RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 M0QZ58 72 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRM-202ENST00000400053 ITPR2Q14571 2701 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRM-202ENST00000400053 ZANQ9Y493 2812 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRM-202ENST00000400053 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRM-202ENST00000400053 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRM-202ENST00000400053 APCP25054 2843 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-202ENST00000400053 A8MU10 97 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-202ENST00000400053 Q6ZR54 194 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-202ENST00000400053 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP5.23□□□□□ -1.57
PTPRM-202ENST00000400053 HIVEP1P15822 2718 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRM-202ENST00000400053 RELNP78509 3460 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRM-202ENST00000400053 A0A087X002 238 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRM-202ENST00000400053 Q5VSD8 79 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRM-202ENST00000400053 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRM-202ENST00000400053 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRM-202ENST00000400053 PANO1I0J062 215 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRM-202ENST00000400053 CELSR2Q9HCU4 2923 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRM-202ENST00000400053 A6NN06 94 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRM-202ENST00000400053 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRM-202ENST00000400053 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRM-202ENST00000400053 LCE6AA0A183 80 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRM-202ENST00000400053 BSNQ9UPA5 3926 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRM-202ENST00000400053 NF1P21359 2839 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRM-202ENST00000400053 FBN2P35556 2912 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRM-202ENST00000400053 DCHS2Q6V1P9 2916 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-202ENST00000400053 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP10-1P60331 282 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRM-202ENST00000400053 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-202ENST00000400053 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP10-2P60368 255 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRM-202ENST00000400053 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRM-202ENST00000400053 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRM-202ENST00000400053 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRM-202ENST00000400053 MXRA5Q9NR99 2828 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRM-202ENST00000400053 A8MUU9 505 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-202ENST00000400053 TNP1P09430 55 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-202ENST00000400053 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRM-202ENST00000400053 TENM4Q6N022 2769 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRM-202ENST00000400053 NDUFAF8A1L188 74 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRM-202ENST00000400053 TENM3Q9P273 2699 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRM-202ENST00000400053 PP632Q6XCG6 107 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRM-202ENST00000400053 ZFHX3Q15911 3703 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRM-202ENST00000400053 VPS13CQ709C8 3753 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRM-202ENST00000400053 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRM-202ENST00000400053 CSMD2Q7Z408 3487 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRM-202ENST00000400053 PDZD2O15018 2839 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-202ENST00000400053 CUBNO60494 3623 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-202ENST00000400053 TENM1Q9UKZ4 2725 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-202ENST00000400053 TGP01266 2768 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP10-8P60410 259 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-202ENST00000400053 H0YAA0 97 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-202ENST00000400053 VWFP04275 2813 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-202ENST00000400053 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-202ENST00000400053 P0C880 135 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-202ENST00000400053 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-202ENST00000400053 OTOGQ6ZRI0 2925 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRM-202ENST00000400053 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRM-202ENST00000400053 TENM2Q9NT68 2774 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-202ENST00000400053 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-202ENST00000400053 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-202ENST00000400053 XP32Q5T750 250 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRM-202ENST00000400053 TPRXLQ17RH7 258 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP10-10P60014 251 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRM-202ENST00000400053 AKAP9Q99996 3911 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1B0GVY2 172 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRM-202ENST00000400053 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRM-202ENST00000400053 FBN3Q75N90 2809 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRM-202ENST00000400053 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP12-2P59991 146 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-202ENST00000400053 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-202ENST00000400053 COL7A1Q02388 2944 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP12-1P59990 96 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRM-202ENST00000400053 ANK2Q01484 3957 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRM-202ENST00000400053 INE1O15225 51 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRM-202ENST00000400053 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRM-202ENST00000400053 MT1HL1P0DM35 61 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRM-202ENST00000400053 LYSTQ99698 3801 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRM-202ENST00000400053 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRM-202ENST00000400053 DNAH9Q9NYC9 4486 aa4.06□□□□□ -1.76
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