RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 NISCHQ9Y2I1 1504 aa15.48■□□□□ 0.07
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PTPRM-202ENST00000400053 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRM-202ENST00000400053 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
PTPRM-202ENST00000400053 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa14.33□□□□□ -0.11
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PTPRM-202ENST00000400053 PCGF6Q9BYE7 350 aa13.95□□□□□ -0.18
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PTPRM-202ENST00000400053 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
PTPRM-202ENST00000400053 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
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PTPRM-202ENST00000400053 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRM-202ENST00000400053 HRCP23327 699 aa13.35□□□□□ -0.27
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PTPRM-202ENST00000400053 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
PTPRM-202ENST00000400053 NEUROD1Q13562 356 aa12.45□□□□□ -0.42
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PTPRM-202ENST00000400053 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
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PTPRM-202ENST00000400053 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP12.12□□□□□ -0.47
PTPRM-202ENST00000400053 MIER1Q8N108 512 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRM-202ENST00000400053 CLIP1P30622 1438 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRM-202ENST00000400053 CEP162Q5TB80 1403 aa12.11□□□□□ -0.47
PTPRM-202ENST00000400053 CECR2Q9BXF3 1484 aa12.11□□□□□ -0.47
PTPRM-202ENST00000400053 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
PTPRM-202ENST00000400053 GOLGA3Q08378 1498 aa12.09□□□□□ -0.47
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PTPRM-202ENST00000400053 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP12.08□□□□□ -0.48
PTPRM-202ENST00000400053 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa12.06□□□□□ -0.48
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PTPRM-202ENST00000400053 FBLN2P98095 1184 aa12□□□□□ -0.49
PTPRM-202ENST00000400053 CEP164Q9UPV0 1460 aa12□□□□□ -0.49
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC136Q96JN2 1154 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRM-202ENST00000400053 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRM-202ENST00000400053 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
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PTPRM-202ENST00000400053 ANP32EQ9BTT0 268 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRM-202ENST00000400053 TONSLQ96HA7 1378 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRM-202ENST00000400053 ARXQ96QS3 562 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRM-202ENST00000400053 ARID3CA6NKF2 412 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRM-202ENST00000400053 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PTPRM-202ENST00000400053 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
PTPRM-202ENST00000400053 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRM-202ENST00000400053 KIF27Q86VH2 1401 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRM-202ENST00000400053 SOGA1O94964 1423 aa11.91□□□□□ -0.5
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