RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436901.2

KLF3-AS1-201, KLF3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene KLF3-AS1, Length 1,896 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3-AS1-201ENST00000436901 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa11.32□□□□□ -0.6
KLF3-AS1-201ENST00000436901 LRP2P98164 4655 aa11.31□□□□□ -0.6
KLF3-AS1-201ENST00000436901 LCA10Q71F78 164 aa11.3□□□□□ -0.6
KLF3-AS1-201ENST00000436901 LPAP08519 4548 aa11.28□□□□□ -0.6
KLF3-AS1-201ENST00000436901 A8MU10 97 aa11.26□□□□□ -0.61
KLF3-AS1-201ENST00000436901 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
KLF3-AS1-201ENST00000436901 UQCR11O14957 56 aa11.21□□□□□ -0.61
KLF3-AS1-201ENST00000436901 S4R3F8 94 aa11.2□□□□□ -0.62
KLF3-AS1-201ENST00000436901 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa11.19□□□□□ -0.62
KLF3-AS1-201ENST00000436901 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa11.18□□□□□ -0.62
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa11.14□□□□□ -0.63
KLF3-AS1-201ENST00000436901 SPATA8Q6RVD6 105 aa11.12□□□□□ -0.63
KLF3-AS1-201ENST00000436901 MIR22HGQ0VDD5 57 aa11.11□□□□□ -0.63
KLF3-AS1-201ENST00000436901 A0A1B0GU33 70 aa11.01□□□□□ -0.65
KLF3-AS1-201ENST00000436901 PMAIP1Q13794 54 aa11.01□□□□□ -0.65
KLF3-AS1-201ENST00000436901 MUC17Q685J3 4493 aa10.93□□□□□ -0.66
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa10.91□□□□□ -0.66
KLF3-AS1-201ENST00000436901 CSAG1Q6PB30 78 aa10.9□□□□□ -0.66
KLF3-AS1-201ENST00000436901 H0YAA0 97 aa10.88□□□□□ -0.67
KLF3-AS1-201ENST00000436901 PCLOQ9Y6V0 5065 aa10.88□□□□□ -0.67
KLF3-AS1-201ENST00000436901 A6NN06 94 aa10.87□□□□□ -0.67
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.84□□□□□ -0.67
KLF3-AS1-201ENST00000436901 ADM2Q7Z4H4 148 aa10.74□□□□□ -0.69
KLF3-AS1-201ENST00000436901 HERC1Q15751 4861 aa10.73□□□□□ -0.69
KLF3-AS1-201ENST00000436901 P0C880 135 aa10.72□□□□□ -0.69
KLF3-AS1-201ENST00000436901 HMCN2Q8NDA2 5059 aa10.71□□□□□ -0.69
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa10.68□□□□□ -0.7
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa10.66□□□□□ -0.7
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa10.62□□□□□ -0.71
KLF3-AS1-201ENST00000436901 K7ERS5 55 aa10.57□□□□□ -0.72
KLF3-AS1-201ENST00000436901 M0QZ58 72 aa10.51□□□□□ -0.73
KLF3-AS1-201ENST00000436901 A0A0D9SG42 100 aa10.49□□□□□ -0.73
KLF3-AS1-201ENST00000436901 MUC2Q02817 5179 aa10.43□□□□□ -0.74
KLF3-AS1-201ENST00000436901 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
KLF3-AS1-201ENST00000436901 R4GN34 69 aa10.35□□□□□ -0.75
KLF3-AS1-201ENST00000436901 LCE2CQ5TA81 110 aa10.27□□□□□ -0.76
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP12-1P59990 96 aa10.25□□□□□ -0.77
KLF3-AS1-201ENST00000436901 PRAC1Q96KF2 57 aa10.25□□□□□ -0.77
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP12-2P59991 146 aa10.24□□□□□ -0.77
KLF3-AS1-201ENST00000436901 SPINT4Q6UDR6 99 aa10.23□□□□□ -0.77
KLF3-AS1-201ENST00000436901 LORP23490 312 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
KLF3-AS1-201ENST00000436901 LINC01554Q52M75 96 aa10.18□□□□□ -0.78
KLF3-AS1-201ENST00000436901 ROMO1P60602 79 aa10.17□□□□□ -0.78
KLF3-AS1-201ENST00000436901 RNF213Q63HN8 5207 aa10.17□□□□□ -0.78
KLF3-AS1-201ENST00000436901 UBR4Q5T4S7 5183 aa10.11□□□□□ -0.79
KLF3-AS1-201ENST00000436901 CRIPTQ9P021 101 aa10.1□□□□□ -0.79
KLF3-AS1-201ENST00000436901 M0R2T5 61 aa10.06□□□□□ -0.8
KLF3-AS1-201ENST00000436901 MT1HP80294 61 aa10.06□□□□□ -0.8
KLF3-AS1-201ENST00000436901 FAT4Q6V0I7 4981 aa10□□□□□ -0.81
