RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567046.5

PDPR-208, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PDPR, Length 1,207 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-208ENST00000567046 CCKP06307 115 aa6.82□□□□□ -1.32
PDPR-208ENST00000567046 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PDPR-208ENST00000567046 LINC00483Q53H64 154 aa6.82□□□□□ -1.32
PDPR-208ENST00000567046 SMIM29Q86T20 159 aa6.82□□□□□ -1.32
PDPR-208ENST00000567046 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.81□□□□□ -1.32
PDPR-208ENST00000567046 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.81□□□□□ -1.32
PDPR-208ENST00000567046 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.81□□□□□ -1.32
PDPR-208ENST00000567046 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PDPR-208ENST00000567046 PKHD1P08F94 4074 aa6.8□□□□□ -1.32
PDPR-208ENST00000567046 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.8□□□□□ -1.32
PDPR-208ENST00000567046 A0A1B0GV72 72 aa6.8□□□□□ -1.32
PDPR-208ENST00000567046 CDK2AP2O75956 126 aa6.8□□□□□ -1.32
PDPR-208ENST00000567046 Q6ZQT0 140 aa6.8□□□□□ -1.32
PDPR-208ENST00000567046 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.8□□□□□ -1.32
PDPR-208ENST00000567046 Q6JHZ5 121 aa6.79□□□□□ -1.32
PDPR-208ENST00000567046 A0A1B0GW54 56 aa6.78□□□□□ -1.32
PDPR-208ENST00000567046 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PDPR-208ENST00000567046 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.78□□□□□ -1.32
PDPR-208ENST00000567046 RYR3Q15413 4870 aa6.77□□□□□ -1.33
PDPR-208ENST00000567046 FAM229AH3BQW9 127 aa6.77□□□□□ -1.33
PDPR-208ENST00000567046 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PDPR-208ENST00000567046 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.75□□□□□ -1.33
PDPR-208ENST00000567046 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDPR-208ENST00000567046 VPS25Q9BRG1 176 aa6.74□□□□□ -1.33
PDPR-208ENST00000567046 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.73□□□□□ -1.33
PDPR-208ENST00000567046 IGFL1Q6UW32 110 aa6.73□□□□□ -1.33
PDPR-208ENST00000567046 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.72□□□□□ -1.33
PDPR-208ENST00000567046 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.72□□□□□ -1.33
PDPR-208ENST00000567046 Q8NBF4 154 aa6.72□□□□□ -1.33
PDPR-208ENST00000567046 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
PDPR-208ENST00000567046 Q6Q795 121 aa6.71□□□□□ -1.34
PDPR-208ENST00000567046 UBL5Q9BZL1 73 aa6.71□□□□□ -1.34
PDPR-208ENST00000567046 A0A1W2PNM2 257 aa6.7□□□□□ -1.34
PDPR-208ENST00000567046 LCE2BO14633 110 aa6.7□□□□□ -1.34
PDPR-208ENST00000567046 CRYGAP11844 174 aa6.7□□□□□ -1.34
PDPR-208ENST00000567046 LINC00846Q9NV44 126 aa6.7□□□□□ -1.34
PDPR-208ENST00000567046 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.7□□□□□ -1.34
PDPR-208ENST00000567046 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDPR-208ENST00000567046 MOBPQ13875 183 aa6.69□□□□□ -1.34
PDPR-208ENST00000567046 CDIP1Q9H305 208 aa6.69□□□□□ -1.34
PDPR-208ENST00000567046 LINC00643Q86TS7 51 aa6.68□□□□□ -1.34
PDPR-208ENST00000567046 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.67□□□□□ -1.34
PDPR-208ENST00000567046 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.67□□□□□ -1.34
PDPR-208ENST00000567046 NREPQ16612 68 aa6.66□□□□□ -1.34
PDPR-208ENST00000567046 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.65□□□□□ -1.34
PDPR-208ENST00000567046 CD164Q04900 197 aa6.65□□□□□ -1.34
PDPR-208ENST00000567046 Q5VSD8 79 aa6.65□□□□□ -1.34
PDPR-208ENST00000567046 SIGMAR1Q99720 223 aa6.65□□□□□ -1.34
PDPR-208ENST00000567046 Q6ZVQ6 151 aa6.64□□□□□ -1.35
