RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608107.1

ITGB5-211, Transcript of integrin subunit beta 5, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB5, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5-211ENST00000608107 TRACP01848 142 aa6.03□□□□□ -1.44
ITGB5-211ENST00000608107 DNAL4O96015 105 aa6.02□□□□□ -1.45
ITGB5-211ENST00000608107 FABP2P12104 132 aa6.02□□□□□ -1.45
ITGB5-211ENST00000608107 MOBPQ13875 183 aa6.02□□□□□ -1.45
ITGB5-211ENST00000608107 ATXN8Q156A1 80 aa6.02□□□□□ -1.45
ITGB5-211ENST00000608107 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.02□□□□□ -1.45
ITGB5-211ENST00000608107 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.02□□□□□ -1.45
ITGB5-211ENST00000608107 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
ITGB5-211ENST00000608107 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.01□□□□□ -1.45
ITGB5-211ENST00000608107 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6□□□□□ -1.45
ITGB5-211ENST00000608107 A0A0G2JQZ4 141 aa6□□□□□ -1.45
ITGB5-211ENST00000608107 OCIAD2Q56VL3 154 aa6□□□□□ -1.45
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ITGB5-211ENST00000608107 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6□□□□□ -1.45
ITGB5-211ENST00000608107 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6□□□□□ -1.45
ITGB5-211ENST00000608107 TNXBP22105 4242 aa5.99□□□□□ -1.45
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ITGB5-211ENST00000608107 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.99□□□□□ -1.45
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ITGB5-211ENST00000608107 C9JAW5 83 aa5.98□□□□□ -1.45
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ITGB5-211ENST00000608107 Q8NBF4 154 aa5.98□□□□□ -1.45
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ITGB5-211ENST00000608107 K7EP34 96 aa5.96□□□□□ -1.46
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ITGB5-211ENST00000608107 F8WEM9 126 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGB5-211ENST00000608107 UBE2V1Q13404 147 aa5.94□□□□□ -1.46
ITGB5-211ENST00000608107 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.94□□□□□ -1.46
ITGB5-211ENST00000608107 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.94□□□□□ -1.46
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ITGB5-211ENST00000608107 H3BQ85 93 aa5.93□□□□□ -1.46
ITGB5-211ENST00000608107 GHRHP01286 108 aa5.93□□□□□ -1.46
ITGB5-211ENST00000608107 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
ITGB5-211ENST00000608107 IGFL1Q6UW32 110 aa5.93□□□□□ -1.46
ITGB5-211ENST00000608107 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.93□□□□□ -1.46
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ITGB5-211ENST00000608107 H3BT86 120 aa5.9□□□□□ -1.46
ITGB5-211ENST00000608107 Q6JHZ5 121 aa5.9□□□□□ -1.46
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ITGB5-211ENST00000608107 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.85□□□□□ -1.47
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ITGB5-211ENST00000608107 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
ITGB5-211ENST00000608107 Q6Q795 121 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGB5-211ENST00000608107 A0A087WSZ3 146 aa5.81□□□□□ -1.48
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ITGB5-211ENST00000608107 HERC1Q15751 4861 aa5.78□□□□□ -1.48
ITGB5-211ENST00000608107 PDE6GP18545 87 aa5.77□□□□□ -1.49
ITGB5-211ENST00000608107 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.75□□□□□ -1.49
ITGB5-211ENST00000608107 Q96NJ1 140 aa5.75□□□□□ -1.49
ITGB5-211ENST00000608107 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.73□□□□□ -1.49
ITGB5-211ENST00000608107 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.73□□□□□ -1.49
ITGB5-211ENST00000608107 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.73□□□□□ -1.49
ITGB5-211ENST00000608107 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
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ITGB5-211ENST00000608107 A0A1B0GW54 56 aa5.69□□□□□ -1.5
ITGB5-211ENST00000608107 LPAP08519 4548 aa5.69□□□□□ -1.5
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ITGB5-211ENST00000608107 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.68□□□□□ -1.5
ITGB5-211ENST00000608107 LINC00846Q9NV44 126 aa5.68□□□□□ -1.5
ITGB5-211ENST00000608107 NREPQ16612 68 aa5.67□□□□□ -1.5
ITGB5-211ENST00000608107 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.67□□□□□ -1.5
ITGB5-211ENST00000608107 Q6ZVQ6 151 aa5.67□□□□□ -1.5
ITGB5-211ENST00000608107 SIGMAR1Q99720 223 aa5.67□□□□□ -1.5
ITGB5-211ENST00000608107 C9orf92A6NGG3 77 aa5.66□□□□□ -1.5
ITGB5-211ENST00000608107 TPRXLQ17RH7 258 aa5.64□□□□□ -1.51
ITGB5-211ENST00000608107 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.63□□□□□ -1.51
ITGB5-211ENST00000608107 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.63□□□□□ -1.51
ITGB5-211ENST00000608107 J3KT08 172 aa5.61□□□□□ -1.51
ITGB5-211ENST00000608107 DSCR10P59022 87 aa5.61□□□□□ -1.51
ITGB5-211ENST00000608107 UBL5Q9BZL1 73 aa5.61□□□□□ -1.51
ITGB5-211ENST00000608107 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.6□□□□□ -1.51
ITGB5-211ENST00000608107 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.6□□□□□ -1.51
ITGB5-211ENST00000608107 BPY2O14599 106 aa5.6□□□□□ -1.51
ITGB5-211ENST00000608107 CDIP1Q9H305 208 aa5.6□□□□□ -1.51
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