -1.53
SRRT-210ENST00000477529 TMEM258P61165 79 aa5.47□□□□□ -1.53
SRRT-210ENST00000477529 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.46□□□□□ -1.54
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.44□□□□□ -1.54
SRRT-210ENST00000477529 PCP4P48539 62 aa5.43□□□□□ -1.54
SRRT-210ENST00000477529 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.41□□□□□ -1.54
SRRT-210ENST00000477529 A8MU10 97 aa5.41□□□□□ -1.54
SRRT-210ENST00000477529 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.39□□□□□ -1.55
SRRT-210ENST00000477529 PRR15LQ9BU68 103 aa5.38□□□□□ -1.55
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.38□□□□□ -1.55
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.38□□□□□ -1.55
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.37□□□□□ -1.55
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.37□□□□□ -1.55
SRRT-210ENST00000477529 SPRR2DP22532 72 aa5.34□□□□□ -1.55
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.31□□□□□ -1.56
SRRT-210ENST00000477529 MT1EP04732 61 aa5.24□□□□□ -1.57
SRRT-210ENST00000477529 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.23□□□□□ -1.57
SRRT-210ENST00000477529 UQCR11O14957 56 aa5.22□□□□□ -1.57
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.21□□□□□ -1.58
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.21□□□□□ -1.58
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.18□□□□□ -1.58
SRRT-210ENST00000477529 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.18□□□□□ -1.58
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.17□□□□□ -1.58
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.17□□□□□ -1.58
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