RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616278.4

DDB2-211, Transcript of damage specific DNA binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene DDB2, Length 960 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2-211ENST00000616278 PRO1933Q9H354 126 aa6.54□□□□□ -1.36
DDB2-211ENST00000616278 F8WEM9 126 aa6.53□□□□□ -1.36
DDB2-211ENST00000616278 M0R143 59 aa6.53□□□□□ -1.36
DDB2-211ENST00000616278 CD164Q04900 197 aa6.53□□□□□ -1.36
DDB2-211ENST00000616278 SMIM29Q86T20 159 aa6.53□□□□□ -1.36
DDB2-211ENST00000616278 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.52□□□□□ -1.37
DDB2-211ENST00000616278 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.51□□□□□ -1.37
DDB2-211ENST00000616278 TRIAP1O43715 76 aa6.51□□□□□ -1.37
DDB2-211ENST00000616278 PSMB2P49721 201 aa6.51□□□□□ -1.37
DDB2-211ENST00000616278 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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DDB2-211ENST00000616278 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.48□□□□□ -1.37
DDB2-211ENST00000616278 K7ERJ3 54 aa6.48□□□□□ -1.37
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DDB2-211ENST00000616278 TRACP01848 142 aa6.43□□□□□ -1.38
DDB2-211ENST00000616278 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
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DDB2-211ENST00000616278 A0A0G2JQZ4 141 aa6.36□□□□□ -1.39
DDB2-211ENST00000616278 H3BUT2 72 aa6.36□□□□□ -1.39
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DDB2-211ENST00000616278 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.36□□□□□ -1.39
DDB2-211ENST00000616278 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.35□□□□□ -1.39
DDB2-211ENST00000616278 C1orf195Q5TG92 126 aa6.33□□□□□ -1.4
DDB2-211ENST00000616278 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.33□□□□□ -1.4
DDB2-211ENST00000616278 C9orf118A6NHY6 69 aa6.32□□□□□ -1.4
DDB2-211ENST00000616278 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.31□□□□□ -1.4
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DDB2-211ENST00000616278 A0A1W2PPM0 123 aa6.28□□□□□ -1.4
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DDB2-211ENST00000616278 A0A087WSZ3 146 aa6.27□□□□□ -1.41
DDB2-211ENST00000616278 A0A1W2PNM2 257 aa6.27□□□□□ -1.41
DDB2-211ENST00000616278 CCKP06307 115 aa6.26□□□□□ -1.41
DDB2-211ENST00000616278 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.26□□□□□ -1.41
DDB2-211ENST00000616278 XP32Q5T750 250 aa6.26□□□□□ -1.41
DDB2-211ENST00000616278 A0A1B0GW54 56 aa6.25□□□□□ -1.41
DDB2-211ENST00000616278 C9JAW5 83 aa6.25□□□□□ -1.41
DDB2-211ENST00000616278 PDE6GP18545 87 aa6.25□□□□□ -1.41
DDB2-211ENST00000616278 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
DDB2-211ENST00000616278 A0A1B0GV72 72 aa6.24□□□□□ -1.41
DDB2-211ENST00000616278 H3BT86 120 aa6.23□□□□□ -1.41
DDB2-211ENST00000616278 C9orf92A6NGG3 77 aa6.22□□□□□ -1.41
DDB2-211ENST00000616278 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.21□□□□□ -1.42
DDB2-211ENST00000616278 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.2□□□□□ -1.42
DDB2-211ENST00000616278 Q96NJ1 140 aa6.2□□□□□ -1.42
DDB2-211ENST00000616278 VPS25Q9BRG1 176 aa6.2□□□□□ -1.42
DDB2-211ENST00000616278 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.2□□□□□ -1.42
DDB2-211ENST00000616278 A0A0U1RQV1 116 aa6.19□□□□□ -1.42
DDB2-211ENST00000616278 Q6ZQT0 140 aa6.19□□□□□ -1.42
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DDB2-211ENST00000616278 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.17□□□□□ -1.42
DDB2-211ENST00000616278 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.16□□□□□ -1.42
DDB2-211ENST00000616278 RNF213Q63HN8 5207 aa6.15□□□□□ -1.42
DDB2-211ENST00000616278 J3KT08 172 aa6.15□□□□□ -1.42
DDB2-211ENST00000616278 IGKV4-1P06312 121 aa6.15□□□□□ -1.42
DDB2-211ENST00000616278 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
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DDB2-211ENST00000616278 MUC17Q685J3 4493 aa6.14□□□□□ -1.43
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DDB2-211ENST00000616278 Q75L30 129 aa6.12□□□□□ -1.43
DDB2-211ENST00000616278 LINC00313P59037 77 aa6.11□□□□□ -1.43
DDB2-211ENST00000616278 MTURNQ8N3F0 131 aa6.11□□□□□ -1.43
DDB2-211ENST00000616278 PCOTHQ58A44 107 aa6.1□□□□□ -1.43
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DDB2-211ENST00000616278 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.09□□□□□ -1.43
DDB2-211ENST00000616278 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.09□□□□□ -1.43
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