RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409109.5

NLRX1-202, Transcript of NLR family member X1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NLRX1, Length 4,092 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1-202ENST00000409109 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.01■■■□□ 2.24
NLRX1-202ENST00000409109 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.74■■■□□ 2.03
NLRX1-202ENST00000409109 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.03■■□□□ 1.92
NLRX1-202ENST00000409109 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
NLRX1-202ENST00000409109 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.79■■□□□ 1.72
NLRX1-202ENST00000409109 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.7■■□□□ 1.7
NLRX1-202ENST00000409109 HRCP23327 699 aa25.53■■□□□ 1.68
NLRX1-202ENST00000409109 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
NLRX1-202ENST00000409109 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
NLRX1-202ENST00000409109 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
NLRX1-202ENST00000409109 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.76■■□□□ 1.55
NLRX1-202ENST00000409109 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.69■■□□□ 1.54
NLRX1-202ENST00000409109 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
NLRX1-202ENST00000409109 TRIM41Q8WV44 630 aa24.58■■□□□ 1.52
NLRX1-202ENST00000409109 ABCC9O60706 1549 aa24.51■■□□□ 1.51
NLRX1-202ENST00000409109 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
NLRX1-202ENST00000409109 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
NLRX1-202ENST00000409109 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
NLRX1-202ENST00000409109 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.29■■□□□ 1.48
NLRX1-202ENST00000409109 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.2■■□□□ 1.46
NLRX1-202ENST00000409109 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
NLRX1-202ENST00000409109 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
NLRX1-202ENST00000409109 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
NLRX1-202ENST00000409109 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
NLRX1-202ENST00000409109 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
NLRX1-202ENST00000409109 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
NLRX1-202ENST00000409109 MYT1Q01538 1121 aa24■■□□□ 1.43
NLRX1-202ENST00000409109 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
NLRX1-202ENST00000409109 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.92■■□□□ 1.42
NLRX1-202ENST00000409109 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
NLRX1-202ENST00000409109 SCRIBQ14160 1630 aa23.77■■□□□ 1.4
NLRX1-202ENST00000409109 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
NLRX1-202ENST00000409109 NEUROD1Q13562 356 aa23.72■■□□□ 1.39
NLRX1-202ENST00000409109 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
NLRX1-202ENST00000409109 APLP2Q06481 763 aa23.69■■□□□ 1.38
NLRX1-202ENST00000409109 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.65■■□□□ 1.38
NLRX1-202ENST00000409109 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
NLRX1-202ENST00000409109 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
NLRX1-202ENST00000409109 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
NLRX1-202ENST00000409109 ITGAEP38570 1179 aa23.24■■□□□ 1.31
NLRX1-202ENST00000409109 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.18■■□□□ 1.3
NLRX1-202ENST00000409109 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
NLRX1-202ENST00000409109 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.97■■□□□ 1.27
NLRX1-202ENST00000409109 NACADO15069 1562 aa22.93■■□□□ 1.26
NLRX1-202ENST00000409109 BCANQ96GW7 911 aa22.92■■□□□ 1.26
NLRX1-202ENST00000409109 MIER1Q8N108 512 aa22.91■■□□□ 1.26
NLRX1-202ENST00000409109 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.86■■□□□ 1.25
NLRX1-202ENST00000409109 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.81■■□□□ 1.24
NLRX1-202ENST00000409109 P3H3Q8IVL6 736 aa22.81■■□□□ 1.24
NLRX1-202ENST00000409109 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.79■■□□□ 1.24
NLRX1-202ENST00000409109 NEFLP07196 543 aa22.71■■□□□ 1.23
NLRX1-202ENST00000409109 ARID3CA6NKF2 412 aa22.62■■□□□ 1.21
NLRX1-202ENST00000409109 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
NLRX1-202ENST00000409109 WIZO95785 1651 aa22.5■■□□□ 1.19
NLRX1-202ENST00000409109 SOGA1O94964 1423 aa22.49■■□□□ 1.19
NLRX1-202ENST00000409109 ABCC8Q09428 1581 aa22.46■■□□□ 1.19
NLRX1-202ENST00000409109 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
NLRX1-202ENST00000409109 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.44■■□□□ 1.18
NLRX1-202ENST00000409109 BCL11AQ9H165 835 aa22.43■■□□□ 1.18
NLRX1-202ENST00000409109 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
NLRX1-202ENST00000409109 FKBP8Q14318 412 aa22.4■■□□□ 1.18
NLRX1-202ENST00000409109 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
NLRX1-202ENST00000409109 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.39■■□□□ 1.17
NLRX1-202ENST00000409109 FBLN2P98095 1184 aa22.36■■□□□ 1.17
NLRX1-202ENST00000409109 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
NLRX1-202ENST00000409109 CEP162Q5TB80 1403 aa22.33■■□□□ 1.17
NLRX1-202ENST00000409109 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NLRX1-202ENST00000409109 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.22■■□□□ 1.15
NLRX1-202ENST00000409109 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.21■■□□□ 1.15
NLRX1-202ENST00000409109 CLIP1P30622 1438 aa22.21■■□□□ 1.15
NLRX1-202ENST00000409109 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.19■■□□□ 1.14
NLRX1-202ENST00000409109 TRIM52Q96A61 297 aa22.15■■□□□ 1.14
NLRX1-202ENST00000409109 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.15■■□□□ 1.14
NLRX1-202ENST00000409109 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NLRX1-202ENST00000409109 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.06■■□□□ 1.12
NLRX1-202ENST00000409109 SMARCA4P51532 1647 aa22.06■■□□□ 1.12
NLRX1-202ENST00000409109 GOLGA3Q08378 1498 aa22.05■■□□□ 1.12
NLRX1-202ENST00000409109 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NLRX1-202ENST00000409109 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.03■■□□□ 1.12
NLRX1-202ENST00000409109 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NLRX1-202ENST00000409109 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NLRX1-202ENST00000409109 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.99■■□□□ 1.11
NLRX1-202ENST00000409109 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.96■■□□□ 1.11
NLRX1-202ENST00000409109 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.96■■□□□ 1.11
NLRX1-202ENST00000409109 ANP32CO43423 234 aa21.96■■□□□ 1.11
NLRX1-202ENST00000409109 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
NLRX1-202ENST00000409109 KCNH8Q96L42 1107 aa21.95■■□□□ 1.1
NLRX1-202ENST00000409109 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
NLRX1-202ENST00000409109 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
NLRX1-202ENST00000409109 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
NLRX1-202ENST00000409109 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
NLRX1-202ENST00000409109 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.9■■□□□ 1.1
NLRX1-202ENST00000409109 EEA1Q15075 1411 aa21.89■■□□□ 1.09
NLRX1-202ENST00000409109 NBR1Q14596 966 aa21.87■■□□□ 1.09
NLRX1-202ENST00000409109 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.87■■□□□ 1.09
NLRX1-202ENST00000409109 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
NLRX1-202ENST00000409109 KIF27Q86VH2 1401 aa21.82■■□□□ 1.08
NLRX1-202ENST00000409109 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
NLRX1-202ENST00000409109 CUX2O14529 1486 aa21.78■■□□□ 1.08
NLRX1-202ENST00000409109 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.77■■□□□ 1.08
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