RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638107.1

5S_rRNA.28-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LINC00575Q6W349 94 aa3.11□□□□□ -1.91
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.11□□□□□ -1.91
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 hADV29S1A0JD25 119 aa3.1□□□□□ -1.91
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 VAMP3Q15836 100 aa3.1□□□□□ -1.91
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa3.09□□□□□ -1.91
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OCIAD2Q56VL3 154 aa3.09□□□□□ -1.91
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CLEC2BQ92478 149 aa3.09□□□□□ -1.91
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 Q6JHZ5 121 aa3.08□□□□□ -1.92
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.08□□□□□ -1.92
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C12orf57Q99622 126 aa3.08□□□□□ -1.92
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 Q6Q795 121 aa3.07□□□□□ -1.92
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.07□□□□□ -1.92
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 Q75L30 129 aa3.07□□□□□ -1.92
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HIST3H2BBQ8N257 126 aa3.07□□□□□ -1.92
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.07□□□□□ -1.92
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HSBP1L1C9JCN9 74 aa3.06□□□□□ -1.92
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 H3BUT2 72 aa3.06□□□□□ -1.92
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LST1O00453 97 aa3.06□□□□□ -1.92
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 S100A2P29034 98 aa3.05□□□□□ -1.92
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa3.05□□□□□ -1.92
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PPDPFLQ8WWR9 84 aa3.05□□□□□ -1.92
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 Q96NJ1 140 aa3.05□□□□□ -1.92
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HIST1H4GQ99525 98 aa3.05□□□□□ -1.92
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.05□□□□□ -1.92
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SCGB1D1O95968 90 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CFC1P0CG37 223 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 COX8AP10176 69 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 A0A087WSZ3 146 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 A8MUU9 505 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TEN1Q86WV5 123 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 S100A6P06703 90 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DSCR10P59022 87 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RAB37Q96AX2 223 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 A0A0B4J2C4 111 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 H0YGX0 51 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DLEU1O43261 78 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C14orf144Q96I85 54 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa2.99□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 A0A1W2PNM2 257 aa2.99□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa2.99□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 H3BMG7 143 aa2.99□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SNCGO76070 127 aa2.99□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HIGD1BQ9P298 99 aa2.99□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PAM16Q9Y3D7 125 aa2.99□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FABP2P12104 132 aa2.98□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SPATA45Q537H7 98 aa2.98□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C2orf91Q6ZV80 131 aa2.98□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SIGMAR1Q99720 223 aa2.98□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 A0A1B0GV72 72 aa2.97□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 A0A1B0GX51 115 aa2.97□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa2.97□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 IGKV4-1P06312 121 aa2.97□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LINC00313P59037 77 aa2.97□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa2.97□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CEND1Q8N111 149 aa2.97□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PRO1854Q9UHT4 67 aa2.97□□□□□ -1.93
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa2.96□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TRIAP1O43715 76 aa2.96□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GHRHP01286 108 aa2.96□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MT2AP02795 61 aa2.96□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FAM236CP0DP71 79 aa2.96□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HRES1P13985 223 aa2.96□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 S100A1P23297 94 aa2.96□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FXYD2P54710 66 aa2.96□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DEFB116Q30KQ4 102 aa2.96□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ANKRD29Q8N6D5 301 aa2.96□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 VAMP8Q9BV40 100 aa2.96□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa2.95□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 A6NJY4 79 aa2.95□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MT1FP04733 61 aa2.95□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 USH2AO75445 5202 aa2.95□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa2.94□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LCE2BO14633 110 aa2.94□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MPLKIPQ8TAP9 179 aa2.94□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LINC00472Q9H8W2 130 aa2.94□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ORMDL1Q9P0S3 153 aa2.94□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa2.93□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DNAL4O96015 105 aa2.93□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CCKP06307 115 aa2.93□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa2.93□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SSPOA2VEC9 5147 aa2.93□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa2.92□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 K7ERJ3 54 aa2.92□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TRACP01848 142 aa2.92□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PSMB2P49721 201 aa2.92□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa2.92□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 H3BQ85 93 aa2.91□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KRTAP10-10P60014 251 aa2.91□□□□□ -1.94
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.8 ms