RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 TACC2O95359 2948 aa6.58□□□□□ -1.36
UBASH3B-201ENST00000284273 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.58□□□□□ -1.36
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.57□□□□□ -1.36
UBASH3B-201ENST00000284273 FRYLO94915 3013 aa6.56□□□□□ -1.36
UBASH3B-201ENST00000284273 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP10-10P60014 251 aa6.53□□□□□ -1.36
UBASH3B-201ENST00000284273 TNP1P09430 55 aa6.53□□□□□ -1.36
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
UBASH3B-201ENST00000284273 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.52□□□□□ -1.37
UBASH3B-201ENST00000284273 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
UBASH3B-201ENST00000284273 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.5□□□□□ -1.37
UBASH3B-201ENST00000284273 COL12A1Q99715 3063 aa6.5□□□□□ -1.37
UBASH3B-201ENST00000284273 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
UBASH3B-201ENST00000284273 APCP25054 2843 aa6.47□□□□□ -1.37
UBASH3B-201ENST00000284273 HIVEP1P15822 2718 aa6.47□□□□□ -1.37
UBASH3B-201ENST00000284273 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.46□□□□□ -1.38
UBASH3B-201ENST00000284273 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
UBASH3B-201ENST00000284273 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
UBASH3B-201ENST00000284273 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
UBASH3B-201ENST00000284273 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.42□□□□□ -1.38
UBASH3B-201ENST00000284273 XP32Q5T750 250 aa6.4□□□□□ -1.38
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.39□□□□□ -1.39
UBASH3B-201ENST00000284273 NDUFAF8A1L188 74 aa6.39□□□□□ -1.39
UBASH3B-201ENST00000284273 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.38□□□□□ -1.39
UBASH3B-201ENST00000284273 ITPR1Q14643 2758 aa6.37□□□□□ -1.39
UBASH3B-201ENST00000284273 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.37□□□□□ -1.39
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.36□□□□□ -1.39
UBASH3B-201ENST00000284273 ZZEF1O43149 2961 aa6.36□□□□□ -1.39
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.33□□□□□ -1.4
UBASH3B-201ENST00000284273 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.32□□□□□ -1.4
UBASH3B-201ENST00000284273 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.27□□□□□ -1.41
UBASH3B-201ENST00000284273 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.26□□□□□ -1.41
UBASH3B-201ENST00000284273 LAMA5O15230 3695 aa6.26□□□□□ -1.41
UBASH3B-201ENST00000284273 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.25□□□□□ -1.41
UBASH3B-201ENST00000284273 TENM4Q6N022 2769 aa6.23□□□□□ -1.41
UBASH3B-201ENST00000284273 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.22□□□□□ -1.41
UBASH3B-201ENST00000284273 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.22□□□□□ -1.41
UBASH3B-201ENST00000284273 RELNP78509 3460 aa6.21□□□□□ -1.41
UBASH3B-201ENST00000284273 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.2□□□□□ -1.42
UBASH3B-201ENST00000284273 FLNCQ14315 2725 aa6.17□□□□□ -1.42
UBASH3B-201ENST00000284273 A6NN06 94 aa6.17□□□□□ -1.42
UBASH3B-201ENST00000284273 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.16□□□□□ -1.42
UBASH3B-201ENST00000284273 TPRXLQ17RH7 258 aa6.15□□□□□ -1.42
UBASH3B-201ENST00000284273 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.14□□□□□ -1.43
UBASH3B-201ENST00000284273 P0C880 135 aa6.13□□□□□ -1.43
UBASH3B-201ENST00000284273 TENM2Q9NT68 2774 aa6.11□□□□□ -1.43
UBASH3B-201ENST00000284273 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.1□□□□□ -1.43
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.07□□□□□ -1.44
