RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WDFY4Q6ZS81 3184 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FRYQ5TBA9 3013 aa7.61□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP10-10P60014 251 aa7.6□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ITPR1Q14643 2758 aa7.6□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VPS13AQ96RL7 3174 aa7.55□□□□□ -1.2
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VCANP13611 3396 aa7.54□□□□□ -1.2
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa7.52□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LAMA1P25391 3075 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-207ENST00000428584 APCP25054 2843 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SZT2Q5T011 3432 aa7.48□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KALRNO60229 2985 aa7.47□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HIVEP1P15822 2718 aa7.47□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.44□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP12-2P59991 146 aa7.42□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.42□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPEGQ15772 3267 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LRBAP50851 2863 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FLNCQ14315 2725 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.35□□□□□ -1.23
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.34□□□□□ -1.23
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FRYLO94915 3013 aa7.32□□□□□ -1.24
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TENM4Q6N022 2769 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ATMQ13315 3056 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP12-1P59990 96 aa7.27□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TACC2O95359 2948 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COL6A3P12111 3177 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa7.21□□□□□ -1.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COL12A1Q99715 3063 aa7.21□□□□□ -1.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa7.2□□□□□ -1.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.18□□□□□ -1.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYO15AQ9UKN7 3530 aa7.17□□□□□ -1.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZZEF1O43149 2961 aa7.15□□□□□ -1.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EYSQ5T1H1 3165 aa7.15□□□□□ -1.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 REV3LO60673 3130 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 USP34Q70CQ2 3546 aa7.05□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.04□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa7.03□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TGP01266 2768 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TENM2Q9NT68 2774 aa6.98□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.95□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.95□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZANQ9Y493 2812 aa6.92□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.9□□□□□ -1.31
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 TENM3Q9P273 2699 aa6.85□□□□□ -1.31
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.79□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FBN2P35556 2912 aa6.78□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.74□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MT1HL1P0DM35 61 aa6.74□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.7□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.7□□□□□ -1.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP10-12P60413 245 aa6.67□□□□□ -1.34
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 PDZD2O15018 2839 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RELNP78509 3460 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LAMA5O15230 3695 aa6.58□□□□□ -1.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DMDP11532 3685 aa6.58□□□□□ -1.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.55□□□□□ -1.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.55□□□□□ -1.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MUC3AQ02505 3323 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP12-3P60328 96 aa6.48□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.47□□□□□ -1.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.43□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LCE3AQ5TA76 89 aa6.42□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VWFP04275 2813 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CUBNO60494 3623 aa6.28□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZFHX3Q15911 3703 aa6.28□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FBN3Q75N90 2809 aa6.23□□□□□ -1.41
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.21□□□□□ -1.41
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.11□□□□□ -1.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRTAP10-5P60370 271 aa6.07□□□□□ -1.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DNAH2Q9P225 4427 aa6.03□□□□□ -1.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.02□□□□□ -1.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CSMD2Q7Z408 3487 aa5.98□□□□□ -1.45
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