RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 FAT2Q9NYQ8 4349 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-208ENST00000471759 LINC01556Q5JQF7 62 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-208ENST00000471759 HSPG2P98160 4391 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-208ENST00000471759 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-208ENST00000471759 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-208ENST00000471759 DNAH2Q9P225 4427 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-208ENST00000471759 PKHD1P08F94 4074 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-208ENST00000471759 Q8N1X5 172 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-208ENST00000471759 PKD1P98161 4303 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-208ENST00000471759 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-208ENST00000471759 DEFB4AO15263 64 aa3.65□□□□□ -1.82
RABGGTB-208ENST00000471759 C14orf177Q52M58 125 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-208ENST00000471759 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-208ENST00000471759 DEFB135Q30KP9 77 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-208ENST00000471759 SPINK6Q6UWN8 80 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-208ENST00000471759 APLNQ9ULZ1 77 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-208ENST00000471759 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-208ENST00000471759 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-208ENST00000471759 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-208ENST00000471759 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.59□□□□□ -1.84
RABGGTB-208ENST00000471759 PLAC4Q8WY50 150 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.57□□□□□ -1.84
RABGGTB-208ENST00000471759 MYCBP2O75592 4640 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-208ENST00000471759 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-208ENST00000471759 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-208ENST00000471759 Q5VSD8 79 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-208ENST00000471759 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-208ENST00000471759 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-208ENST00000471759 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-208ENST00000471759 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-208ENST00000471759 FAT1Q14517 4588 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP10-2P60368 255 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-208ENST00000471759 S4R3F8 94 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A0D9SG42 100 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-208ENST00000471759 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-208ENST00000471759 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-208ENST00000471759 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-208ENST00000471759 RNF213Q63HN8 5207 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP10-1P60331 282 aa3.4□□□□□ -1.86
RABGGTB-208ENST00000471759 R4GN34 69 aa3.4□□□□□ -1.86
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-208ENST00000471759 SPACA4Q8TDM5 124 aa3.38□□□□□ -1.87
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.38□□□□□ -1.87
RABGGTB-208ENST00000471759 INE1O15225 51 aa3.38□□□□□ -1.87
RABGGTB-208ENST00000471759 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.36□□□□□ -1.87
RABGGTB-208ENST00000471759 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.36□□□□□ -1.87
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.35□□□□□ -1.87
RABGGTB-208ENST00000471759 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.34□□□□□ -1.88
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP12-2P59991 146 aa3.34□□□□□ -1.88
RABGGTB-208ENST00000471759 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP12-1P59990 96 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-208ENST00000471759 PP632Q6XCG6 107 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-208ENST00000471759 LRP2P98164 4655 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-208ENST00000471759 MT1HL1P0DM35 61 aa3.28□□□□□ -1.89
RABGGTB-208ENST00000471759 TNXBP22105 4242 aa3.26□□□□□ -1.89
RABGGTB-208ENST00000471759 M0QZ58 72 aa3.26□□□□□ -1.89
RABGGTB-208ENST00000471759 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-208ENST00000471759 LCE3BQ5TA77 95 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP10-8P60410 259 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-208ENST00000471759 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-208ENST00000471759 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-208ENST00000471759 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-208ENST00000471759 MUC2Q02817 5179 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-208ENST00000471759 LPAP08519 4548 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGGTB-208ENST00000471759 C9orf92A6NGG3 77 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-208ENST00000471759 LCE1DQ5T752 114 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-208ENST00000471759 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-208ENST00000471759 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.01□□□□□ -1.93
RABGGTB-208ENST00000471759 MUC17Q685J3 4493 aa3□□□□□ -1.93
RABGGTB-208ENST00000471759 LCE4AQ5TA78 99 aa2.96□□□□□ -1.94
RABGGTB-208ENST00000471759 TNP1P09430 55 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.84□□□□□ -1.96
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-208ENST00000471759 MT1HP80294 61 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-208ENST00000471759 SSPOA2VEC9 5147 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP5-9P26371 169 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-208ENST00000471759 M0R2T5 61 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-208ENST00000471759 USH2AO75445 5202 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-208ENST00000471759 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP10-10P60014 251 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-208ENST00000471759 LCE1FQ5T754 118 aa2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.3 ms