RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 LINC00575Q6W349 94 aa3.63□□□□□ -1.83
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HOXD8-202ENST00000429017 SPRR1AP35321 89 aa3.62□□□□□ -1.83
HOXD8-202ENST00000429017 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.62□□□□□ -1.83
HOXD8-202ENST00000429017 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa3.62□□□□□ -1.83
HOXD8-202ENST00000429017 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
HOXD8-202ENST00000429017 Q8N377 158 aa3.62□□□□□ -1.83
HOXD8-202ENST00000429017 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.62□□□□□ -1.83
HOXD8-202ENST00000429017 ERC2-IT1O76042 136 aa3.61□□□□□ -1.83
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HOXD8-202ENST00000429017 C9orf153Q5TBE3 101 aa3.52□□□□□ -1.85
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HOXD8-202ENST00000429017 F8WEM9 126 aa3.52□□□□□ -1.85
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HOXD8-202ENST00000429017 NREPQ16612 68 aa3.47□□□□□ -1.85
HOXD8-202ENST00000429017 LIMD2Q9BT23 127 aa3.47□□□□□ -1.85
HOXD8-202ENST00000429017 M0R2T5 61 aa3.46□□□□□ -1.86
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HOXD8-202ENST00000429017 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa3.45□□□□□ -1.86
HOXD8-202ENST00000429017 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
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HOXD8-202ENST00000429017 Q6ZVQ6 151 aa3.45□□□□□ -1.86
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HOXD8-202ENST00000429017 ATOX1O00244 68 aa3.44□□□□□ -1.86
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HOXD8-202ENST00000429017 SMIM29Q86T20 159 aa3.44□□□□□ -1.86
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HOXD8-202ENST00000429017 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.37□□□□□ -1.87
HOXD8-202ENST00000429017 J3KT08 172 aa3.36□□□□□ -1.87
HOXD8-202ENST00000429017 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
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HOXD8-202ENST00000429017 IGKV4-1P06312 121 aa3.34□□□□□ -1.87
HOXD8-202ENST00000429017 Q75L30 129 aa3.34□□□□□ -1.87
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