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa9.93□□□□□ -0.82
KLF3-AS1-201ENST00000436901 SPRR2GQ9BYE4 73 aa9.76□□□□□ -0.85
KLF3-AS1-201ENST00000436901 MT2AP02795 61 aa9.76□□□□□ -0.85
KLF3-AS1-201ENST00000436901 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa9.75□□□□□ -0.85
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa9.74□□□□□ -0.85
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP10-10P60014 251 aa9.72□□□□□ -0.85
KLF3-AS1-201ENST00000436901 MT1FP04733 61 aa9.7□□□□□ -0.86
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa9.68□□□□□ -0.86
KLF3-AS1-201ENST00000436901 C10orf95Q9H7T3 257 aa9.68□□□□□ -0.86
KLF3-AS1-201ENST00000436901 PLAC4Q8WY50 150 aa9.58□□□□□ -0.88
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa9.45□□□□□ -0.9
KLF3-AS1-201ENST00000436901 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa9.36□□□□□ -0.91
KLF3-AS1-201ENST00000436901 TNP1P09430 55 aa9.34□□□□□ -0.91
KLF3-AS1-201ENST00000436901 PP632Q6XCG6 107 aa9.28□□□□□ -0.92
KLF3-AS1-201ENST00000436901 MT1BP07438 61 aa9.28□□□□□ -0.92
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP23-1A1A580 65 aa9.15□□□□□ -0.94
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP10-5P60370 271 aa9.06□□□□□ -0.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 MT1XP80297 61 aa9.06□□□□□ -0.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 LCE2BO14633 110 aa9.04□□□□□ -0.96
KLF3-AS1-201ENST00000436901 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.97□□□□□ -0.97
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.88□□□□□ -0.99
KLF3-AS1-201ENST00000436901 LCE3AQ5TA76 89 aa8.85□□□□□ -0.99
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP10-12P60413 245 aa8.76□□□□□ -1.01
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa8.68□□□□□ -1.02
KLF3-AS1-201ENST00000436901 USH2AO75445 5202 aa8.68□□□□□ -1.02
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP12-3P60328 96 aa8.49□□□□□ -1.05
KLF3-AS1-201ENST00000436901 SSPOA2VEC9 5147 aa8.41□□□□□ -1.06
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.4□□□□□ -1.07
KLF3-AS1-201ENST00000436901 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
KLF3-AS1-201ENST00000436901 NDUFAF8A1L188 74 aa8.38□□□□□ -1.07
KLF3-AS1-201ENST00000436901 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa8.35□□□□□ -1.07
KLF3-AS1-201ENST00000436901 LUZP6Q538Z0 58 aa8.32□□□□□ -1.08
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa8.29□□□□□ -1.08
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa8.28□□□□□ -1.08
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.28□□□□□ -1.08
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.24□□□□□ -1.09
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KMT2DO14686 5537 aa8.18□□□□□ -1.1
KLF3-AS1-201ENST00000436901 FSIP2Q5CZC0 6907 aa8.18□□□□□ -1.1
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa8.08□□□□□ -1.12
KLF3-AS1-201ENST00000436901 H3BS24 57 aa7.98□□□□□ -1.13
KLF3-AS1-201ENST00000436901 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.96□□□□□ -1.14
KLF3-AS1-201ENST00000436901 MT1EP04732 61 aa7.92□□□□□ -1.14
KLF3-AS1-201ENST00000436901 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.9□□□□□ -1.14
KLF3-AS1-201ENST00000436901 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.89□□□□□ -1.15
KLF3-AS1-201ENST00000436901 MT1LQ93083 61 aa7.82□□□□□ -1.16
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.77□□□□□ -1.17
KLF3-AS1-201ENST00000436901 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms