RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584582.5

TOP3A-217, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 5

Gene TOP3A, Length 3,661 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-217ENST00000584582 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-217ENST00000584582 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-217ENST00000584582 C9orf92A6NGG3 77 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-217ENST00000584582 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-217ENST00000584582 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP3A-217ENST00000584582 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-217ENST00000584582 COA5Q86WW8 74 aa6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-217ENST00000584582 PMAIP1Q13794 54 aa6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-217ENST00000584582 LIMD2Q9BT23 127 aa6.65□□□□□ -1.35
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TOP3A-217ENST00000584582 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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TOP3A-217ENST00000584582 CD164Q04900 197 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP3A-217ENST00000584582 H3BPC8 53 aa6.61□□□□□ -1.35
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TOP3A-217ENST00000584582 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.59□□□□□ -1.35
TOP3A-217ENST00000584582 Q5W150 140 aa6.59□□□□□ -1.35
TOP3A-217ENST00000584582 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TOP3A-217ENST00000584582 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.58□□□□□ -1.36
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TOP3A-217ENST00000584582 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.57□□□□□ -1.36
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TOP3A-217ENST00000584582 FAM229AH3BQW9 127 aa6.56□□□□□ -1.36
TOP3A-217ENST00000584582 Q8N1X5 172 aa6.55□□□□□ -1.36
TOP3A-217ENST00000584582 C8orf87E5RJ46 101 aa6.54□□□□□ -1.36
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TOP3A-217ENST00000584582 HRES1P13985 223 aa6.52□□□□□ -1.37
TOP3A-217ENST00000584582 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.52□□□□□ -1.37
TOP3A-217ENST00000584582 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.51□□□□□ -1.37
TOP3A-217ENST00000584582 A8MU10 97 aa6.51□□□□□ -1.37
TOP3A-217ENST00000584582 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.5□□□□□ -1.37
TOP3A-217ENST00000584582 LCE6AA0A183 80 aa6.5□□□□□ -1.37
TOP3A-217ENST00000584582 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.49□□□□□ -1.37
TOP3A-217ENST00000584582 Q1T7F1 81 aa6.47□□□□□ -1.37
TOP3A-217ENST00000584582 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.47□□□□□ -1.37
TOP3A-217ENST00000584582 A0A1B0GU69 56 aa6.45□□□□□ -1.38
TOP3A-217ENST00000584582 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.44□□□□□ -1.38
TOP3A-217ENST00000584582 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.41□□□□□ -1.38
TOP3A-217ENST00000584582 Q5VV11 94 aa6.41□□□□□ -1.38
TOP3A-217ENST00000584582 Q6ZSA8 131 aa6.41□□□□□ -1.38
TOP3A-217ENST00000584582 SPINK7P58062 85 aa6.36□□□□□ -1.39
TOP3A-217ENST00000584582 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.36□□□□□ -1.39
TOP3A-217ENST00000584582 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.35□□□□□ -1.39
TOP3A-217ENST00000584582 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.33□□□□□ -1.4
TOP3A-217ENST00000584582 Q5VSD8 79 aa6.33□□□□□ -1.4
TOP3A-217ENST00000584582 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.31□□□□□ -1.4
TOP3A-217ENST00000584582 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.31□□□□□ -1.4
TOP3A-217ENST00000584582 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.31□□□□□ -1.4
TOP3A-217ENST00000584582 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.3□□□□□ -1.4
TOP3A-217ENST00000584582 DNAH2Q9P225 4427 aa6.29□□□□□ -1.4
TOP3A-217ENST00000584582 LCA10Q71F78 164 aa6.29□□□□□ -1.4
TOP3A-217ENST00000584582 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.29□□□□□ -1.4
TOP3A-217ENST00000584582 FAT1Q14517 4588 aa6.29□□□□□ -1.4
TOP3A-217ENST00000584582 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.27□□□□□ -1.41
TOP3A-217ENST00000584582 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.27□□□□□ -1.41
TOP3A-217ENST00000584582 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.26□□□□□ -1.41
TOP3A-217ENST00000584582 DMAC1Q96GE9 116 aa6.25□□□□□ -1.41
TOP3A-217ENST00000584582 Q75L30 129 aa6.25□□□□□ -1.41
TOP3A-217ENST00000584582 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.25□□□□□ -1.41
TOP3A-217ENST00000584582 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.24□□□□□ -1.41
TOP3A-217ENST00000584582 UQCR11O14957 56 aa6.22□□□□□ -1.41
TOP3A-217ENST00000584582 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.22□□□□□ -1.41
TOP3A-217ENST00000584582 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.22□□□□□ -1.41
TOP3A-217ENST00000584582 PRAC1Q96KF2 57 aa6.22□□□□□ -1.41
TOP3A-217ENST00000584582 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.22□□□□□ -1.41
TOP3A-217ENST00000584582 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.2□□□□□ -1.42
TOP3A-217ENST00000584582 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.18□□□□□ -1.42
TOP3A-217ENST00000584582 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.16□□□□□ -1.42
TOP3A-217ENST00000584582 A0A0D9SG42 100 aa6.15□□□□□ -1.42
TOP3A-217ENST00000584582 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TOP3A-217ENST00000584582 PKHD1P08F94 4074 aa6.14□□□□□ -1.43
TOP3A-217ENST00000584582 A0A1B0GVY2 172 aa6.13□□□□□ -1.43
TOP3A-217ENST00000584582 J3QL48 77 aa6.13□□□□□ -1.43
TOP3A-217ENST00000584582 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.12□□□□□ -1.43
TOP3A-217ENST00000584582 A6NN06 94 aa6.1□□□□□ -1.43
TOP3A-217ENST00000584582 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.1□□□□□ -1.43
TOP3A-217ENST00000584582 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TOP3A-217ENST00000584582 K7ERS5 55 aa6.09□□□□□ -1.43
TOP3A-217ENST00000584582 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.08□□□□□ -1.44
TOP3A-217ENST00000584582 MYCBP2O75592 4640 aa6.08□□□□□ -1.44
TOP3A-217ENST00000584582 A0A1B0GU33 70 aa6.06□□□□□ -1.44
TOP3A-217ENST00000584582 H3BS24 57 aa6.06□□□□□ -1.44
TOP3A-217ENST00000584582 CRIPTQ9P021 101 aa6.04□□□□□ -1.44
TOP3A-217ENST00000584582 A8MUU9 505 aa6.04□□□□□ -1.44
TOP3A-217ENST00000584582 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TOP3A-217ENST00000584582 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.03□□□□□ -1.44
TOP3A-217ENST00000584582 LINC01554Q52M75 96 aa6.02□□□□□ -1.45
TOP3A-217ENST00000584582 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.02□□□□□ -1.45
TOP3A-217ENST00000584582 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
TOP3A-217ENST00000584582 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
TOP3A-217ENST00000584582 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.99□□□□□ -1.45
TOP3A-217ENST00000584582 SACSQ9NZJ4 4579 aa5.99□□□□□ -1.45
TOP3A-217ENST00000584582 CSAG1Q6PB30 78 aa5.96□□□□□ -1.46
TOP3A-217ENST00000584582 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TOP3A-217ENST00000584582 XP32Q5T750 250 aa5.95□□□□□ -1.46
TOP3A-217ENST00000584582 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.95□□□□□ -1.46
TOP3A-217ENST00000584582 S4R3F8 94 aa5.95□□□□□ -1.46
TOP3A-217ENST00000584582 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.95□□□□□ -1.46
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