RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640511.1

SPIN3-241, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 3,102 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-241ENST00000640511 IGLV7-43P04211 117 aa6.98□□□□□ -1.29
SPIN3-241ENST00000640511 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.97□□□□□ -1.29
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.96□□□□□ -1.29
SPIN3-241ENST00000640511 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN3-241ENST00000640511 CASC10Q5T4H9 136 aa6.94□□□□□ -1.3
SPIN3-241ENST00000640511 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.94□□□□□ -1.3
SPIN3-241ENST00000640511 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.93□□□□□ -1.3
SPIN3-241ENST00000640511 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.92□□□□□ -1.3
SPIN3-241ENST00000640511 CRIPTQ9P021 101 aa6.91□□□□□ -1.3
SPIN3-241ENST00000640511 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.91□□□□□ -1.3
SPIN3-241ENST00000640511 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.91□□□□□ -1.3
SPIN3-241ENST00000640511 NDUFAF8A1L188 74 aa6.9□□□□□ -1.3
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP10-11P60412 298 aa6.87□□□□□ -1.31
SPIN3-241ENST00000640511 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.87□□□□□ -1.31
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.87□□□□□ -1.31
SPIN3-241ENST00000640511 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.85□□□□□ -1.31
SPIN3-241ENST00000640511 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SPIN3-241ENST00000640511 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.83□□□□□ -1.32
SPIN3-241ENST00000640511 LY6G6CO95867 125 aa6.81□□□□□ -1.32
SPIN3-241ENST00000640511 FAM229AH3BQW9 127 aa6.81□□□□□ -1.32
SPIN3-241ENST00000640511 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.81□□□□□ -1.32
SPIN3-241ENST00000640511 IGKV2-30P06310 120 aa6.81□□□□□ -1.32
SPIN3-241ENST00000640511 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.81□□□□□ -1.32
SPIN3-241ENST00000640511 H0YAA0 97 aa6.8□□□□□ -1.32
SPIN3-241ENST00000640511 CHTF8P0CG12 524 aa6.79□□□□□ -1.32
SPIN3-241ENST00000640511 ANK2Q01484 3957 aa6.79□□□□□ -1.32
SPIN3-241ENST00000640511 NUPR2A6NF83 97 aa6.79□□□□□ -1.32
SPIN3-241ENST00000640511 TENM3Q9P273 2699 aa6.78□□□□□ -1.32
SPIN3-241ENST00000640511 A0A087WTM6 91 aa6.77□□□□□ -1.33
SPIN3-241ENST00000640511 Q6ZSA8 131 aa6.77□□□□□ -1.33
SPIN3-241ENST00000640511 SPINK1P00995 79 aa6.75□□□□□ -1.33
SPIN3-241ENST00000640511 PANO1I0J062 215 aa6.74□□□□□ -1.33
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.74□□□□□ -1.33
SPIN3-241ENST00000640511 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.73□□□□□ -1.33
SPIN3-241ENST00000640511 K7ERS5 55 aa6.71□□□□□ -1.34
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.71□□□□□ -1.34
SPIN3-241ENST00000640511 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.7□□□□□ -1.34
SPIN3-241ENST00000640511 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.69□□□□□ -1.34
SPIN3-241ENST00000640511 A0A1B0GU33 70 aa6.68□□□□□ -1.34
SPIN3-241ENST00000640511 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.68□□□□□ -1.34
SPIN3-241ENST00000640511 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.68□□□□□ -1.34
SPIN3-241ENST00000640511 C14orf177Q52M58 125 aa6.67□□□□□ -1.34
SPIN3-241ENST00000640511 DNHD1Q96M86 4753 aa6.67□□□□□ -1.34
SPIN3-241ENST00000640511 LUZP6Q538Z0 58 aa6.65□□□□□ -1.34
SPIN3-241ENST00000640511 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.64□□□□□ -1.35
SPIN3-241ENST00000640511 COL7A1Q02388 2944 aa6.63□□□□□ -1.35
SPIN3-241ENST00000640511 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.63□□□□□ -1.35
SPIN3-241ENST00000640511 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.61□□□□□ -1.35
SPIN3-241ENST00000640511 TPRXLQ17RH7 258 aa6.6□□□□□ -1.35
