RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638107.1

5S_rRNA.28-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NISCHQ9Y2I1 1504 aa14.87□□□□□ -0.03
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa13.35□□□□□ -0.27
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ABCC9O60706 1549 aa13.31□□□□□ -0.28
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa12.67□□□□□ -0.38
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NACADO15069 1562 aa12.58□□□□□ -0.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DCAF8L2P0C7V8 631 aa12.52□□□□□ -0.41
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 UNC13AQ9UPW8 1703 aa12.45□□□□□ -0.42
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DNAJC5BQ9UF47 199 aa12.45□□□□□ -0.42
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MYO15BQ96JP2 1530 aa12.4□□□□□ -0.42
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP12.37□□□□□ -0.43
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BICRAQ9NZM4 1560 aa12.33□□□□□ -0.44
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa12.27□□□□□ -0.45
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SCRIBQ14160 1630 aa12.18□□□□□ -0.46
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa12.1□□□□□ -0.47
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa12.04□□□□□ -0.48
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CECR2Q9BXF3 1484 aa11.96□□□□□ -0.49
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NCAPD3P42695 1498 aa11.61□□□□□ -0.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SMARCA4P51532 1647 aa11.6□□□□□ -0.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa11.59□□□□□ -0.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SMARCA2P51531 1590 aa11.55□□□□□ -0.56
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HMGXB3Q12766 1538 aa11.54□□□□□ -0.56
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PEG3Q9GZU2 1588 aa11.48□□□□□ -0.57
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MROH2BQ7Z745 1585 aa11.47□□□□□ -0.57
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ERCC6Q03468 1493 aa11.47□□□□□ -0.57
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NESP48681 1621 aa11.45□□□□□ -0.58
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CUX2O14529 1486 aa11.44□□□□□ -0.58
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa11.38□□□□□ -0.59
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa11.37□□□□□ -0.59
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 WIZO95785 1651 aa11.36□□□□□ -0.59
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa11.33□□□□□ -0.6
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PDS5BQ9NTI5 1447 aa11.26□□□□□ -0.61
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CADPSQ9ULU8 1353 aa11.25□□□□□ -0.61
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MRC2Q9UBG0 1479 aa11.19□□□□□ -0.62
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 WDR62O43379 1518 aa11.17□□□□□ -0.62
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CEP164Q9UPV0 1460 aa11.15□□□□□ -0.62
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CFTRP13569 1480 aa11.14□□□□□ -0.63
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FANCD2Q9BXW9 1451 aa11.14□□□□□ -0.63
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PRDM2Q13029 1718 aa11.09□□□□□ -0.63
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CCDC88BA6NC98 1476 aa11.06□□□□□ -0.64
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TOPBP1Q92547 1522 aa10.94□□□□□ -0.66
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TRIM41Q8WV44 630 aa10.92□□□□□ -0.66
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 IFT140Q96RY7 1462 aa10.92□□□□□ -0.66
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DNMBPQ6XZF7 1577 aa10.9□□□□□ -0.66
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OSCARQ8IYS5 282 aa10.89□□□□□ -0.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ABCC8Q09428 1581 aa10.89□□□□□ -0.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP10.81□□□□□ -0.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CHD1O14646 1710 aa10.81□□□□□ -0.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa10.81□□□□□ -0.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa10.81□□□□□ -0.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa10.81□□□□□ -0.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa10.8□□□□□ -0.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SOGA1O94964 1423 aa10.77□□□□□ -0.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FGD5Q6ZNL6 1462 aa10.77□□□□□ -0.69
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CUX1P39880 1505 aa10.77□□□□□ -0.69
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ARHGEF11O15085 1522 aa10.76□□□□□ -0.69
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 WDR97A6NE52 1622 aa10.73□□□□□ -0.69
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FBLN2P98095 1184 aa10.72□□□□□ -0.69
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa10.71□□□□□ -0.69
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PBRM1Q86U86 1689 aa10.69□□□□□ -0.7
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GRIN2BQ13224 1484 aa10.67□□□□□ -0.7
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CYB5RLQ6IPT4 315 aa10.66□□□□□ -0.7
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CLASP1Q7Z460 1538 aa10.66□□□□□ -0.7
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ARAP1Q96P48 1450 aa10.66□□□□□ -0.7
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa10.66□□□□□ -0.7
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa10.64□□□□□ -0.71
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GAPVD1Q14C86 1478 aa10.64□□□□□ -0.71
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SYNJ1O43426 1573 aa10.64□□□□□ -0.71
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SYNJ2O15056 1496 aa10.63□□□□□ -0.71
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa10.63□□□□□ -0.71
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TOP2BQ02880 1626 aa10.6□□□□□ -0.71
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP10.58□□□□□ -0.72
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ADAMTS12P58397 1594 aa10.56□□□□□ -0.72
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GRIN2AQ12879 1464 aa10.54□□□□□ -0.72
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CEP170Q5SW79 1584 aa10.53□□□□□ -0.72
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TRHP20396 242 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ERCC6L2Q5T890 1561 aa10.52□□□□□ -0.73
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ERICH3Q5RHP9 1530 aa10.5□□□□□ -0.73
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FHAD1B1AJZ9 1412 aa10.5□□□□□ -0.73
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NUP160Q12769 1436 aa10.5□□□□□ -0.73
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SHROOM2Q13796 1616 aa10.47□□□□□ -0.73
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa10.42□□□□□ -0.74
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 JPH4Q96JJ6 628 aa10.38□□□□□ -0.75
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CUL7Q14999 1698 aa10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms