RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446903.5

TNS1-210, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TNS1, Length 2,464 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-210ENST00000446903 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.35□□□□□ -1.23
TNS1-210ENST00000446903 XP32Q5T750 250 aa7.31□□□□□ -1.24
TNS1-210ENST00000446903 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TNS1-210ENST00000446903 H3BS24 57 aa7.29□□□□□ -1.24
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.25□□□□□ -1.25
TNS1-210ENST00000446903 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.22□□□□□ -1.25
TNS1-210ENST00000446903 LINC01554Q52M75 96 aa7.2□□□□□ -1.26
TNS1-210ENST00000446903 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.18□□□□□ -1.26
TNS1-210ENST00000446903 TPRXLQ17RH7 258 aa7.18□□□□□ -1.26
TNS1-210ENST00000446903 HERC2O95714 4834 aa7.17□□□□□ -1.26
TNS1-210ENST00000446903 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.17□□□□□ -1.26
TNS1-210ENST00000446903 PRAC1Q96KF2 57 aa7.13□□□□□ -1.27
TNS1-210ENST00000446903 LRP2P98164 4655 aa7.12□□□□□ -1.27
TNS1-210ENST00000446903 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.12□□□□□ -1.27
TNS1-210ENST00000446903 H0YAA0 97 aa7.11□□□□□ -1.27
TNS1-210ENST00000446903 A0A1B0GU33 70 aa7.11□□□□□ -1.27
TNS1-210ENST00000446903 LPAP08519 4548 aa7.11□□□□□ -1.27
TNS1-210ENST00000446903 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.08□□□□□ -1.28
TNS1-210ENST00000446903 J3QL48 77 aa7.04□□□□□ -1.28
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.98□□□□□ -1.29
TNS1-210ENST00000446903 CSAG1Q6PB30 78 aa6.94□□□□□ -1.3
TNS1-210ENST00000446903 S4R3F8 94 aa6.91□□□□□ -1.3
TNS1-210ENST00000446903 K7ERS5 55 aa6.9□□□□□ -1.3
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TNS1-210ENST00000446903 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TNS1-210ENST00000446903 MUC17Q685J3 4493 aa6.88□□□□□ -1.31
TNS1-210ENST00000446903 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.86□□□□□ -1.31
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.86□□□□□ -1.31
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.84□□□□□ -1.32
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.8□□□□□ -1.32
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.78□□□□□ -1.32
TNS1-210ENST00000446903 HERC1Q15751 4861 aa6.77□□□□□ -1.33
TNS1-210ENST00000446903 P0C880 135 aa6.75□□□□□ -1.33
TNS1-210ENST00000446903 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.75□□□□□ -1.33
TNS1-210ENST00000446903 A0A0D9SG42 100 aa6.74□□□□□ -1.33
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.73□□□□□ -1.33
TNS1-210ENST00000446903 ROMO1P60602 79 aa6.72□□□□□ -1.33
TNS1-210ENST00000446903 CRIPTQ9P021 101 aa6.65□□□□□ -1.35
TNS1-210ENST00000446903 MUC2Q02817 5179 aa6.6□□□□□ -1.35
TNS1-210ENST00000446903 M0QZ58 72 aa6.58□□□□□ -1.36
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP12-2P59991 146 aa6.58□□□□□ -1.36
TNS1-210ENST00000446903 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP12-1P59990 96 aa6.55□□□□□ -1.36
TNS1-210ENST00000446903 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.54□□□□□ -1.36
TNS1-210ENST00000446903 A0A0A0MQY5 61 aa6.49□□□□□ -1.37
TNS1-210ENST00000446903 LCE2CQ5TA81 110 aa6.45□□□□□ -1.38
TNS1-210ENST00000446903 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.43□□□□□ -1.38
TNS1-210ENST00000446903 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
TNS1-210ENST00000446903 RNF213Q63HN8 5207 aa6.42□□□□□ -1.38
TNS1-210ENST00000446903 R4GN34 69 aa6.41□□□□□ -1.38
TNS1-210ENST00000446903 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.4□□□□□ -1.39
TNS1-210ENST00000446903 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.32□□□□□ -1.4
TNS1-210ENST00000446903 MT1HP80294 61 aa6.27□□□□□ -1.41
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.21□□□□□ -1.42
TNS1-210ENST00000446903 NDUFAF8A1L188 74 aa6.19□□□□□ -1.42
TNS1-210ENST00000446903 M0R2T5 61 aa6.16□□□□□ -1.42
TNS1-210ENST00000446903 MT2AP02795 61 aa6.09□□□□□ -1.43
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.09□□□□□ -1.43
TNS1-210ENST00000446903 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.08□□□□□ -1.44
TNS1-210ENST00000446903 MT1FP04733 61 aa6.07□□□□□ -1.44
TNS1-210ENST00000446903 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.07□□□□□ -1.44
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.07□□□□□ -1.44
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP10-10P60014 251 aa6.01□□□□□ -1.45
TNS1-210ENST00000446903 PP632Q6XCG6 107 aa5.99□□□□□ -1.45
TNS1-210ENST00000446903 LUZP6Q538Z0 58 aa5.98□□□□□ -1.45
TNS1-210ENST00000446903 PLAC4Q8WY50 150 aa5.94□□□□□ -1.46
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.88□□□□□ -1.47
TNS1-210ENST00000446903 TNP1P09430 55 aa5.87□□□□□ -1.47
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.86□□□□□ -1.47
TNS1-210ENST00000446903 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.81□□□□□ -1.48
TNS1-210ENST00000446903 MT1BP07438 61 aa5.81□□□□□ -1.48
TNS1-210ENST00000446903 MT1XP80297 61 aa5.68□□□□□ -1.5
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP10-5P60370 271 aa5.67□□□□□ -1.5
TNS1-210ENST00000446903 LCE2BO14633 110 aa5.67□□□□□ -1.5
TNS1-210ENST00000446903 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.55□□□□□ -1.52
TNS1-210ENST00000446903 LCE3AQ5TA76 89 aa5.53□□□□□ -1.52
TNS1-210ENST00000446903 USH2AO75445 5202 aa5.48□□□□□ -1.53
TNS1-210ENST00000446903 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.48□□□□□ -1.53
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP10-12P60413 245 aa5.42□□□□□ -1.54
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.42□□□□□ -1.54
TNS1-210ENST00000446903 SSPOA2VEC9 5147 aa5.3□□□□□ -1.56
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP12-3P60328 96 aa5.28□□□□□ -1.56
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.22□□□□□ -1.57
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.2□□□□□ -1.58
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.2□□□□□ -1.58
TNS1-210ENST00000446903 KMT2DO14686 5537 aa5.19□□□□□ -1.58
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.18□□□□□ -1.58
TNS1-210ENST00000446903 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
TNS1-210ENST00000446903 INE1O15225 51 aa5.16□□□□□ -1.58
TNS1-210ENST00000446903 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.1□□□□□ -1.59
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.07□□□□□ -1.6
TNS1-210ENST00000446903 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
TNS1-210ENST00000446903 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.97□□□□□ -1.61
TNS1-210ENST00000446903 MT1EP04732 61 aa4.95□□□□□ -1.62
TNS1-210ENST00000446903 MT1LQ93083 61 aa4.88□□□□□ -1.63
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.85□□□□□ -1.63
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.82□□□□□ -1.64
TNS1-210ENST00000446903 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.4 ms