RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376392.10

NME1-NME2-201, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 894 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.73□□□□□ -1.33
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A1B0GU69 56 aa6.7□□□□□ -1.34
NME1-NME2-201ENST00000376392 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.69□□□□□ -1.34
NME1-NME2-201ENST00000376392 BRK1Q8WUW1 75 aa6.68□□□□□ -1.34
NME1-NME2-201ENST00000376392 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.68□□□□□ -1.34
NME1-NME2-201ENST00000376392 SEC61GP60059 68 aa6.67□□□□□ -1.34
NME1-NME2-201ENST00000376392 A6NED7 52 aa6.65□□□□□ -1.34
NME1-NME2-201ENST00000376392 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
NME1-NME2-201ENST00000376392 LCE2CQ5TA81 110 aa6.64□□□□□ -1.35
NME1-NME2-201ENST00000376392 S4R3F8 94 aa6.63□□□□□ -1.35
NME1-NME2-201ENST00000376392 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.62□□□□□ -1.35
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRO0628Q9UI54 55 aa6.61□□□□□ -1.35
NME1-NME2-201ENST00000376392 LCA10Q71F78 164 aa6.55□□□□□ -1.36
NME1-NME2-201ENST00000376392 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.55□□□□□ -1.36
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.53□□□□□ -1.36
NME1-NME2-201ENST00000376392 UQCR11O14957 56 aa6.53□□□□□ -1.36
NME1-NME2-201ENST00000376392 RNF213Q63HN8 5207 aa6.48□□□□□ -1.37
NME1-NME2-201ENST00000376392 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
NME1-NME2-201ENST00000376392 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.46□□□□□ -1.38
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.46□□□□□ -1.38
NME1-NME2-201ENST00000376392 LRP2P98164 4655 aa6.45□□□□□ -1.38
NME1-NME2-201ENST00000376392 LPAP08519 4548 aa6.45□□□□□ -1.38
NME1-NME2-201ENST00000376392 CSAG1Q6PB30 78 aa6.45□□□□□ -1.38
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.44□□□□□ -1.38
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A1B0GU33 70 aa6.43□□□□□ -1.38
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.43□□□□□ -1.38
NME1-NME2-201ENST00000376392 MUC17Q685J3 4493 aa6.4□□□□□ -1.39
NME1-NME2-201ENST00000376392 A8MU10 97 aa6.39□□□□□ -1.39
NME1-NME2-201ENST00000376392 SVIPQ8NHG7 77 aa6.39□□□□□ -1.39
NME1-NME2-201ENST00000376392 H0YAA0 97 aa6.32□□□□□ -1.4
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
NME1-NME2-201ENST00000376392 PMAIP1Q13794 54 aa6.32□□□□□ -1.4
NME1-NME2-201ENST00000376392 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.32□□□□□ -1.4
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.27□□□□□ -1.41
NME1-NME2-201ENST00000376392 P0C880 135 aa6.25□□□□□ -1.41
NME1-NME2-201ENST00000376392 A6NN06 94 aa6.23□□□□□ -1.41
NME1-NME2-201ENST00000376392 K7ERS5 55 aa6.22□□□□□ -1.41
NME1-NME2-201ENST00000376392 M0QZ58 72 aa6.19□□□□□ -1.42
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.15□□□□□ -1.42
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A0D9SG42 100 aa6.12□□□□□ -1.43
NME1-NME2-201ENST00000376392 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.12□□□□□ -1.43
NME1-NME2-201ENST00000376392 R4GN34 69 aa6.11□□□□□ -1.43
NME1-NME2-201ENST00000376392 MUC2Q02817 5179 aa6.1□□□□□ -1.43
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.04□□□□□ -1.44
NME1-NME2-201ENST00000376392 M0R2T5 61 aa6.03□□□□□ -1.44
NME1-NME2-201ENST00000376392 CRIPTQ9P021 101 aa6.03□□□□□ -1.44
NME1-NME2-201ENST00000376392 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.99□□□□□ -1.45
NME1-NME2-201ENST00000376392 MT1HP80294 61 aa5.98□□□□□ -1.45
NME1-NME2-201ENST00000376392 LINC01554Q52M75 96 aa5.98□□□□□ -1.45
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP12-1P59990 96 aa5.97□□□□□ -1.45
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP12-2P59991 146 aa5.95□□□□□ -1.46
NME1-NME2-201ENST00000376392 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.94□□□□□ -1.46
NME1-NME2-201ENST00000376392 ROMO1P60602 79 aa5.92□□□□□ -1.46
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRAC1Q96KF2 57 aa5.85□□□□□ -1.47
NME1-NME2-201ENST00000376392 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.83□□□□□ -1.48
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP10-10P60014 251 aa5.8□□□□□ -1.48
NME1-NME2-201ENST00000376392 MT2AP02795 61 aa5.79□□□□□ -1.48
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.77□□□□□ -1.49
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.77□□□□□ -1.49
NME1-NME2-201ENST00000376392 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.76□□□□□ -1.49
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.76□□□□□ -1.49
NME1-NME2-201ENST00000376392 MT1FP04733 61 aa5.75□□□□□ -1.49
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.72□□□□□ -1.49
NME1-NME2-201ENST00000376392 PLAC4Q8WY50 150 aa5.71□□□□□ -1.5
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.7□□□□□ -1.5
NME1-NME2-201ENST00000376392 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.63□□□□□ -1.51
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.63□□□□□ -1.51
NME1-NME2-201ENST00000376392 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.63□□□□□ -1.51
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.6□□□□□ -1.51
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.55□□□□□ -1.52
NME1-NME2-201ENST00000376392 TNP1P09430 55 aa5.51□□□□□ -1.53
NME1-NME2-201ENST00000376392 MT1BP07438 61 aa5.47□□□□□ -1.53
NME1-NME2-201ENST00000376392 PP632Q6XCG6 107 aa5.47□□□□□ -1.53
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.39□□□□□ -1.55
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.39□□□□□ -1.55
NME1-NME2-201ENST00000376392 H3BS24 57 aa5.37□□□□□ -1.55
NME1-NME2-201ENST00000376392 MT1XP80297 61 aa5.34□□□□□ -1.55
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP10-5P60370 271 aa5.33□□□□□ -1.56
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.26□□□□□ -1.57
NME1-NME2-201ENST00000376392 USH2AO75445 5202 aa5.26□□□□□ -1.57
NME1-NME2-201ENST00000376392 SSPOA2VEC9 5147 aa5.25□□□□□ -1.57
NME1-NME2-201ENST00000376392 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP10-12P60413 245 aa5.18□□□□□ -1.58
NME1-NME2-201ENST00000376392 LCE3AQ5TA76 89 aa5.18□□□□□ -1.58
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.14□□□□□ -1.59
NME1-NME2-201ENST00000376392 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
NME1-NME2-201ENST00000376392 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.09□□□□□ -1.59
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.06□□□□□ -1.6
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.04□□□□□ -1.6
NME1-NME2-201ENST00000376392 LCE3BQ5TA77 95 aa5□□□□□ -1.61
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP12-3P60328 96 aa4.99□□□□□ -1.61
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.97□□□□□ -1.61
NME1-NME2-201ENST00000376392 NEBP20929 6669 aa4.96□□□□□ -1.61
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.91□□□□□ -1.62
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.91□□□□□ -1.62
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms