RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516724.1

RNU6-572P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 572, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-572P, Length 80 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-572P-201ENST00000516724 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-572P-201ENST00000516724 NDUFA4O00483 81 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-572P-201ENST00000516724 ST20Q9HBF5 79 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-572P-201ENST00000516724 HIVEP1P15822 2718 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-572P-201ENST00000516724 CUBNO60494 3623 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-572P-201ENST00000516724 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-572P-201ENST00000516724 RICTORQ6R327 1708 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-572P-201ENST00000516724 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-572P-201ENST00000516724 LYNX1G3V0Z9 82 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-572P-201ENST00000516724 H0YAA0 97 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-572P-201ENST00000516724 ADIRFQ15847 76 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-572P-201ENST00000516724 DEFB121Q5J5C9 76 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-572P-201ENST00000516724 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-572P-201ENST00000516724 TJP1Q07157 1748 aa-0.72□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 HERC1Q15751 4861 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 NREPQ16612 68 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 S100A13Q99584 98 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 MED14O60244 1454 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 HECTD1Q9ULT8 2610 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 A0A087WXM4 84 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 PRLHP81277 87 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 DEFA5Q01523 94 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 EPG5Q9HCE0 2579 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 SMARCA2P51531 1590 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 DNAH6Q9C0G6 4158 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 ZZEF1O43149 2961 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 ABCC1P33527 1531 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 MAP3K1Q13233 1512 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 KDM5DQ9BY66 1539 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 SMIM13P0DJ93 91 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 HTTP42858 3142 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 AKAP9Q99996 3911 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 STARD9Q9P2P6 4700 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 CCDC18Q5T9S5 1454 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 H3BUT2 72 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 DEFB130BP0DP73 79 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 DEFB130AP0DP74 79 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 IAPPP10997 89 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 FAT1Q14517 4588 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-572P-201ENST00000516724 TACC2O95359 2948 aa-0.78□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-0.78□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 CFAP74Q9C0B2 1584 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 DMXL1Q9Y485 3027 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 MT4P47944 62 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 GPR98Q8WXG9 6306 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 DSPP15924 2871 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 ERVK-7P63135 1459 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 HFM1A2PYH4 1435 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 LAMA1P25391 3075 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 NRAPQ86VF7 1730 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 RALGAPBQ86X10 1494 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 S4R3F8 94 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 DNAH3Q8TD57 4116 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 CD163L1Q9NR16 1453 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 UBL5Q9BZL1 73 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-572P-201ENST00000516724 MTORP42345 2549 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-572P-201ENST00000516724 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-572P-201ENST00000516724 DEFB106AQ8N104 65 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-572P-201ENST00000516724 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-572P-201ENST00000516724 NHSQ6T4R5 1651 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-572P-201ENST00000516724 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-572P-201ENST00000516724 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-572P-201ENST00000516724 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-572P-201ENST00000516724 APOBP04114 4563 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-572P-201ENST00000516724 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-572P-201ENST00000516724 ANKARQ7Z5J8 1434 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-572P-201ENST00000516724 UBR4Q5T4S7 5183 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-572P-201ENST00000516724 C18orf32Q8TCD1 76 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-572P-201ENST00000516724 MUC17Q685J3 4493 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-572P-201ENST00000516724 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-572P-201ENST00000516724 HERC2O95714 4834 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-572P-201ENST00000516724 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-572P-201ENST00000516724 LMTK2Q8IWU2 1503 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-572P-201ENST00000516724 ABCA8O94911 1581 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-572P-201ENST00000516724 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-572P-201ENST00000516724 KIF1AQ12756 1690 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-572P-201ENST00000516724 CRIP1P50238 77 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-572P-201ENST00000516724 DEFB110Q30KQ9 67 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-572P-201ENST00000516724 CEP290O15078 2479 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-572P-201ENST00000516724 ACACAQ13085 2346 aa-0.9□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms