RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 H3BQ85 93 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-218ENST00000525459 MOBPQ13875 183 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-218ENST00000525459 C9orf153Q5TBE3 101 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRK-218ENST00000525459 SNHG12Q9BXW3 62 aa10.96□□□□□ -0.65
PTPRK-218ENST00000525459 TRACP01848 142 aa10.95□□□□□ -0.66
PTPRK-218ENST00000525459 LINC00304Q8N9R0 145 aa10.95□□□□□ -0.66
PTPRK-218ENST00000525459 F8WEM9 126 aa10.95□□□□□ -0.66
PTPRK-218ENST00000525459 LST1O00453 97 aa10.95□□□□□ -0.66
PTPRK-218ENST00000525459 PCP4L1A6NKN8 68 aa10.94□□□□□ -0.66
PTPRK-218ENST00000525459 SPAG11AQ6PDA7 123 aa10.94□□□□□ -0.66
PTPRK-218ENST00000525459 SMIM29Q86T20 159 aa10.94□□□□□ -0.66
PTPRK-218ENST00000525459 TNXBP22105 4242 aa10.93□□□□□ -0.66
PTPRK-218ENST00000525459 ORMDL1Q9P0S3 153 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRK-218ENST00000525459 C9orf118A6NHY6 69 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRK-218ENST00000525459 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRK-218ENST00000525459 TAX1BP3O14907 124 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRK-218ENST00000525459 C4orf48Q5BLP8 95 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRK-218ENST00000525459 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRK-218ENST00000525459 H3BUT2 72 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRK-218ENST00000525459 ATXN8Q156A1 80 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRK-218ENST00000525459 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRK-218ENST00000525459 TCL1BO95988 128 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRK-218ENST00000525459 SPINK1P00995 79 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRK-218ENST00000525459 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRK-218ENST00000525459 A0A1W2PPM0 123 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRK-218ENST00000525459 Q6JHZ5 121 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRK-218ENST00000525459 RPS29P62273 56 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
PTPRK-218ENST00000525459 FABP2P12104 132 aa10.84□□□□□ -0.67
PTPRK-218ENST00000525459 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
PTPRK-218ENST00000525459 CD164Q04900 197 aa10.83□□□□□ -0.68
PTPRK-218ENST00000525459 UBE2V1Q13404 147 aa10.81□□□□□ -0.68
PTPRK-218ENST00000525459 H3BMG7 143 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-218ENST00000525459 LIMD2Q9BT23 127 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRK-218ENST00000525459 BAALC-AS2P0C853 105 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRK-218ENST00000525459 IGFL1Q6UW32 110 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRK-218ENST00000525459 SPCS1Q9Y6A9 102 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRK-218ENST00000525459 ANKRD29Q8N6D5 301 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRK-218ENST00000525459 C9JAW5 83 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRK-218ENST00000525459 H3BT86 120 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-218ENST00000525459 Q5XG85 94 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-218ENST00000525459 HRCT1Q6UXD1 115 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-218ENST00000525459 Q6Q795 121 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-218ENST00000525459 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-218ENST00000525459 HERC1Q15751 4861 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-218ENST00000525459 A0A0G2JQZ4 141 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-218ENST00000525459 RBM3P98179 157 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-218ENST00000525459 TEN1Q86WV5 123 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-218ENST00000525459 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-218ENST00000525459 K7EP34 96 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-218ENST00000525459 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-218ENST00000525459 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-218ENST00000525459 DSCR8Q96T75 97 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-218ENST00000525459 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-218ENST00000525459 PRR4Q16378 134 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-218ENST00000525459 RETNLBQ9BQ08 111 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-218ENST00000525459 SS18L2Q9UHA2 77 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-218ENST00000525459 A0A1B0GV72 72 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-218ENST00000525459 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-218ENST00000525459 PDE6GP18545 87 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-218ENST00000525459 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-218ENST00000525459 CCKP06307 115 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-218ENST00000525459 A0A1W2PNM2 257 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-218ENST00000525459 MTURNQ8N3F0 131 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-218ENST00000525459 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRK-218ENST00000525459 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRK-218ENST00000525459 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRK-218ENST00000525459 A0A087WSZ3 146 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRK-218ENST00000525459 A0A1B0GW54 56 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-218ENST00000525459 PRO0461Q9UI25 63 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-218ENST00000525459 TPRXLQ17RH7 258 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-218ENST00000525459 C1orf195Q5TG92 126 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-218ENST00000525459 Q6ZQT0 140 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-218ENST00000525459 VPS25Q9BRG1 176 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-218ENST00000525459 C14orf132Q9NPU4 83 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-218ENST00000525459 F8W1H4 67 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-218ENST00000525459 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-218ENST00000525459 HMCN2Q8NDA2 5059 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-218ENST00000525459 CDIP1Q9H305 208 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-218ENST00000525459 Q96NJ1 140 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-218ENST00000525459 A0A1B0GV90 55 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-218ENST00000525459 LINC00472Q9H8W2 130 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-218ENST00000525459 ETDBQ3ZM63 59 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-218ENST00000525459 J3KT08 172 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-218ENST00000525459 SIGMAR1Q99720 223 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-218ENST00000525459 IGKV4-1P06312 121 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-218ENST00000525459 NREPQ16612 68 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-218ENST00000525459 LRP2P98164 4655 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-218ENST00000525459 LPAP08519 4548 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-218ENST00000525459 C9orf92A6NGG3 77 aa10.27□□□□□ -0.76
PTPRK-218ENST00000525459 XP32Q5T750 250 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-218ENST00000525459 DEFB116Q30KQ4 102 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-218ENST00000525459 NDUFB1O75438 58 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-218ENST00000525459 UBL5Q9BZL1 73 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-218ENST00000525459 A0A1B0GVX0 72 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-218ENST00000525459 Q6ZVQ6 151 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-218ENST00000525459 A8MWP4 228 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-218ENST00000525459 C8orf87E5RJ46 101 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-218ENST00000525459 LINC00313P59037 77 aa10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms