RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-212ENST00000491266 TNXBP22105 4242 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-212ENST00000491266 DSCR10P59022 87 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-212ENST00000491266 Q6ZQT0 140 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-212ENST00000491266 TEN1Q86WV5 123 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-212ENST00000491266 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-212ENST00000491266 CRYGAP11844 174 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-212ENST00000491266 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-212ENST00000491266 SNCGO76070 127 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-212ENST00000491266 RBM3P98179 157 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-212ENST00000491266 H3BQ85 93 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGGTB-212ENST00000491266 C9orf153Q5TBE3 101 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGGTB-212ENST00000491266 HRCT1Q6UXD1 115 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGGTB-212ENST00000491266 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGGTB-212ENST00000491266 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-212ENST00000491266 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-212ENST00000491266 CCKP06307 115 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-212ENST00000491266 LCE1EQ5T753 118 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-212ENST00000491266 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGGTB-212ENST00000491266 Q6JHZ5 121 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-212ENST00000491266 Q6Q795 121 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-212ENST00000491266 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-212ENST00000491266 F8WEM9 126 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-212ENST00000491266 OXTP01178 125 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-212ENST00000491266 Q96NJ1 140 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-212ENST00000491266 LINC00846Q9NV44 126 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-212ENST00000491266 A0A087WSZ3 146 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-212ENST00000491266 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-212ENST00000491266 DSCR8Q96T75 97 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-212ENST00000491266 HERC1Q15751 4861 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-212ENST00000491266 CD164Q04900 197 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-212ENST00000491266 VPS25Q9BRG1 176 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-212ENST00000491266 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP10-5P60370 271 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-212ENST00000491266 C1orf195Q5TG92 126 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-212ENST00000491266 Q5XG85 94 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-212ENST00000491266 PDE6GP18545 87 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-212ENST00000491266 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-212ENST00000491266 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-212ENST00000491266 SPINK1P00995 79 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-212ENST00000491266 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-212ENST00000491266 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-212ENST00000491266 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-212ENST00000491266 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-212ENST00000491266 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-212ENST00000491266 A0A1B0GW54 56 aa3.38□□□□□ -1.87
RABGGTB-212ENST00000491266 CXCL6P80162 114 aa3.38□□□□□ -1.87
RABGGTB-212ENST00000491266 Q8N9L7 120 aa3.38□□□□□ -1.87
RABGGTB-212ENST00000491266 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.37□□□□□ -1.87
RABGGTB-212ENST00000491266 NREPQ16612 68 aa3.37□□□□□ -1.87
RABGGTB-212ENST00000491266 BPY2O14599 106 aa3.36□□□□□ -1.87
RABGGTB-212ENST00000491266 MT-ATP8P03928 68 aa3.36□□□□□ -1.87
RABGGTB-212ENST00000491266 ACYP1P07311 99 aa3.36□□□□□ -1.87
RABGGTB-212ENST00000491266 K7EQZ3 153 aa3.35□□□□□ -1.87
RABGGTB-212ENST00000491266 IGKV4-1P06312 121 aa3.35□□□□□ -1.87
RABGGTB-212ENST00000491266 LIMD2Q9BT23 127 aa3.35□□□□□ -1.87
RABGGTB-212ENST00000491266 K7ERU9 68 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-212ENST00000491266 LINC00643Q86TS7 51 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-212ENST00000491266 UBL5Q9BZL1 73 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-212ENST00000491266 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-212ENST00000491266 A8MWP4 228 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-212ENST00000491266 J3QR89 54 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-212ENST00000491266 SIGMAR1Q99720 223 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-212ENST00000491266 LPAP08519 4548 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-212ENST00000491266 A0A087WVE0 104 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-212ENST00000491266 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-212ENST00000491266 A0A1B0GVX0 72 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-212ENST00000491266 PRR15Q8IV56 129 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-212ENST00000491266 LRP2P98164 4655 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-212ENST00000491266 C9orf92A6NGG3 77 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-212ENST00000491266 PRR4Q16378 134 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-212ENST00000491266 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-212ENST00000491266 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-212ENST00000491266 J3KT08 172 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-212ENST00000491266 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-212ENST00000491266 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-212ENST00000491266 TPRXLQ17RH7 258 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-212ENST00000491266 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-212ENST00000491266 A8MUU9 505 aa3.26□□□□□ -1.89
RABGGTB-212ENST00000491266 LINC00313P59037 77 aa3.26□□□□□ -1.89
RABGGTB-212ENST00000491266 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RABGGTB-212ENST00000491266 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.26□□□□□ -1.89
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.26□□□□□ -1.89
RABGGTB-212ENST00000491266 HCG22E2RYF7 251 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-212ENST00000491266 C8orf87E5RJ46 101 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-212ENST00000491266 Q5W150 140 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-212ENST00000491266 hDV103S1A0JD37 113 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-212ENST00000491266 NDUFB1O75438 58 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-212ENST00000491266 CASC2Q6XLA1 102 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-212ENST00000491266 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-212ENST00000491266 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-212ENST00000491266 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-212ENST00000491266 IMUPQ9GZP8 106 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-212ENST00000491266 A8MU10 97 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-212ENST00000491266 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-212ENST00000491266 MUC17Q685J3 4493 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75 ms