RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 MT1LQ93083 61 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 ABCC10Q5T3U5 1492 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATMQ13315 3056 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 MT1EP04732 61 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 DIP2BQ9P265 1576 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 SNHG12Q9BXW3 62 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 RABAC1Q9UI14 185 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 MT1FP04733 61 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 AKAP12Q02952 1782 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 LINC00643Q86TS7 51 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 LRBAP50851 2863 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 CENPEQ02224 2701 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 UMAD1C9J7I0 102 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 NDUFA4O00483 81 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 VPS8Q8N3P4 1428 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC88BA6NC98 1476 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 PYY3Q5JQD4 70 aa-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 PIK3C2BO00750 1634 aa-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 PKIAP61925 76 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 ITSN1Q15811 1721 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-227P-201ENST00000362865 FREM2Q5SZK8 3169 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 PEG3Q9GZU2 1588 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPEGQ15772 3267 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 NREPQ16612 68 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 DMDP11532 3685 aa-2.07□□□□□ -2.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-2.07□□□□□ -2.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-2.08□□□□□ -2.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-2.08□□□□□ -2.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 S100A8P05109 93 aa-2.08□□□□□ -2.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 TNP1P09430 55 aa-2.08□□□□□ -2.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 WT1-ASQ06250 92 aa-2.08□□□□□ -2.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-2.08□□□□□ -2.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIF14Q15058 1648 aa-2.09□□□□□ -2.74
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-2.1□□□□□ -2.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 RICTORQ6R327 1708 aa-2.1□□□□□ -2.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-2.1□□□□□ -2.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 DEFB4AO15263 64 aa-2.1□□□□□ -2.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa-2.1□□□□□ -2.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 DCHS1Q96JQ0 3298 aa-2.11□□□□□ -2.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 TJP1Q07157 1748 aa-2.11□□□□□ -2.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-2.11□□□□□ -2.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 ABCC3O15438 1527 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 CFAP43Q8NDM7 1665 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 Q9H521 79 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 WDFY4Q6ZS81 3184 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 CRIP1P50238 77 aa-2.14□□□□□ -2.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-2.14□□□□□ -2.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPLO60437 1756 aa-2.14□□□□□ -2.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 CEP350Q5VT06 3117 aa-2.14□□□□□ -2.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIF1AQ12756 1690 aa-2.15□□□□□ -2.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa-2.15□□□□□ -2.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-2.15□□□□□ -2.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-2.15□□□□□ -2.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-2.16□□□□□ -2.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP-2.16□□□□□ -2.76
RNU6-227P-201ENST00000362865 V9GYS6 101 aa-2.16□□□□□ -2.76
RNU6-227P-201ENST00000362865 EP400Q96L91 3159 aa-2.16□□□□□ -2.76
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-2.16□□□□□ -2.76
RNU6-227P-201ENST00000362865 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa-2.17□□□□□ -2.76
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-2.17□□□□□ -2.76
RNU6-227P-201ENST00000362865 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-2.17□□□□□ -2.76
RNU6-227P-201ENST00000362865 MGAQ8IWI9 3026 aa-2.17□□□□□ -2.76
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A087WXM4 84 aa-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-227P-201ENST00000362865 TDRG1Q3Y452 100 aa-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-227P-201ENST00000362865 LY75O60449 1722 aa-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-227P-201ENST00000362865 HFM1A2PYH4 1435 aa-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-227P-201ENST00000362865 NRAPQ86VF7 1730 aa-2.2□□□□□ -2.76
RNU6-227P-201ENST00000362865 SMIM13P0DJ93 91 aa-2.2□□□□□ -2.76
RNU6-227P-201ENST00000362865 UBL5Q9BZL1 73 aa-2.2□□□□□ -2.76
RNU6-227P-201ENST00000362865 TTC37Q6PGP7 1564 aa-2.2□□□□□ -2.76
RNU6-227P-201ENST00000362865 DEFB121Q5J5C9 76 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-227P-201ENST00000362865 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-227P-201ENST00000362865 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-227P-201ENST00000362865 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP-2.22□□□□□ -2.76
RNU6-227P-201ENST00000362865 RALGAPBQ86X10 1494 aa-2.22□□□□□ -2.77
RNU6-227P-201ENST00000362865 KDM5DQ9BY66 1539 aa-2.22□□□□□ -2.77
RNU6-227P-201ENST00000362865 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa-2.23□□□□□ -2.77
RNU6-227P-201ENST00000362865 LOC400499M0QZD8 3231 aa-2.23□□□□□ -2.77
RNU6-227P-201ENST00000362865 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa-2.24□□□□□ -2.77
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