RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468468.5

TSPAN4-211, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 2,777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-211ENST00000468468 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa9.48□□□□□ -0.89
TSPAN4-211ENST00000468468 LY6G6CO95867 125 aa9.48□□□□□ -0.89
TSPAN4-211ENST00000468468 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.48□□□□□ -0.89
TSPAN4-211ENST00000468468 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.47□□□□□ -0.89
TSPAN4-211ENST00000468468 RTL8CO15255 209 aa9.47□□□□□ -0.89
TSPAN4-211ENST00000468468 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.47□□□□□ -0.89
TSPAN4-211ENST00000468468 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.46□□□□□ -0.9
TSPAN4-211ENST00000468468 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa9.46□□□□□ -0.9
TSPAN4-211ENST00000468468 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa9.46□□□□□ -0.9
TSPAN4-211ENST00000468468 NDUFS5O43920 106 aa9.46□□□□□ -0.9
TSPAN4-211ENST00000468468 Q75L30 129 aa9.45□□□□□ -0.9
TSPAN4-211ENST00000468468 DNAH17Q9UFH2 4485 aa9.45□□□□□ -0.9
TSPAN4-211ENST00000468468 A0A1B0GVX0 72 aa9.44□□□□□ -0.9
TSPAN4-211ENST00000468468 PCOTHQ58A44 107 aa9.44□□□□□ -0.9
TSPAN4-211ENST00000468468 C1orf134Q5TEV5 83 aa9.44□□□□□ -0.9
TSPAN4-211ENST00000468468 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.43□□□□□ -0.9
TSPAN4-211ENST00000468468 CDK2AP2O75956 126 aa9.43□□□□□ -0.9
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF861PO60384 105 aa9.42□□□□□ -0.9
TSPAN4-211ENST00000468468 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.41□□□□□ -0.9
TSPAN4-211ENST00000468468 C7orf65Q6ZTY9 151 aa9.41□□□□□ -0.9
TSPAN4-211ENST00000468468 COA5Q86WW8 74 aa9.41□□□□□ -0.9
TSPAN4-211ENST00000468468 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa9.39□□□□□ -0.91
TSPAN4-211ENST00000468468 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa9.38□□□□□ -0.91
TSPAN4-211ENST00000468468 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TSPAN4-211ENST00000468468 C8orf87E5RJ46 101 aa9.37□□□□□ -0.91
TSPAN4-211ENST00000468468 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.37□□□□□ -0.91
TSPAN4-211ENST00000468468 A0A087X002 238 aa9.37□□□□□ -0.91
TSPAN4-211ENST00000468468 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.37□□□□□ -0.91
TSPAN4-211ENST00000468468 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9.36□□□□□ -0.91
TSPAN4-211ENST00000468468 SPINK7P58062 85 aa9.34□□□□□ -0.91
TSPAN4-211ENST00000468468 FRAS1Q86XX4 4008 aa9.34□□□□□ -0.91
TSPAN4-211ENST00000468468 H3BS24 57 aa9.33□□□□□ -0.92
TSPAN4-211ENST00000468468 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.33□□□□□ -0.92
TSPAN4-211ENST00000468468 PRAC1Q96KF2 57 aa9.33□□□□□ -0.92
TSPAN4-211ENST00000468468 HYDINQ4G0P3 5121 aa9.32□□□□□ -0.92
TSPAN4-211ENST00000468468 DNAH6Q9C0G6 4158 aa9.31□□□□□ -0.92
TSPAN4-211ENST00000468468 IGLV7-43P04211 117 aa9.3□□□□□ -0.92
TSPAN4-211ENST00000468468 KRTAP10-2P60368 255 aa9.3□□□□□ -0.92
TSPAN4-211ENST00000468468 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.29□□□□□ -0.92
TSPAN4-211ENST00000468468 DNAH5Q8TE73 4624 aa9.29□□□□□ -0.92
TSPAN4-211ENST00000468468 DNAH11Q96DT5 4516 aa9.28□□□□□ -0.92
TSPAN4-211ENST00000468468 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.26□□□□□ -0.93
TSPAN4-211ENST00000468468 LINC00313P59037 77 aa9.25□□□□□ -0.93
TSPAN4-211ENST00000468468 ALMS1Q8TCU4 4167 aa9.25□□□□□ -0.93
TSPAN4-211ENST00000468468 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.24□□□□□ -0.93
TSPAN4-211ENST00000468468 Q5W150 140 aa9.24□□□□□ -0.93
TSPAN4-211ENST00000468468 HRES1P13985 223 aa9.23□□□□□ -0.93
TSPAN4-211ENST00000468468 FAT2Q9NYQ8 4349 aa9.21□□□□□ -0.94
TSPAN4-211ENST00000468468 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.2□□□□□ -0.94
