RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409109.5

NLRX1-202, Transcript of NLR family member X1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NLRX1, Length 4,092 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1-202ENST00000409109 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.58□□□□□ -0.88
NLRX1-202ENST00000409109 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
NLRX1-202ENST00000409109 LINC00313P59037 77 aa9.58□□□□□ -0.88
NLRX1-202ENST00000409109 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
NLRX1-202ENST00000409109 A6NN06 94 aa9.53□□□□□ -0.88
NLRX1-202ENST00000409109 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.52□□□□□ -0.89
NLRX1-202ENST00000409109 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.51□□□□□ -0.89
NLRX1-202ENST00000409109 MIR22HGQ0VDD5 57 aa9.5□□□□□ -0.89
NLRX1-202ENST00000409109 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.49□□□□□ -0.89
NLRX1-202ENST00000409109 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.48□□□□□ -0.89
NLRX1-202ENST00000409109 UQCR11O14957 56 aa9.48□□□□□ -0.89
NLRX1-202ENST00000409109 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
NLRX1-202ENST00000409109 ZNF861PO60384 105 aa9.46□□□□□ -0.9
NLRX1-202ENST00000409109 A0A087X002 238 aa9.45□□□□□ -0.9
NLRX1-202ENST00000409109 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.45□□□□□ -0.9
NLRX1-202ENST00000409109 LINC01554Q52M75 96 aa9.43□□□□□ -0.9
NLRX1-202ENST00000409109 H3BS24 57 aa9.41□□□□□ -0.9
NLRX1-202ENST00000409109 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
NLRX1-202ENST00000409109 SPRR1BP22528 89 aa9.39□□□□□ -0.91
NLRX1-202ENST00000409109 COL7A1Q02388 2944 aa9.37□□□□□ -0.91
NLRX1-202ENST00000409109 FBN3Q75N90 2809 aa9.37□□□□□ -0.91
NLRX1-202ENST00000409109 IGLV7-43P04211 117 aa9.37□□□□□ -0.91
NLRX1-202ENST00000409109 FAM229AH3BQW9 127 aa9.36□□□□□ -0.91
NLRX1-202ENST00000409109 KRTAP10-2P60368 255 aa9.36□□□□□ -0.91
NLRX1-202ENST00000409109 Q5W150 140 aa9.36□□□□□ -0.91
NLRX1-202ENST00000409109 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.35□□□□□ -0.91
NLRX1-202ENST00000409109 CSAG1Q6PB30 78 aa9.34□□□□□ -0.91
NLRX1-202ENST00000409109 Q6ZR54 194 aa9.33□□□□□ -0.92
NLRX1-202ENST00000409109 Q8N1X5 172 aa9.29□□□□□ -0.92
NLRX1-202ENST00000409109 K7ERS5 55 aa9.28□□□□□ -0.92
NLRX1-202ENST00000409109 Q96NJ1 140 aa9.24□□□□□ -0.93
NLRX1-202ENST00000409109 C9orf92A6NGG3 77 aa9.23□□□□□ -0.93
NLRX1-202ENST00000409109 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
NLRX1-202ENST00000409109 KRTAP10-1P60331 282 aa9.22□□□□□ -0.93
NLRX1-202ENST00000409109 CRIPTQ9P021 101 aa9.2□□□□□ -0.94
NLRX1-202ENST00000409109 ANK2Q01484 3957 aa9.19□□□□□ -0.94
NLRX1-202ENST00000409109 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.19□□□□□ -0.94
NLRX1-202ENST00000409109 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.17□□□□□ -0.94
NLRX1-202ENST00000409109 DMAC1Q96GE9 116 aa9.15□□□□□ -0.94
NLRX1-202ENST00000409109 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa9.15□□□□□ -0.95
NLRX1-202ENST00000409109 SPATA8Q6RVD6 105 aa9.1□□□□□ -0.95
NLRX1-202ENST00000409109 LINC00304Q8N9R0 145 aa9.09□□□□□ -0.95
NLRX1-202ENST00000409109 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.06□□□□□ -0.96
NLRX1-202ENST00000409109 LINC00483Q53H64 154 aa9.05□□□□□ -0.96
NLRX1-202ENST00000409109 SPINT4Q6UDR6 99 aa9.02□□□□□ -0.96
NLRX1-202ENST00000409109 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.01□□□□□ -0.97
NLRX1-202ENST00000409109 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
NLRX1-202ENST00000409109 A0A1B0GU33 70 aa8.97□□□□□ -0.97
NLRX1-202ENST00000409109 A0A0D9SG42 100 aa8.94□□□□□ -0.98
NLRX1-202ENST00000409109 DNHD1Q96M86 4753 aa8.9□□□□□ -0.98
NLRX1-202ENST00000409109 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.88□□□□□ -0.99
NLRX1-202ENST00000409109 LYSTQ99698 3801 aa8.88□□□□□ -0.99
