RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
RBM39-231	ENST00000477334	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		0.46	□□□□□ -2.34
RBM39-231	ENST00000477334	FAT1	Q14517	4588 aa		0.46	□□□□□ -2.34
RBM39-231	ENST00000477334	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		0.46	□□□□□ -2.34
RBM39-231	ENST00000477334	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
RBM39-231	ENST00000477334	UMAD1	C9J7I0	102 aa		0.46	□□□□□ -2.34
RBM39-231	ENST00000477334	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		0.46	□□□□□ -2.34
RBM39-231	ENST00000477334	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		0.46	□□□□□ -2.34
RBM39-231	ENST00000477334	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		0.46	□□□□□ -2.34
RBM39-231	ENST00000477334	SMIM13	P0DJ93	91 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RBM39-231	ENST00000477334	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RBM39-231	ENST00000477334	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
RBM39-231	ENST00000477334	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RBM39-231	ENST00000477334	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RBM39-231	ENST00000477334	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RBM39-231	ENST00000477334	PHGR1	C9JFL3	82 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RBM39-231	ENST00000477334	NREP	Q16612	68 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RBM39-231	ENST00000477334	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RBM39-231	ENST00000477334	IFI6	P09912	130 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RBM39-231	ENST00000477334	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RBM39-231	ENST00000477334	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RBM39-231	ENST00000477334	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RBM39-231	ENST00000477334		A0A1B0GUL6	1792 aa		0.41	□□□□□ -2.34
RBM39-231	ENST00000477334	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334	SPRR2E	P22531	72 aa		0.4	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334	SPRR2D	P22532	72 aa		0.4	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334	SPRR2B	P35325	72 aa		0.4	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334	SPRR2A	P35326	72 aa		0.4	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334	LPA	P08519	4548 aa		0.4	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		0.4	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		0.39	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334	NDUFA4	O00483	81 aa		0.39	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		0.39	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		0.39	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		0.38	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334	TNXB	P22105	4242 aa		0.38	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334		H3BVH4	76 aa		0.38	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		0.38	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334	DNAH2	Q9P225	4427 aa		0.37	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334	MT4	P47944	62 aa		0.37	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334	PDCD5	O14737	125 aa		0.36	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334	NDUFA3	O95167	84 aa		0.36	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334	DEFA5	Q01523	94 aa		0.36	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		0.36	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RBM39-231	ENST00000477334	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RBM39-231	ENST00000477334		M0R2T5	61 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RBM39-231	ENST00000477334	MUC17	Q685J3	4493 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RBM39-231	ENST00000477334	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
RBM39-231	ENST00000477334	C3orf79	P0CE67	100 aa		0.33	□□□□□ -2.36
RBM39-231	ENST00000477334	DEFB135	Q30KP9	77 aa		0.32	□□□□□ -2.36
RBM39-231	ENST00000477334	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		0.32	□□□□□ -2.36
RBM39-231	ENST00000477334	GNG13	Q9P2W3	67 aa		0.32	□□□□□ -2.36
RBM39-231	ENST00000477334	PRM1	P04553	51 aa		0.31	□□□□□ -2.36
RBM39-231	ENST00000477334	LINC00158	P58513	81 aa		0.31	□□□□□ -2.36
RBM39-231	ENST00000477334	UBL5	Q9BZL1	73 aa		0.31	□□□□□ -2.36
RBM39-231	ENST00000477334	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		0.31	□□□□□ -2.36
RBM39-231	ENST00000477334	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	0.3	□□□□□ -2.36
RBM39-231	ENST00000477334	ATXN8	Q156A1	80 aa		0.3	□□□□□ -2.36
RBM39-231	ENST00000477334	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		0.3	□□□□□ -2.36
RBM39-231	ENST00000477334		H0YGG7	62 aa		0.29	□□□□□ -2.36
RBM39-231	ENST00000477334	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		0.29	□□□□□ -2.36
RBM39-231	ENST00000477334	STATH	P02808	62 aa		0.28	□□□□□ -2.36
RBM39-231	ENST00000477334	ENHO	Q6UWT2	76 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RBM39-231	ENST00000477334	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RBM39-231	ENST00000477334	MT1HL1	P0DM35	61 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RBM39-231	ENST00000477334	MT1H	P80294	61 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RBM39-231	ENST00000477334	TFF3	Q07654	80 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RBM39-231	ENST00000477334	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RBM39-231	ENST00000477334	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RBM39-231	ENST00000477334		Q9Y3F1	56 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RBM39-231	ENST00000477334		H0YAA0	97 aa		0.22	□□□□□ -2.37
RBM39-231	ENST00000477334	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RBM39-231	ENST00000477334	IAPP	P10997	89 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RBM39-231	ENST00000477334	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RBM39-231	ENST00000477334	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RBM39-231	ENST00000477334	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RBM39-231	ENST00000477334	CD52	P31358	61 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RBM39-231	ENST00000477334	DEFB130B	P0DP73	79 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RBM39-231	ENST00000477334	DEFB130A	P0DP74	79 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RBM39-231	ENST00000477334		A0A087WWC5	75 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RBM39-231	ENST00000477334	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RBM39-231	ENST00000477334	LINC01549	A6NIU2	74 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RBM39-231	ENST00000477334	CRIP1	P50238	77 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RBM39-231	ENST00000477334	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RBM39-231	ENST00000477334	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RBM39-231	ENST00000477334	MT2A	P02795	61 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RBM39-231	ENST00000477334	MT1F	P04733	61 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RBM39-231	ENST00000477334	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RBM39-231	ENST00000477334	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RBM39-231	ENST00000477334	DEFB106A	Q8N104	65 aa		0.12	□□□□□ -2.39
RBM39-231	ENST00000477334	S100Z	Q8WXG8	99 aa		0.12	□□□□□ -2.39
RBM39-231	ENST00000477334	MT1B	P07438	61 aa		0.11	□□□□□ -2.39
RBM39-231	ENST00000477334	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		0.11	□□□□□ -2.39
RBM39-231	ENST00000477334	PRLH	P81277	87 aa		0.1	□□□□□ -2.39
RBM39-231	ENST00000477334		H3BSH0	61 aa		0.09	□□□□□ -2.4
RBM39-231	ENST00000477334	FCER1G	P30273	86 aa		0.09	□□□□□ -2.4

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