UBASH3B-201ENST00000284273 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.07□□□□□ -1.44
UBASH3B-201ENST00000284273 H0YAA0 97 aa6.04□□□□□ -1.44
UBASH3B-201ENST00000284273 ZFHX3Q15911 3703 aa6.01□□□□□ -1.45
UBASH3B-201ENST00000284273 DMDP11532 3685 aa6□□□□□ -1.45
UBASH3B-201ENST00000284273 NF1P21359 2839 aa5.97□□□□□ -1.45
UBASH3B-201ENST00000284273 FBN2P35556 2912 aa5.97□□□□□ -1.45
UBASH3B-201ENST00000284273 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
UBASH3B-201ENST00000284273 PP632Q6XCG6 107 aa5.96□□□□□ -1.45
UBASH3B-201ENST00000284273 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa5.96□□□□□ -1.46
UBASH3B-201ENST00000284273 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.95□□□□□ -1.46
UBASH3B-201ENST00000284273 VWFP04275 2813 aa5.94□□□□□ -1.46
UBASH3B-201ENST00000284273 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
UBASH3B-201ENST00000284273 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP5.91□□□□□ -1.46
UBASH3B-201ENST00000284273 ZANQ9Y493 2812 aa5.9□□□□□ -1.47
UBASH3B-201ENST00000284273 CUBNO60494 3623 aa5.88□□□□□ -1.47
UBASH3B-201ENST00000284273 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.88□□□□□ -1.47
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP12-2P59991 146 aa5.86□□□□□ -1.47
UBASH3B-201ENST00000284273 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
UBASH3B-201ENST00000284273 TENM3Q9P273 2699 aa5.83□□□□□ -1.48
UBASH3B-201ENST00000284273 CSMD2Q7Z408 3487 aa5.82□□□□□ -1.48
UBASH3B-201ENST00000284273 TGP01266 2768 aa5.78□□□□□ -1.48
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.74□□□□□ -1.49
UBASH3B-201ENST00000284273 PDZD2O15018 2839 aa5.7□□□□□ -1.5
UBASH3B-201ENST00000284273 MUC3AQ02505 3323 aa5.69□□□□□ -1.5
UBASH3B-201ENST00000284273 MXRA5Q9NR99 2828 aa5.68□□□□□ -1.5
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.62□□□□□ -1.51
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.6□□□□□ -1.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP12-1P59990 96 aa5.58□□□□□ -1.52
UBASH3B-201ENST00000284273 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa5.57□□□□□ -1.52
UBASH3B-201ENST00000284273 VPS13CQ709C8 3753 aa5.52□□□□□ -1.53
UBASH3B-201ENST00000284273 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.51□□□□□ -1.53
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.49□□□□□ -1.53
UBASH3B-201ENST00000284273 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
UBASH3B-201ENST00000284273 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
UBASH3B-201ENST00000284273 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
UBASH3B-201ENST00000284273 BSNQ9UPA5 3926 aa5.44□□□□□ -1.54
UBASH3B-201ENST00000284273 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.41□□□□□ -1.54
UBASH3B-201ENST00000284273 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP10-12P60413 245 aa5.39□□□□□ -1.55
UBASH3B-201ENST00000284273 COL7A1Q02388 2944 aa5.37□□□□□ -1.55
UBASH3B-201ENST00000284273 MT1HL1P0DM35 61 aa5.36□□□□□ -1.55
UBASH3B-201ENST00000284273 FBN3Q75N90 2809 aa5.33□□□□□ -1.56
UBASH3B-201ENST00000284273 OTOGQ6ZRI0 2925 aa5.27□□□□□ -1.57
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
UBASH3B-201ENST00000284273 AKAP9Q99996 3911 aa5.21□□□□□ -1.57
UBASH3B-201ENST00000284273 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.21□□□□□ -1.57
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.2□□□□□ -1.58
UBASH3B-201ENST00000284273 LCE3AQ5TA76 89 aa5.19□□□□□ -1.58
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP10-5P60370 271 aa5.18□□□□□ -1.58
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP12-3P60328 96 aa5.15□□□□□ -1.59
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