RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 Q75L30 129 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-210ENST00000437078 UQCR11O14957 56 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-210ENST00000437078 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-210ENST00000437078 CRIPTQ9P021 101 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-210ENST00000437078 KRTAP10-2P60368 255 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-210ENST00000437078 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-210ENST00000437078 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-210ENST00000437078 SPRR4Q96PI1 79 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-210ENST00000437078 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF861PO60384 105 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-210ENST00000437078 A6NN06 94 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-210ENST00000437078 ACYP2P14621 99 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-210ENST00000437078 A8MWP4 228 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-210ENST00000437078 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-210ENST00000437078 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-210ENST00000437078 DNHD1Q96M86 4753 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-210ENST00000437078 IGLV7-43P04211 117 aa8.2□□□□□ -1.1
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RABGEF1-210ENST00000437078 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.2□□□□□ -1.1
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RABGEF1-210ENST00000437078 KRTAP10-1P60331 282 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-210ENST00000437078 Q6ZR54 194 aa8.16□□□□□ -1.1
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RABGEF1-210ENST00000437078 IGKV2-30P06310 120 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1B0GW54 56 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-210ENST00000437078 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-210ENST00000437078 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
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RABGEF1-210ENST00000437078 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-210ENST00000437078 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-210ENST00000437078 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-210ENST00000437078 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-210ENST00000437078 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.1□□□□□ -1.11
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RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1B0GVX0 72 aa8.08□□□□□ -1.12
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RABGEF1-210ENST00000437078 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.07□□□□□ -1.12
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RABGEF1-210ENST00000437078 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
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RABGEF1-210ENST00000437078 KMT2AQ03164 3969 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-210ENST00000437078 C9orf92A6NGG3 77 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-210ENST00000437078 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-210ENST00000437078 Q96NJ1 140 aa7.99□□□□□ -1.13
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RABGEF1-210ENST00000437078 MYCBP2O75592 4640 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-210ENST00000437078 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.37□□□□□ -1.23
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RABGEF1-210ENST00000437078 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-210ENST00000437078 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
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