TSPAN4-211ENST00000468468 PKD1P98161 4303 aa9.18□□□□□ -0.94
TSPAN4-211ENST00000468468 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa9.18□□□□□ -0.94
TSPAN4-211ENST00000468468 KRTAP10-1P60331 282 aa9.16□□□□□ -0.94
TSPAN4-211ENST00000468468 LRP1BQ9NZR2 4599 aa9.13□□□□□ -0.95
TSPAN4-211ENST00000468468 Q6ZSA8 131 aa9.11□□□□□ -0.95
TSPAN4-211ENST00000468468 PRR26Q8N8Z3 221 aa9.1□□□□□ -0.95
TSPAN4-211ENST00000468468 SACSQ9NZJ4 4579 aa9.1□□□□□ -0.95
TSPAN4-211ENST00000468468 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.09□□□□□ -0.95
TSPAN4-211ENST00000468468 LINC01554Q52M75 96 aa9.09□□□□□ -0.95
TSPAN4-211ENST00000468468 RETNLBQ9BQ08 111 aa9.08□□□□□ -0.96
TSPAN4-211ENST00000468468 ACYP2P14621 99 aa9.07□□□□□ -0.96
TSPAN4-211ENST00000468468 FAM229AH3BQW9 127 aa9.06□□□□□ -0.96
TSPAN4-211ENST00000468468 A0A0A0MQY5 61 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN4-211ENST00000468468 PKHD1P08F94 4074 aa9.01□□□□□ -0.97
TSPAN4-211ENST00000468468 DMAC1Q96GE9 116 aa9.01□□□□□ -0.97
TSPAN4-211ENST00000468468 IGKV2-30P06310 120 aa9□□□□□ -0.97
TSPAN4-211ENST00000468468 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TSPAN4-211ENST00000468468 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.98□□□□□ -0.97
TSPAN4-211ENST00000468468 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.98□□□□□ -0.97
TSPAN4-211ENST00000468468 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.96□□□□□ -0.98
TSPAN4-211ENST00000468468 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN4-211ENST00000468468 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
TSPAN4-211ENST00000468468 CSAG1Q6PB30 78 aa8.89□□□□□ -0.99
TSPAN4-211ENST00000468468 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.88□□□□□ -0.99
TSPAN4-211ENST00000468468 A0A1B0GU69 56 aa8.85□□□□□ -0.99
TSPAN4-211ENST00000468468 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
TSPAN4-211ENST00000468468 RYR2Q92736 4967 aa8.84□□□□□ -0.99
TSPAN4-211ENST00000468468 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
TSPAN4-211ENST00000468468 A0A1B0GVY2 172 aa8.83□□□□□ -1
TSPAN4-211ENST00000468468 SPINK1P00995 79 aa8.83□□□□□ -1
TSPAN4-211ENST00000468468 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.81□□□□□ -1
TSPAN4-211ENST00000468468 FAT1Q14517 4588 aa8.79□□□□□ -1
TSPAN4-211ENST00000468468 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.78□□□□□ -1
TSPAN4-211ENST00000468468 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
TSPAN4-211ENST00000468468 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.74□□□□□ -1.01
TSPAN4-211ENST00000468468 UQCR11O14957 56 aa8.7□□□□□ -1.02
TSPAN4-211ENST00000468468 Q8N1X5 172 aa8.69□□□□□ -1.02
TSPAN4-211ENST00000468468 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TSPAN4-211ENST00000468468 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TSPAN4-211ENST00000468468 C9orf92A6NGG3 77 aa8.61□□□□□ -1.03
TSPAN4-211ENST00000468468 RYR3Q15413 4870 aa8.59□□□□□ -1.03
TSPAN4-211ENST00000468468 A8MUU9 505 aa8.56□□□□□ -1.04
TSPAN4-211ENST00000468468 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.55□□□□□ -1.04
TSPAN4-211ENST00000468468 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.54□□□□□ -1.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ROMO1P60602 79 aa8.52□□□□□ -1.05
TSPAN4-211ENST00000468468 HSPG2P98160 4391 aa8.48□□□□□ -1.05
TSPAN4-211ENST00000468468 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TSPAN4-211ENST00000468468 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.47□□□□□ -1.05
TSPAN4-211ENST00000468468 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.47□□□□□ -1.05
TSPAN4-211ENST00000468468 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
TSPAN4-211ENST00000468468 CRIPTQ9P021 101 aa8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.6 ms