RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRO-201ENST00000281171 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRO-201ENST00000281171 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRO-201ENST00000281171 DNAH11Q96DT5 4516 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRO-201ENST00000281171 MT1HP80294 61 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRO-201ENST00000281171 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.6□□□□□ -1.51
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PTPRO-201ENST00000281171 MT2AP02795 61 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRO-201ENST00000281171 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.54□□□□□ -1.52
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PTPRO-201ENST00000281171 VPS13DQ5THJ4 4388 aa5.41□□□□□ -1.54
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PTPRO-201ENST00000281171 PKD1P98161 4303 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRO-201ENST00000281171 PRM1P04553 51 aa4.66□□□□□ -1.66
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PTPRO-201ENST00000281171 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRO-201ENST00000281171 MT1MQ8N339 61 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRO-201ENST00000281171 MUC17Q685J3 4493 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRO-201ENST00000281171 LYSTQ99698 3801 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRO-201ENST00000281171 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRO-201ENST00000281171 PKHD1P08F94 4074 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRO-201ENST00000281171 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
PTPRO-201ENST00000281171 LRP2P98164 4655 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRO-201ENST00000281171 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
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