SPIN3-241ENST00000640511 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.59□□□□□ -1.35
SPIN3-241ENST00000640511 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.58□□□□□ -1.36
SPIN3-241ENST00000640511 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.57□□□□□ -1.36
SPIN3-241ENST00000640511 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.57□□□□□ -1.36
SPIN3-241ENST00000640511 Q8N1X5 172 aa6.57□□□□□ -1.36
SPIN3-241ENST00000640511 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.55□□□□□ -1.36
SPIN3-241ENST00000640511 TGP01266 2768 aa6.53□□□□□ -1.36
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.52□□□□□ -1.37
SPIN3-241ENST00000640511 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.52□□□□□ -1.37
SPIN3-241ENST00000640511 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SPIN3-241ENST00000640511 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.5□□□□□ -1.37
SPIN3-241ENST00000640511 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.5□□□□□ -1.37
SPIN3-241ENST00000640511 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPIN3-241ENST00000640511 FBN3Q75N90 2809 aa6.47□□□□□ -1.37
SPIN3-241ENST00000640511 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.47□□□□□ -1.37
SPIN3-241ENST00000640511 LYSTQ99698 3801 aa6.47□□□□□ -1.37
SPIN3-241ENST00000640511 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.44□□□□□ -1.38
SPIN3-241ENST00000640511 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.43□□□□□ -1.38
SPIN3-241ENST00000640511 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SPIN3-241ENST00000640511 APLNQ9ULZ1 77 aa6.41□□□□□ -1.38
SPIN3-241ENST00000640511 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.38□□□□□ -1.39
SPIN3-241ENST00000640511 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SPIN3-241ENST00000640511 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SPIN3-241ENST00000640511 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.35□□□□□ -1.39
SPIN3-241ENST00000640511 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.34□□□□□ -1.39
SPIN3-241ENST00000640511 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.32□□□□□ -1.4
SPIN3-241ENST00000640511 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SPIN3-241ENST00000640511 A0A0D9SG42 100 aa6.28□□□□□ -1.4
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.27□□□□□ -1.41
SPIN3-241ENST00000640511 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SPIN3-241ENST00000640511 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.24□□□□□ -1.41
SPIN3-241ENST00000640511 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.22□□□□□ -1.41
SPIN3-241ENST00000640511 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.19□□□□□ -1.42
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.19□□□□□ -1.42
SPIN3-241ENST00000640511 KMT2AQ03164 3969 aa6.18□□□□□ -1.42
SPIN3-241ENST00000640511 S4R3F8 94 aa6.15□□□□□ -1.43
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
SPIN3-241ENST00000640511 DNAH2Q9P225 4427 aa6.1□□□□□ -1.43
SPIN3-241ENST00000640511 XP32Q5T750 250 aa6.09□□□□□ -1.43
SPIN3-241ENST00000640511 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.08□□□□□ -1.44
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP12-2P59991 146 aa6.07□□□□□ -1.44
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.06□□□□□ -1.44
SPIN3-241ENST00000640511 PLAC4Q8WY50 150 aa6.05□□□□□ -1.44
SPIN3-241ENST00000640511 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.04□□□□□ -1.44
SPIN3-241ENST00000640511 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.03□□□□□ -1.44
SPIN3-241ENST00000640511 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.03□□□□□ -1.44
SPIN3-241ENST00000640511 KRTAP10-2P60368 255 aa6.02□□□□□ -1.45
SPIN3-241ENST00000640511 C9orf92A6NGG3 77 aa5.97□□□□□ -1.45
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