PDPR-208ENST00000567046 A0A087X002 238 aa6.63□□□□□ -1.35
PDPR-208ENST00000567046 A0A0G2JQZ4 141 aa6.63□□□□□ -1.35
PDPR-208ENST00000567046 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.63□□□□□ -1.35
PDPR-208ENST00000567046 Q8N1X5 172 aa6.63□□□□□ -1.35
PDPR-208ENST00000567046 A0A087WSZ3 146 aa6.62□□□□□ -1.35
PDPR-208ENST00000567046 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.62□□□□□ -1.35
PDPR-208ENST00000567046 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.62□□□□□ -1.35
PDPR-208ENST00000567046 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.62□□□□□ -1.35
PDPR-208ENST00000567046 FAT1Q14517 4588 aa6.61□□□□□ -1.35
PDPR-208ENST00000567046 CXCL6P80162 114 aa6.59□□□□□ -1.35
PDPR-208ENST00000567046 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.59□□□□□ -1.35
PDPR-208ENST00000567046 IMUPQ9GZP8 106 aa6.59□□□□□ -1.35
PDPR-208ENST00000567046 BPY2O14599 106 aa6.58□□□□□ -1.36
PDPR-208ENST00000567046 MT-ATP8P03928 68 aa6.58□□□□□ -1.36
PDPR-208ENST00000567046 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.58□□□□□ -1.36
PDPR-208ENST00000567046 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.58□□□□□ -1.36
PDPR-208ENST00000567046 RYR1P21817 5038 aa6.58□□□□□ -1.36
PDPR-208ENST00000567046 HSPG2P98160 4391 aa6.57□□□□□ -1.36
PDPR-208ENST00000567046 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.56□□□□□ -1.36
PDPR-208ENST00000567046 SPINK1P00995 79 aa6.56□□□□□ -1.36
PDPR-208ENST00000567046 J3KT08 172 aa6.55□□□□□ -1.36
PDPR-208ENST00000567046 Q5XG85 94 aa6.55□□□□□ -1.36
PDPR-208ENST00000567046 LIMD2Q9BT23 127 aa6.55□□□□□ -1.36
PDPR-208ENST00000567046 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.54□□□□□ -1.36
PDPR-208ENST00000567046 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PDPR-208ENST00000567046 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.53□□□□□ -1.36
PDPR-208ENST00000567046 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.53□□□□□ -1.36
PDPR-208ENST00000567046 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PDPR-208ENST00000567046 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.52□□□□□ -1.37
PDPR-208ENST00000567046 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PDPR-208ENST00000567046 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.49□□□□□ -1.37
PDPR-208ENST00000567046 NDUFB1O75438 58 aa6.49□□□□□ -1.37
PDPR-208ENST00000567046 SCGB1A1P11684 91 aa6.49□□□□□ -1.37
PDPR-208ENST00000567046 KRTAP10-8P60410 259 aa6.49□□□□□ -1.37
PDPR-208ENST00000567046 IGKV4-1P06312 121 aa6.48□□□□□ -1.37
PDPR-208ENST00000567046 DSCR10P59022 87 aa6.48□□□□□ -1.37
PDPR-208ENST00000567046 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.48□□□□□ -1.37
PDPR-208ENST00000567046 A8MWP4 228 aa6.47□□□□□ -1.37
PDPR-208ENST00000567046 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.47□□□□□ -1.37
PDPR-208ENST00000567046 Q96NJ1 140 aa6.47□□□□□ -1.37
PDPR-208ENST00000567046 OXTP01178 125 aa6.46□□□□□ -1.38
PDPR-208ENST00000567046 C1orf195Q5TG92 126 aa6.44□□□□□ -1.38
PDPR-208ENST00000567046 PRR15Q8IV56 129 aa6.44□□□□□ -1.38
PDPR-208ENST00000567046 K7EQZ3 153 aa6.43□□□□□ -1.38
PDPR-208ENST00000567046 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PDPR-208ENST00000567046 A0A087WVE0 104 aa6.42□□□□□ -1.38
PDPR-208ENST00000567046 Q8N9L7 120 aa6.42□□□□□ -1.38
PDPR-208ENST00000567046 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.41□□□□□ -1.38
PDPR-208ENST00000567046 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.41□□□□□ -1.38
PDPR-208ENST00000567046 A0A1B0GVX0 72 aa6.4□□□□□ -1.38
PDPR-208ENST00000567046 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 283.9 ms