NLRX1-202ENST00000409109 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.86□□□□□ -0.99
NLRX1-202ENST00000409109 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.81□□□□□ -1
NLRX1-202ENST00000409109 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.8□□□□□ -1
NLRX1-202ENST00000409109 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.78□□□□□ -1
NLRX1-202ENST00000409109 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
NLRX1-202ENST00000409109 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.77□□□□□ -1.01
NLRX1-202ENST00000409109 J3QL48 77 aa8.73□□□□□ -1.01
NLRX1-202ENST00000409109 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
NLRX1-202ENST00000409109 ROMO1P60602 79 aa8.72□□□□□ -1.01
NLRX1-202ENST00000409109 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.71□□□□□ -1.01
NLRX1-202ENST00000409109 Q6ZSA8 131 aa8.71□□□□□ -1.01
NLRX1-202ENST00000409109 Q5VSD8 79 aa8.69□□□□□ -1.02
NLRX1-202ENST00000409109 H0YAA0 97 aa8.66□□□□□ -1.02
NLRX1-202ENST00000409109 A8MUU9 505 aa8.65□□□□□ -1.02
NLRX1-202ENST00000409109 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.65□□□□□ -1.02
NLRX1-202ENST00000409109 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.64□□□□□ -1.03
NLRX1-202ENST00000409109 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.62□□□□□ -1.03
NLRX1-202ENST00000409109 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.59□□□□□ -1.03
NLRX1-202ENST00000409109 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.57□□□□□ -1.04
NLRX1-202ENST00000409109 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NLRX1-202ENST00000409109 KMT2AQ03164 3969 aa8.54□□□□□ -1.04
NLRX1-202ENST00000409109 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.52□□□□□ -1.05
NLRX1-202ENST00000409109 NDUFAF8A1L188 74 aa8.49□□□□□ -1.05
NLRX1-202ENST00000409109 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.46□□□□□ -1.05
NLRX1-202ENST00000409109 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.44□□□□□ -1.06
NLRX1-202ENST00000409109 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.4□□□□□ -1.07
NLRX1-202ENST00000409109 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.37□□□□□ -1.07
NLRX1-202ENST00000409109 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.34□□□□□ -1.08
NLRX1-202ENST00000409109 S4R3F8 94 aa8.31□□□□□ -1.08
NLRX1-202ENST00000409109 DNAH2Q9P225 4427 aa8.27□□□□□ -1.09
NLRX1-202ENST00000409109 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.25□□□□□ -1.09
NLRX1-202ENST00000409109 P0C880 135 aa8.25□□□□□ -1.09
NLRX1-202ENST00000409109 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.23□□□□□ -1.09
NLRX1-202ENST00000409109 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.23□□□□□ -1.09
NLRX1-202ENST00000409109 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.21□□□□□ -1.09
NLRX1-202ENST00000409109 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.21□□□□□ -1.1
NLRX1-202ENST00000409109 FAT1Q14517 4588 aa8.2□□□□□ -1.1
NLRX1-202ENST00000409109 A0A1B0GVY2 172 aa8.19□□□□□ -1.1
NLRX1-202ENST00000409109 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.17□□□□□ -1.1
NLRX1-202ENST00000409109 TPRXLQ17RH7 258 aa8.15□□□□□ -1.1
NLRX1-202ENST00000409109 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
NLRX1-202ENST00000409109 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
NLRX1-202ENST00000409109 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.14□□□□□ -1.11
NLRX1-202ENST00000409109 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.13□□□□□ -1.11
NLRX1-202ENST00000409109 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.12□□□□□ -1.11
NLRX1-202ENST00000409109 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.11□□□□□ -1.11
NLRX1-202ENST00000409109 XP32Q5T750 250 aa8.07□□□□□ -1.12
NLRX1-202ENST00000409109 LUZP6Q538Z0 58 aa8.06□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.7 ms