RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPIN3-231	ENST00000639895	DMD	P11532	3685 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPIN3-231	ENST00000639895	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPIN3-231	ENST00000639895	ITPR3	Q14573	2671 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SPIN3-231	ENST00000639895	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SPIN3-231	ENST00000639895	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SPIN3-231	ENST00000639895	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
SPIN3-231	ENST00000639895	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SPIN3-231	ENST00000639895	IGKV2-30	P06310	120 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SPIN3-231	ENST00000639895	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SPIN3-231	ENST00000639895	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
SPIN3-231	ENST00000639895	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SPIN3-231	ENST00000639895	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SPIN3-231	ENST00000639895	FLNC	Q14315	2725 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SPIN3-231	ENST00000639895	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SPIN3-231	ENST00000639895	HRES1	P13985	223 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SPIN3-231	ENST00000639895	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SPIN3-231	ENST00000639895	ATR	Q13535	2644 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SPIN3-231	ENST00000639895	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SPIN3-231	ENST00000639895	LCE6A	A0A183	80 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SPIN3-231	ENST00000639895	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SPIN3-231	ENST00000639895	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SPIN3-231	ENST00000639895	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SPIN3-231	ENST00000639895	C14orf177	Q52M58	125 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SPIN3-231	ENST00000639895	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SPIN3-231	ENST00000639895	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SPIN3-231	ENST00000639895	APC	P25054	2843 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SPIN3-231	ENST00000639895	COL6A5	A8TX70	2615 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SPIN3-231	ENST00000639895	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
SPIN3-231	ENST00000639895	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
SPIN3-231	ENST00000639895	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		7.15	□□□□□ -1.27
SPIN3-231	ENST00000639895	CHTF8	P0CG12	524 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A1B0GVX0	72 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SPIN3-231	ENST00000639895	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SPIN3-231	ENST00000639895	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
SPIN3-231	ENST00000639895	TNP2	Q05952	138 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP10-3	P60369	221 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SPIN3-231	ENST00000639895	ZAN	Q9Y493	2812 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SPIN3-231	ENST00000639895	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SPIN3-231	ENST00000639895	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
SPIN3-231	ENST00000639895	LAMA5	O15230	3695 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SPIN3-231	ENST00000639895	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
SPIN3-231	ENST00000639895	CASC10	Q5T4H9	136 aa		7.09	□□□□□ -1.28
SPIN3-231	ENST00000639895	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		7.08	□□□□□ -1.28
SPIN3-231	ENST00000639895		H3BNG1	76 aa		7.08	□□□□□ -1.28
SPIN3-231	ENST00000639895	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
SPIN3-231	ENST00000639895	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		7.08	□□□□□ -1.28
SPIN3-231	ENST00000639895	RTL8C	O15255	209 aa		7.08	□□□□□ -1.28
SPIN3-231	ENST00000639895	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
SPIN3-231	ENST00000639895	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SPIN3-231	ENST00000639895	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		7.06	□□□□□ -1.28
SPIN3-231	ENST00000639895	RELN	P78509	3460 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM229A	H3BQW9	127 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SPIN3-231	ENST00000639895	SPRR1A	P35321	89 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SPIN3-231	ENST00000639895	FBN2	P35556	2912 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SPIN3-231	ENST00000639895	CUBN	O60494	3623 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SPIN3-231	ENST00000639895	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SPIN3-231	ENST00000639895	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
SPIN3-231	ENST00000639895	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
SPIN3-231	ENST00000639895	CRIPT	Q9P021	101 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SPIN3-231	ENST00000639895	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SPIN3-231	ENST00000639895	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
SPIN3-231	ENST00000639895	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SPIN3-231	ENST00000639895	NF1	P21359	2839 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SPIN3-231	ENST00000639895	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		7	□□□□□ -1.29
SPIN3-231	ENST00000639895	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		7	□□□□□ -1.29
SPIN3-231	ENST00000639895		K7EIL1	84 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SPIN3-231	ENST00000639895	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
SPIN3-231	ENST00000639895	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SPIN3-231	ENST00000639895	STAB1	Q9NY15	2570 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SPIN3-231	ENST00000639895	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.29
SPIN3-231	ENST00000639895	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SPIN3-231	ENST00000639895	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SPIN3-231	ENST00000639895		Q6ZR54	194 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SPIN3-231	ENST00000639895	HIVEP1	P15822	2718 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SPIN3-231	ENST00000639895	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SPIN3-231	ENST00000639895	MAST4	O15021	2626 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SPIN3-231	ENST00000639895	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP10-11	P60412	298 aa		6.92	□□□□□ -1.3
SPIN3-231	ENST00000639895		Q8N1X5	172 aa		6.92	□□□□□ -1.3
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		6.92	□□□□□ -1.3
SPIN3-231	ENST00000639895	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		6.89	□□□□□ -1.31
SPIN3-231	ENST00000639895	ITPR2	Q14571	2701 aa		6.86	□□□□□ -1.31
SPIN3-231	ENST00000639895	ROMO1	P60602	79 aa		6.85	□□□□□ -1.31
SPIN3-231	ENST00000639895	DMAC1	Q96GE9	116 aa		6.85	□□□□□ -1.31
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A1B0GU33	70 aa		6.84	□□□□□ -1.31
SPIN3-231	ENST00000639895		Q5W150	140 aa		6.84	□□□□□ -1.31
SPIN3-231	ENST00000639895		Q96NJ1	140 aa		6.84	□□□□□ -1.31
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A087X002	238 aa		6.83	□□□□□ -1.32
SPIN3-231	ENST00000639895	SPRR1B	P22528	89 aa		6.83	□□□□□ -1.32
SPIN3-231	ENST00000639895	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		6.83	□□□□□ -1.32
SPIN3-231	ENST00000639895	IGLV7-43	P04211	117 aa		6.82	□□□□□ -1.32
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		6.82	□□□□□ -1.32
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A0D9SG42	100 aa		6.8	□□□□□ -1.32
SPIN3-231	ENST00000639895	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		6.8	□□□□□ -1.32

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.2 ms